Case Report: Novel rare mutation c.6353C > G in the ABCA12 gene causing harlequin ichthyosis identified by whole exome sequencing
Creators
- 1. Hanoi Medical University
- 2. BGI Group (China)
- 3. Vietnam Academy of Science and Technology
- 4. National Hospital of Pediatrics
Description
Harlequin ichthyosis (HI) is a severe rare genetic disease that mainly affects the skin. Neonates with this disease are born with thick skin and large diamond-shaped plates covering most of their bodies. Affected neonates lose the ability to control dehydration and regulate temperature and are more susceptible to infections. They also face respiratory failure and feeding problems. These clinical symptoms are factors associated with high mortality rates of neonates with HI. Until now, there are still no effective treatments for HI patients and most patients die in the newborn period. Mutation in the ABCA12 gene, which encodes an adenosine triphosphate-binding cassette (ABC) transporter, has been demonstrated as the major cause of HI.In this study, we report the case who is one infant that was born prematurely at 32 gestational weeks with the whole body covered with thick plate-like scales of skin. The infant was severely infected with mild edema, multiple cracked skins full of the body, yellow discharge, and necrosis of fingers and toes. The infant was suspected to be affected by HI. Whole exome sequencing (WES) was performed as a tool for detecting the novel mutation in one prematurely born Vietnam infant with HI phenotype. And after that, the mutation was confirmed by the Sanger sequencing method in the patient and the members of his family. In this case, one novel mutation c.6353C > G (p.S2118X, Hom) in the ABCA12 gene, was detected in the patient. The mutation has not been reported in any HI patients previously. This mutation was also found in a heterozygous state in the members of the patient's family, including his parents, an older brother, and an older sister who are no symptoms.In this study, we identified a novel mutation in a Vietnamese patient with HI by whole exome sequencing. The results for the patient and the members of his family will be helpful in understanding the etiology of the disease, diagnosing carriers, assisting in genetic counseling, and emphasizing the need for DNA-based prenatal screening for families with a history of the disease.
Translated Descriptions
Translated Description (Arabic)
السماك المهرجي (HI) هو مرض وراثي نادر شديد يصيب الجلد بشكل أساسي. يولد حديثي الولادة المصابون بهذا المرض بجلد سميك وألواح كبيرة على شكل ماس تغطي معظم أجسامهم. يفقد حديثي الولادة المصابون القدرة على التحكم في الجفاف وتنظيم درجة الحرارة وهم أكثر عرضة للإصابة بالعدوى. كما أنهم يواجهون فشلًا في الجهاز التنفسي ومشاكل في التغذية. هذه الأعراض السريرية هي عوامل مرتبطة بارتفاع معدلات وفيات حديثي الولادة المصابين بالتهاب الكبد الوبائي. حتى الآن، لا توجد حتى الآن علاجات فعالة لمرضى HI ويموت معظم المرضى في فترة حديثي الولادة. ثبت أن الطفرة في جين ABCA12، الذي يشفر ناقل شريط ربط ثلاثي الفوسفات الأدينوزين (ABC)، هي السبب الرئيسي لـ HI. في هذه الدراسة، أبلغنا عن حالة رضيع واحد ولد قبل الأوان في 32 أسبوعًا من الحمل مع تغطية الجسم بأكمله بمقاييس جلدية سميكة تشبه الألواح. أصيب الرضيع بشدة بوذمة خفيفة، وجلود متشققة متعددة ممتلئة بالجسم، وإفرازات صفراء، ونخر في الأصابع وأصابع القدم. كان يشتبه في أن الرضيع متأثر بالمرض. تم إجراء تسلسل إكسوم كامل (WES) كأداة للكشف عن الطفرة الجديدة في رضيع فيتنام المولود قبل الأوان مع النمط الظاهري HI. وبعد ذلك، تم تأكيد الطفرة بطريقة تسلسل سانجر في المريض وأفراد أسرته. في هذه الحالة، تم اكتشاف طفرة جديدة واحدة c.6353C > G (p.S2118X، Hom) في جين ABCA12، في المريض. لم يتم الإبلاغ عن الطفرة في أي من مرضى HI سابقًا. تم العثور على هذه الطفرة أيضًا في حالة متغايرة الزيجوت في أفراد عائلة المريض، بما في ذلك والديه وأخيه الأكبر وأخته الكبرى الذين لا تظهر عليهم أي أعراض. في هذه الدراسة، حددنا طفرة جديدة في مريض فيتنامي يعاني من HI من خلال تسلسل إكسوم كامل. ستكون النتائج للمريض وأفراد أسرته مفيدة في فهم مسببات المرض، وتشخيص الناقلين، والمساعدة في الاستشارة الوراثية، والتأكيد على الحاجة إلى فحص ما قبل الولادة القائم على الحمض النووي للعائلات التي لديها تاريخ من المرض.Translated Description (French)
L'ichtyose arlequine (IH) est une maladie génétique rare sévère qui affecte principalement la peau. Les nouveau-nés atteints de cette maladie naissent avec une peau épaisse et de grandes plaques en forme de losange couvrant la plupart de leur corps. Les nouveau-nés affectés perdent la capacité de contrôler la déshydratation et de réguler la température et sont plus sensibles aux infections. Ils sont également confrontés à une insuffisance respiratoire et à des problèmes d'alimentation. Ces symptômes cliniques sont des facteurs associés à des taux de mortalité élevés chez les nouveau-nés atteints d'IH. Jusqu'à présent, il n'existe toujours pas de traitement efficace pour les patients atteints d'IH et la plupart des patients meurent au cours de la période néonatale. La mutation du gène ABCA12, qui code pour un transporteur de cassette de liaison à l'adénosine triphosphate (ABC), a été démontrée comme la principale cause de HI.Dans cette étude, nous rapportons le cas d'un nourrisson né prématurément à 32 semaines de gestation, le corps entier étant recouvert d'épaisses écailles de peau en forme de plaque. Le nourrisson était gravement infecté par un œdème léger, de multiples peaux craquelées pleines du corps, des écoulements jaunes et une nécrose des doigts et des orteils. Le nourrisson était suspecté d'être atteint d'IH. Le séquençage de l'exome entier (WES) a été effectué comme un outil pour détecter la nouvelle mutation chez un nourrisson vietnamien prématuré avec un phénotype HI. Et après cela, la mutation a été confirmée par la méthode de séquençage de Sanger chez le patient et les membres de sa famille. Dans ce cas, une nouvelle mutation c.6353C > G (p.S2118X, Hom) dans le gène ABCA12, a été détectée chez le patient. La mutation n'a pas été rapportée chez aucun patient IH auparavant. Cette mutation a également été trouvée dans un état hétérozygote chez les membres de la famille du patient, y compris ses parents, un frère aîné et une sœur aînée qui ne présentent aucun symptôme. Dans cette étude, nous avons identifié une nouvelle mutation chez un patient vietnamien atteint d'IH par séquençage de l'exome entier. Les résultats pour le patient et les membres de sa famille seront utiles pour comprendre l'étiologie de la maladie, diagnostiquer les porteurs, aider au conseil génétique et souligner la nécessité d'un dépistage prénatal basé sur l'ADN pour les familles ayant des antécédents de la maladie.Translated Description (Spanish)
La ictiosis arlequín (IH) es una enfermedad genética rara y grave que afecta principalmente a la piel. Los recién nacidos con esta enfermedad nacen con piel gruesa y grandes placas en forma de diamante que cubren la mayor parte de su cuerpo. Los recién nacidos afectados pierden la capacidad de controlar la deshidratación y regular la temperatura y son más susceptibles a las infecciones. También se enfrentan a insuficiencia respiratoria y problemas de alimentación. Estos síntomas clínicos son factores asociados con altas tasas de mortalidad de los recién nacidos con IH. Hasta ahora, todavía no existen tratamientos efectivos para los pacientes con HI y la mayoría de los pacientes mueren en el período neonatal. La mutación en el gen ABCA12, que codifica un transportador de casete de unión a trifosfato de adenosina (ABC), se ha demostrado como la causa principal de HI. En este estudio, informamos el caso de un bebé que nació prematuramente a las 32 semanas de gestación con todo el cuerpo cubierto con escamas de piel gruesas en forma de placa. El bebé estaba gravemente infectado con edema leve, múltiples pieles agrietadas llenas de cuerpo, secreción amarilla y necrosis de dedos de manos y pies. Se sospechaba que el bebé estaba afectado por HI. La secuenciación del exoma completo (WES) se realizó como una herramienta para detectar la nueva mutación en un bebé nacido prematuramente en Vietnam con fenotipo HI. Y después de eso, la mutación fue confirmada por el método de secuenciación de Sanger en el paciente y los miembros de su familia. En este caso, se detectó en el paciente una nueva mutación c.6353C > G (p.S2118X, Hom) en el gen ABCA12. La mutación no se ha informado en ningún paciente con HI anteriormente. Esta mutación también se encontró en un estado heterocigoto en los miembros de la familia del paciente, incluidos sus padres, un hermano mayor y una hermana mayor que no presentan síntomas. En este estudio, identificamos una mutación novedosa en un paciente vietnamita con HI mediante la secuenciación del exoma completo. Los resultados para el paciente y los miembros de su familia serán útiles para comprender la etiología de la enfermedad, diagnosticar a los portadores, ayudar en el asesoramiento genético y enfatizar la necesidad de un cribado prenatal basado en el ADN para las familias con antecedentes de la enfermedad.Files
      
        pdf.pdf
        
      
    
    
      
        Files
         (6.4 MB)
        
      
    
    | Name | Size | Download all | 
|---|---|---|
| md5:fae539184d4f0983c4a9caab9e5bae80 | 6.4 MB | Preview Download | 
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- تقرير حالة: طفرة نادرة جديدة c.6353C > G في جين ABCA12 تسبب سماك المهرج الذي تم تحديده من خلال تسلسل إكسوم كامل
- Translated title (French)
- Rapport de cas : Nouvelle mutation rare c.6353C > G dans le gène ABCA12 causant l'ichtyose de l'arlequin identifiée par séquençage de l'exome entier
- Translated title (Spanish)
- Reporte de caso: Nueva mutación rara c.6353C > G en el gen ABCA12 que causa ictiosis de arlequín identificada por la secuenciación del exoma completo
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4320917659
- DOI
- 10.3389/fped.2023.1128716
            
              References
            
          
        - https://openalex.org/W1810589843
- https://openalex.org/W1919257374
- https://openalex.org/W1973844845
- https://openalex.org/W1979250096
- https://openalex.org/W2000517600
- https://openalex.org/W2000671905
- https://openalex.org/W2002643645
- https://openalex.org/W2003679599
- https://openalex.org/W2003808969
- https://openalex.org/W2018241111
- https://openalex.org/W2019626143
- https://openalex.org/W2022198761
- https://openalex.org/W2045954756
- https://openalex.org/W2064350657
- https://openalex.org/W2069946973
- https://openalex.org/W2078661419
- https://openalex.org/W2084163313
- https://openalex.org/W2086527897
- https://openalex.org/W2088600050
- https://openalex.org/W2092843954
- https://openalex.org/W2103441770
- https://openalex.org/W2106019883
- https://openalex.org/W2119155691
- https://openalex.org/W2125933085
- https://openalex.org/W2127306407
- https://openalex.org/W2127331850
- https://openalex.org/W2140744545
- https://openalex.org/W2141691234
- https://openalex.org/W2145541280
- https://openalex.org/W2148121263
- https://openalex.org/W2158531928
- https://openalex.org/W2465762225
- https://openalex.org/W2501106128
- https://openalex.org/W2691100149
- https://openalex.org/W2789600292
- https://openalex.org/W3119362159