Published August 27, 2022
| Version v1
Publication
Open
Comparing Rapid Ag Test and PCR in SARS-CoV-2 Management in Rural Egypt
Creators
- 1. Czech Academy of Sciences, Institute of Microbiology
Description
Like elsewhere around the globe, SARS-CoV-2 infection is spreading in rural Egypt. Due to high sensitivity and specificity, the gold standard of diagnostics is reverse transcription polymerase chain reaction PCR (RT-PCR). Rural areas without access to certified laboratories cannot take advantage of RT-PCR testing, and thus are dependent upon rapid antigen testing, a point-of-care test that requires less training and can produce results within 15 minutes. Rapid antigen testing can give an advantage to medical teams in rural settings by affording effective and early control of SARS-CoV-2 infection spread. We sought to assess the contribution of different COVID-19 testing procedures in rural Egypt. We conducted a prospective cohort study in a rural lab in Giza, Egypt. Approximately 223 individuals with potential SARS-CoV-2 infection were involved in the study during the pandemic peak in Giza, Egypt, from March 4 – May 30, 2021. Subjects were subjected to RT-PCR and rapid antigen testing, and the performance of each testing procedure was compared. Between March 4 – May 30, 2021, approximately 223 symptomatic individuals were included in this study. 190 patients (85.2%) were indicated as PCR positive for SARS-CoV-2, while 33 (14.8%) were PCR negative. In comparison, a rapid antigen test showed 178 out of 223 patients (79.8%) were indicated as positive, or 94% of the PCR-positive individuals. In Giza, a rural area of Egypt, RT-PCR had an optimal balance of sensitivity and specificity, however, the turnaround time was a limiting factor. Antigen testing, performed as a rapid point-of-care test, can play an effective role in rural outbreak control due to its ease of use and rapid results.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
كما هو الحال في أي مكان آخر في جميع أنحاء العالم، تنتشر عدوى سارس- كوف-2 في المناطق الريفية في مصر. نظرًا للحساسية العالية والخصوصية، فإن المعيار الذهبي للتشخيص هو تفاعل البوليميراز المتسلسل للنسخ العكسي (RT - PCR). لا يمكن للمناطق الريفية التي لا يمكنها الوصول إلى المختبرات المعتمدة الاستفادة من اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل RT - PCR، وبالتالي فهي تعتمد على اختبار المستضد السريع، وهو اختبار في نقطة الرعاية يتطلب تدريبًا أقل ويمكن أن يؤدي إلى نتائج في غضون 15 دقيقة. يمكن أن يعطي اختبار المستضد السريع ميزة للفرق الطبية في المناطق الريفية من خلال توفير السيطرة الفعالة والمبكرة على انتشار عدوى فيروس كورونا 2 المرتبط بمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة. سعينا إلى تقييم مساهمة إجراءات اختبار كوفيد-19 المختلفة في المناطق الريفية في مصر. أجرينا دراسة جماعية مستقبلية في مختبر ريفي في الجيزة، مصر. شارك ما يقرب من 223 فردًا يعانون من عدوى محتملة بفيروس كورونا 2 المرتبط بمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة في الدراسة خلال ذروة الوباء في الجيزة، مصر، في الفترة من 4 مارس إلى 30 مايو 2021. تم إخضاع الخاضعين لاختبار RT - PCR واختبار المستضد السريع، وتمت مقارنة أداء كل إجراء اختبار. بين 4 مارس – 30 مايو 2021، تم تضمين ما يقرب من 223 فردًا يعانون من أعراض في هذه الدراسة. تم الإشارة إلى 190 مريضًا (85.2 ٪) على أنهم إيجابيون في تفاعل البوليميراز المتسلسل لفيروس كورونا 2 المرتبط بمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة، بينما كان 33 مريضًا (14.8 ٪) سلبيون في تفاعل البوليميراز المتسلسل. وبالمقارنة، أظهر اختبار مستضد سريع أن 178 من أصل 223 مريضًا (79.8 ٪) تمت الإشارة إليهم على أنهم إيجابيون، أو 94 ٪ من الأفراد الذين لديهم تفاعل البوليميراز المتسلسل. في الجيزة، وهي منطقة ريفية في مصر، كان لدى RT - PCR توازن مثالي بين الحساسية والخصوصية، ومع ذلك، كان وقت التسليم عاملاً مقيدًا. يمكن أن يلعب اختبار المستضد، الذي يتم إجراؤه كاختبار سريع لنقطة الرعاية، دورًا فعالًا في مكافحة تفشي المرض في المناطق الريفية نظرًا لسهولة استخدامه ونتائجه السريعة.Translated Description (French)
Comme ailleurs dans le monde, l'infection par le SRAS-CoV-2 se propage dans les zones rurales de l'Égypte. En raison de sa sensibilité et de sa spécificité élevées, l'étalon-or du diagnostic est la PCR par amplification en chaîne par polymérase avec transcription inverse (RT-PCR). Les zones rurales sans accès à des laboratoires certifiés ne peuvent pas profiter des tests de RT-PCR, et dépendent donc d'un test antigénique rapide, un test sur place qui nécessite moins de formation et peut produire des résultats en 15 minutes. Un test antigénique rapide peut donner un avantage aux équipes médicales en milieu rural en permettant un contrôle efficace et précoce de la propagation de l'infection par le SRAS-CoV-2. Nous avons cherché à évaluer la contribution des différentes procédures de dépistage de la COVID-19 dans les zones rurales d'Égypte. Nous avons mené une étude de cohorte prospective dans un laboratoire rural à Gizeh, en Égypte. Environ 223 personnes potentiellement infectées par le SRAS-CoV-2 ont participé à l'étude pendant le pic de la pandémie à Gizeh, en Égypte, du 4 mars au 30 mai 2021. Les sujets ont été soumis à une RT-PCR et à un test antigénique rapide, et les performances de chaque procédure de test ont été comparées. Entre le 4 mars et le 30 mai 2021, environ 223 personnes symptomatiques ont été incluses dans cette étude. 190 patients (85,2 %) ont été indiqués comme positifs à la PCR pour le SRAS-CoV-2, tandis que 33 (14,8 %) étaient négatifs à la PCR. En comparaison, un test antigénique rapide a montré que 178 patients sur 223 (79,8 %) étaient indiqués comme positifs, soit 94 % des individus positifs pour la PCR. À Gizeh, une zone rurale d'Égypte, la RT-PCR présentait un équilibre optimal entre sensibilité et spécificité, mais le délai d'exécution était un facteur limitant. Le test antigénique, effectué en tant que test rapide au point de service, peut jouer un rôle efficace dans la lutte contre les épidémies rurales en raison de sa facilité d'utilisation et de ses résultats rapides.Translated Description (Spanish)
Al igual que en otras partes del mundo, la infección por SARS-CoV-2 se está propagando en las zonas rurales de Egipto. Debido a la alta sensibilidad y especificidad, el estándar de oro de los diagnósticos es la PCR de reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa (RT-PCR). Las zonas rurales sin acceso a laboratorios certificados no pueden aprovechar las pruebas de RT-PCR y, por lo tanto, dependen de las pruebas rápidas de antígenos, una prueba en el punto de atención que requiere menos capacitación y puede producir resultados en 15 minutos. Las pruebas rápidas de antígenos pueden dar una ventaja a los equipos médicos en entornos rurales al permitir un control efectivo y temprano de la propagación de la infección por SARS-CoV-2. Buscamos evaluar la contribución de los diferentes procedimientos de prueba de COVID-19 en el Egipto rural. Realizamos un estudio de cohorte prospectivo en un laboratorio rural en Giza, Egipto. Aproximadamente 223 personas con posible infección por SARS-CoV-2 participaron en el estudio durante el pico de la pandemia en Giza, Egipto, del 4 de marzo al 30 de mayo de 2021. Los sujetos se sometieron a RT-PCR y pruebas rápidas de antígenos, y se comparó el rendimiento de cada procedimiento de prueba. Entre el 4 de marzo y el 30 de mayo de 2021, se incluyeron aproximadamente 223 individuos sintomáticos en este estudio. 190 pacientes (85.2%) se indicaron como PCR positivos para SARS-CoV-2, mientras que 33 (14.8%) fueron PCR negativos. En comparación, una prueba rápida de antígenos mostró que 178 de 223 pacientes (79.8%) se indicaron como positivos, o el 94% de los individuos positivos para PCR. En Giza, una zona rural de Egipto, la RT-PCR tuvo un equilibrio óptimo de sensibilidad y especificidad, sin embargo, el tiempo de respuesta fue un factor limitante. Las pruebas de antígenos, realizadas como una prueba rápida en el punto de atención, pueden desempeñar un papel eficaz en el control de brotes rurales debido a su facilidad de uso y resultados rápidos.Files
Files
(15.7 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:bf88a8cac900ad2b1ccca2c64bb36ee9
|
15.7 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- مقارنة اختبار Ag السريع و PCR في إدارة SARS - CoV -2 في المناطق الريفية في مصر
- Translated title (French)
- Comparaison du test Ag rapide et de la PCR dans la prise en charge du SRAS-CoV-2 en Égypte rurale
- Translated title (Spanish)
- Comparación de la prueba rápida de Ag y la PCR en el manejo del SARS-CoV-2 en el Egipto rural
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W4293364200
- DOI
- 10.22207/jpam.16.3.67
References
- https://openalex.org/W3001118548
- https://openalex.org/W3004348779
- https://openalex.org/W3005363896
- https://openalex.org/W3006110666
- https://openalex.org/W3006856666
- https://openalex.org/W3009799538
- https://openalex.org/W3010344953
- https://openalex.org/W3010667412
- https://openalex.org/W3013893137
- https://openalex.org/W3014051579
- https://openalex.org/W3016370968
- https://openalex.org/W3020512604
- https://openalex.org/W3023787531
- https://openalex.org/W3026059552
- https://openalex.org/W3081491793
- https://openalex.org/W3081517366
- https://openalex.org/W3089650798
- https://openalex.org/W3095280648
- https://openalex.org/W3104395671
- https://openalex.org/W3121008815
- https://openalex.org/W3136342714
- https://openalex.org/W3168905966
- https://openalex.org/W3187951587
- https://openalex.org/W3200992310
- https://openalex.org/W3202566860
- https://openalex.org/W4225131924
- https://openalex.org/W4284965281