Published December 1, 2014 | Version v1
Publication Open

The EPIYA-ABCC motif pattern in CagA of Helicobacter pyloriis associated with peptic ulcer and gastric cancer in Mexican population

Creators

  • 1. Autonomous University of Guerrero
  • 2. Instituto Nacional de Salud Pública

Description

Helicobacter pylori chronic infection is associated with chronic gastritis, peptic ulcer, and gastric cancer. Cytotoxin-associated gene A (cagA)-positive H. pylori strains increase the risk of gastric pathology. The carcinogenic potential of CagA is linked to its polymorphic EPIYA motif variants. The goals of this study were to investigate the frequency of cagA-positive Helicobacter pylori in Mexican patients with gastric pathologies and to assess the association of cagA EPIYA motif patterns with peptic ulcer and gastric cancer. A total of 499 patients were studied; of these, 402 had chronic gastritis, 77 had peptic ulcer, and 20 had gastric cancer. H. pylori DNA, cagA, and the EPIYA motifs were detected in total DNA from gastric biopsies by PCR. The type and number of EPIYA segments were determined by the electrophoretic patterns. To confirm the PCR results, 20 amplicons of the cagA 3′ variable region were sequenced, and analyzed in silico, and the amino acid sequence was predicted with MEGA software, version 5. The odds ratio (OR) was calculated to determine the associations between the EPIYA motif type and gastric pathology and between the number of EPIYA-C segments and peptic ulcers and gastric cancer. H. pylori DNA was found in 287 (57.5%) of the 499 patients, and 214 (74%) of these patients were cagA-positive. The frequency of cagA-positive H. pylori was 74.6% (164/220) in chronic gastritis patients, 73.6% (39/53) in peptic ulcer patients, and 78.6% (11/14) in gastric cancer patients. The EPIYA-ABC pattern was more frequently observed in chronic gastritis patients (79.3%, 130/164), while the EPIYA-ABCC sequence was more frequently observed in peptic ulcer (64.1%, 25/39) and gastric cancer patients (54.5%, 6/11). However, the risks of peptic ulcer (OR = 7.0, 95% CI = 3.3–15.1; p < 0.001) and gastric cancer (OR = 5.9, 95% CI = 1.5–22.1) were significantly increased in individuals who harbored the EPIYA-ABCC cagA gene pattern. cagA-positive H. pylori is highly prevalent in southern Mexico, and all CagA variants were of the western type. The cagA alleles that code for EPIYA-ABCC motif patterns are associated with peptic ulcers and gastric cancer.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

ترتبط عدوى الملوية البوابية المزمنة بالتهاب المعدة المزمن والقرحة الهضمية وسرطان المعدة. تزيد سلالات الملوية البوابية من الجين A (cagA) المرتبط بالسموم الخلوية من خطر الإصابة بأمراض المعدة. ترتبط إمكانات CagA المسببة للسرطان بمتغيرات الزخارف EPIYA متعددة الأشكال. كانت أهداف هذه الدراسة هي التحقيق في تواتر الإصابة بالملوية البوابية الموجبة لـ cagA في المرضى المكسيكيين الذين يعانون من أمراض المعدة وتقييم ارتباط أنماط CagA EPIYA MOIF مع القرحة الهضمية وسرطان المعدة. تمت دراسة ما مجموعه 499 مريضًا ؛ من بينهم 402 مصابًا بالتهاب المعدة المزمن، و 77 مصابًا بالقرحة الهضمية، و 20 مصابًا بسرطان المعدة. تم الكشف عن الحمض النووي للملوية البوابية، و cagA، وزخارف EPIYA في الحمض النووي الكلي من خزعات المعدة عن طريق PCR. تم تحديد نوع وعدد شرائح EPIYA من خلال أنماط الرحلان الكهربائي. لتأكيد نتائج تفاعل البوليميراز المتسلسل، تم تسلسل 20 أمبيلكون من المنطقة المتغيرة cagA 3′، وتحليلها في السيليكو، وتم التنبؤ بتسلسل الأحماض الأمينية باستخدام برنامج MEGA، الإصدار 5. تم حساب نسبة الاحتمالات (OR) لتحديد الارتباطات بين نوع عزر EPIYA وأمراض المعدة وبين عدد مقاطع EPIYA - C والقرحة الهضمية وسرطان المعدة. تم العثور على الحمض النووي للبكتيريا الملوية البوابية في 287 (57.5 ٪) من أصل 499 مريضًا، وكان 214 (74 ٪) من هؤلاء المرضى مصابين بالـ cagA. كان تواتر الإصابة بالملوية البوابية إيجابية التخدير 74.6 ٪ (164/220) في مرضى التهاب المعدة المزمن، و 73.6 ٪ (39/53) في مرضى القرحة الهضمية، و 78.6 ٪ (11/14) في مرضى سرطان المعدة. لوحظ نمط EPIYA - ABC بشكل متكرر في مرضى التهاب المعدة المزمن (79.3 ٪، 130/164)، في حين لوحظ تسلسل EPIYA - ABCC بشكل متكرر في القرحة الهضمية (64.1 ٪، 25/39) ومرضى سرطان المعدة (54.5 ٪، 6/11). ومع ذلك، زادت مخاطر القرحة الهضمية (OR = 7.0، 95 ٪ CI = 3.3-15.1 ؛ p < 0.001) وسرطان المعدة (OR = 5.9، 95 ٪ CI = 1.5–22.1) بشكل كبير في الأفراد الذين لديهم نمط جين EPIYA - ABCC cagA. cagA - positive H. pylori منتشر بشكل كبير في جنوب المكسيك، وكانت جميع متغيرات CagA من النوع الغربي. ترتبط أليلات cagA التي ترمز لأنماط الزخارف EPIYA - ABCC بالقرحة الهضمية وسرطان المعدة.

Translated Description (French)

L'infection chronique à Helicobacter pylori est associée à la gastrite chronique, à l'ulcère gastroduodénal et au cancer gastrique. Les souches H. pylori positives au gène A associé aux cytotoxines (cagA) augmentent le risque de pathologie gastrique. Le potentiel cancérogène de la CagA est lié à ses variantes polymorphes du motif EPIYA. Les objectifs de cette étude étaient d'étudier la fréquence des Helicobacter pylori cagA-positifs chez les patients mexicains atteints de pathologies gastriques et d'évaluer l'association des motifs cagA EPIYA avec l'ulcère gastroduodénal et le cancer gastrique. Au total, 499 patients ont été étudiés ; parmi ceux-ci, 402 avaient une gastrite chronique, 77 avaient un ulcère gastroduodénal et 20 avaient un cancer gastrique. L'ADN de H. pylori, cagA et les motifs EPIYA ont été détectés dans l'ADN total à partir de biopsies gastriques par PCR. Le type et le nombre de segments EPIYA ont été déterminés par les motifs électrophorétiques. Pour confirmer les résultats de la PCR, 20 amplicons de la région variable cagA 3′ ont été séquencés et analysés in silico, et la séquence d'acides aminés a été prédite avec le logiciel MEGA, version 5. Le odds ratio (OR) a été calculé pour déterminer les associations entre le type de motif EPIYA et la pathologie gastrique et entre le nombre de segments EPIYA-C et les ulcères peptiques et le cancer gastrique. L'ADN de H. pylori a été trouvé chez 287 (57,5 %) des 499 patients, et 214 (74 %) de ces patients étaient cagA-positifs. La fréquence de H. pylori cagA-positif était de 74,6 % (164/220) chez les patients atteints de gastrite chronique, de 73,6 % (39/53) chez les patients atteints d'ulcère gastroduodénal et de 78,6 % (11/14) chez les patients atteints de cancer gastrique. Le schéma EPIYA-ABC a été plus fréquemment observé chez les patients atteints de gastrite chronique (79,3 %, 130/164), tandis que la séquence EPIYA-ABCC a été plus fréquemment observée chez les patients atteints d'ulcère gastroduodénal (64,1 %, 25/39) et de cancer gastrique (54,5 %, 6/11). Cependant, les risques d'ulcère gastro-duodénal (OR = 7,0, IC à 95 % = 3,3-15,1 ; p < 0,001) et de cancer gastrique (OR = 5,9, IC à 95 % = 1,5-22,1) étaient significativement augmentés chez les personnes qui portaient le gène cagA EPIYA-ABCC. H. pylori cagA-positif est très répandu dans le sud du Mexique, et tous les variants de CagA étaient de type occidental. Les allèles cagA qui codent pour les motifs EPIYA-ABCC sont associés aux ulcères peptiques et au cancer gastrique.

Translated Description (Spanish)

La infección crónica por Helicobacter pylori se asocia con gastritis crónica, úlcera péptica y cáncer gástrico. Las cepas de H. pylori positivas para el gen A asociado a citotoxinas (cagA) aumentan el riesgo de patología gástrica. El potencial carcinogénico de CagA está vinculado a sus variantes polimórficas del motivo EPIYA. Los objetivos de este estudio fueron investigar la frecuencia de Helicobacter pylori cagA-positivo en pacientes mexicanos con patologías gástricas y evaluar la asociación de los patrones del motivo cagA EPIYA con la úlcera péptica y el cáncer gástrico. Se estudiaron un total de 499 pacientes; de estos, 402 tenían gastritis crónica, 77 tenían úlcera péptica y 20 tenían cáncer gástrico. El ADN de H. pylori, cagA y los motivos EPIYA se detectaron en el ADN total de las biopsias gástricas mediante PCR. El tipo y el número de segmentos de EPIYA se determinaron mediante los patrones electroforéticos. Para confirmar los resultados de la PCR, se secuenciaron 20 amplicones de la región variable cagA 3'y se analizaron in silico, y se predijo la secuencia de aminoácidos con el software MEGA, versión 5. El odds ratio (OR) se calculó para determinar las asociaciones entre el tipo de motivo EPIYA y la patología gástrica y entre el número de segmentos EPIYA-C y las úlceras pépticas y el cáncer gástrico. Se encontró ADN de H. pylori en 287 (57.5%) de los 499 pacientes, y 214 (74%) de estos pacientes eran cagA positivos. La frecuencia de H. pylori cagA-positivo fue del 74,6% (164/220) en pacientes con gastritis crónica, del 73,6% (39/53) en pacientes con úlcera péptica y del 78,6% (11/14) en pacientes con cáncer gástrico. El patrón EPIYA-ABC se observó con mayor frecuencia en pacientes con gastritis crónica (79,3%, 130/164), mientras que la secuencia EPIYA-ABCC se observó con mayor frecuencia en pacientes con úlcera péptica (64,1%, 25/39) y cáncer gástrico (54,5%, 6/11). Sin embargo, los riesgos de úlcera péptica (OR = 7.0, IC 95% = 3.3-15.1; p < 0.001) y cáncer gástrico (OR = 5.9, IC 95% = 1.5-22.1) aumentaron significativamente en individuos que albergaban el patrón del gen EPIYA-ABCC cagA. H. pylori cagA-positivo es altamente prevalente en el sur de México, y todas las variantes de CagA fueron del tipo occidental. Los alelos cagA que codifican los patrones de motivo EPIYA-ABCC están asociados con úlceras pépticas y cáncer gástrico.

Files

s12876-014-0223-9.pdf

Files (2.2 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:d988c29147d0afe668d0b333c774626a
2.2 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
نمط الزخرفة EPIYA - ABCC في CagA للبكتيريا البوابية المرتبطة بالقرحة الهضمية وسرطان المعدة لدى السكان المكسيكيين
Translated title (French)
Le motif EPIYA-ABCC dans CagA d'Helicobacter pyloriis associé à l'ulcère gastroduodénal et au cancer gastrique dans la population mexicaine
Translated title (Spanish)
El patrón de motivo EPIYA-ABCC en CagA de Helicobacter pyloriis asociado a úlcera péptica y cáncer gástrico en población mexicana

Identifiers

Other
https://openalex.org/W1978102284
DOI
10.1186/s12876-014-0223-9

Is supplement to
https://openalex.org/W4283592932 (Other)
https://openalex.org/W2999604599 (Other)
https://openalex.org/W2791954119 (Other)
https://openalex.org/W2405185490 (Other)
https://openalex.org/W2356456553 (Other)
https://openalex.org/W2322652303 (Other)
https://openalex.org/W224634855 (Other)
https://openalex.org/W2079672527 (Other)
https://openalex.org/W2076581678 (Other)
https://openalex.org/W1998385234 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Mexico

References

  • https://openalex.org/W107439708
  • https://openalex.org/W1483774738
  • https://openalex.org/W1511963303
  • https://openalex.org/W1567562976
  • https://openalex.org/W1919607772
  • https://openalex.org/W1966941264
  • https://openalex.org/W1971844822
  • https://openalex.org/W1974893818
  • https://openalex.org/W1975191708
  • https://openalex.org/W1987343486
  • https://openalex.org/W1988228353
  • https://openalex.org/W2000775989
  • https://openalex.org/W2003186747
  • https://openalex.org/W2003793999
  • https://openalex.org/W2008247147
  • https://openalex.org/W2010419478
  • https://openalex.org/W2011543054
  • https://openalex.org/W2012898696
  • https://openalex.org/W2017363882
  • https://openalex.org/W2018087951
  • https://openalex.org/W2020915932
  • https://openalex.org/W2020992229
  • https://openalex.org/W2024946285
  • https://openalex.org/W2030164692
  • https://openalex.org/W2042691659
  • https://openalex.org/W2055667899
  • https://openalex.org/W2055832413
  • https://openalex.org/W2063017272
  • https://openalex.org/W2063385326
  • https://openalex.org/W2079130007
  • https://openalex.org/W2080179829
  • https://openalex.org/W2081977742
  • https://openalex.org/W2085350953
  • https://openalex.org/W2087542468
  • https://openalex.org/W2090681869
  • https://openalex.org/W2100595726
  • https://openalex.org/W2101366809
  • https://openalex.org/W2112535664
  • https://openalex.org/W2117111862
  • https://openalex.org/W2119606365
  • https://openalex.org/W2122933597
  • https://openalex.org/W2125211517
  • https://openalex.org/W2130595921
  • https://openalex.org/W2132632499
  • https://openalex.org/W2133343738
  • https://openalex.org/W2133883864
  • https://openalex.org/W2135258395
  • https://openalex.org/W2142059693
  • https://openalex.org/W2146412674
  • https://openalex.org/W2147579496
  • https://openalex.org/W2148389477
  • https://openalex.org/W2151410525
  • https://openalex.org/W2152462561
  • https://openalex.org/W2155187795
  • https://openalex.org/W2155346587
  • https://openalex.org/W4248856047
  • https://openalex.org/W4366444856
  • https://openalex.org/W4376453460