Published March 13, 2018 | Version v1
Publication Open

MicroRNA Signatures for circulating CD133-positive cells in hepatocellular carcinoma with HCV infection

Creators

  • 1. Cairo University
  • 2. Beni-Suef University
  • 3. Helwan University
  • 4. Ain Shams University

Description

Aim Molecular characterization of the CD133+ stem cells associated with hepatocarinogensis through identifying the expression patterns of specific microRNAs (miRNAs). Methods We investigated the expression pattern of 13 miRNAs in purified CD133+ cells separated from the peripheral blood of healthy volunteers, chronic hepatitis C (CHC), liver cirrhosis (LC) and hepatocellular carcinoma (HCC) patients a long with bone marrow samples from the healthy volunteers and the LC patients using custom miScript miRNA PCR array. Results The differential expression of the 13 studied miRNAs in CD133+ cells separated from the HCC patients' peripheral blood compared to the controls revealed that miR-602, miR-181b, miR-101, miR-122, miR-192, miR-125a-5p, and miR-221 were significantly up regulated (fold change = 1.8, 1.7, 2, 5.4, 1.6, 2.9 & 1.5 P value = 0.039, 0.0019, 0.0013, 0.0370, 00024, 0.000044 &0.000007 respectively). As for the HCC group compared to the CHC group; miR-602, miR-122, miR-181b, miR-125a-5p, and miR-192 were significantly up regulated (fold change = 13, 3.1, 2.8, 1.6 & 1.56, P value = 0.01, 0.001, 0.000004, 0.002 & 0.007 respectively). Upon comparing the HCC group to the LC group; miR-199a-3p, miR-192, miR-122, miR-181b, miR-224, miR-125a-5p, and miR-885-5p were significantly up regulated (fold change = 5, 6.7, 2.3, 3, 2.5, 4.2 & 39.5 P value = 0.001025, 0.000024, 0.000472, 0.000278, 0.000004, 0.000075 & 0.0000001 respectively) whereas miR-22 was significantly down regulated (fold change = 0.57 P value = 0.00002). Only, miR-192, miR-122, miR-181b and miR-125a-5p were significant common miRNAs in CD133+ cells of the HCC group compared to the other non-malignant groups. Conclusion We identified a miRNA panel comprised of four miRNAs (miR-192, miR-122, miR-181b and miR-125a-5p) that may serve as a molecular tool for characterization of the CD133+ cells associated with different stages of hepatocarinogensis. This panel may aid in developing a new target therapy specific for those CD133+ cells.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

يهدف إلى التوصيف الجزيئي للخلايا الجذعية CD133+ المرتبطة بتكوين الكارينات الكبدية من خلال تحديد أنماط التعبير عن الحمض النووي الريبي الدقيق المحدد (miRNAs). الطرق لقد درسنا نمط التعبير عن 13 miRNAs في خلايا CD133+ المنقاة المنفصلة عن الدم المحيطي للمتطوعين الأصحاء، والتهاب الكبد المزمن C (CHC)، وتليف الكبد (LC)، ومرضى سرطان الخلايا الكبدية (HCC) لفترة طويلة مع عينات نخاع العظام من المتطوعين الأصحاء ومرضى LC باستخدام مصفوفة miScript miRNA PCR المخصصة. النتائج كشف التعبير التفاضلي لـ 13 miRNAs التي تمت دراستها في خلايا CD133 + المنفصلة عن الدم المحيطي لمرضى HCC مقارنة بعناصر التحكم أن قيمة miR -602 و miR -181b و miR -101 و miR -122 و miR -192 و miR -125a -5p و miR -221 كانت منظمة بشكل كبير (تغير الطي = 1.8 و 1.7 و 2 و 5.4 و 1.6 و 2.9 و 1.5 P = 0.039 و 0.0019 و 0.0013 و 0.0370 و 00024 و 0.000044 و0.000007 على التوالي). أما بالنسبة لمجموعة HCC مقارنة بمجموعة CHC ؛ فقد تم تنظيم miR -602 و miR -122 و miR -181b و miR -125a -5p و miR -192 بشكل كبير (تغيير الطية = 13 و 3.1 و 2.8 و 1.6 و 1.56 و P = 0.01 و 0.001 و 0.000004 و 0.002 و 0.007 على التوالي). عند مقارنة مجموعة HCC بمجموعة LC ؛ تم تنظيم miR -199a -3p و miR -192 و miR -122 و miR -181b و miR -224 و miR -125a -5p و miR -885-5p بشكل كبير (تغيير الطي = 5 و 6.7 و 2.3 و 3 و 2.5 و 4.2 و 39.5 قيمة P = 0.001025 و 0.000024 و 0.000472 و 0.000278 و 0.000004 و 0.000075 و 0.0000001 على التوالي) في حين تم تنظيم miR -22 بشكل كبير (تغيير الطي = 0.57 قيمة P = 0.00002). فقط، miR -192 و miR -122 و miR -181b و miR -125a -5p كانت miRNAs مشتركة كبيرة في خلايا CD133 + من مجموعة HCC مقارنة بالمجموعات الأخرى غير الخبيثة. الاستنتاج حددنا لوحة miRNA تتكون من أربعة miRNAs (miR -192 و miR -122 و miR -181b و miR -125a -5p) والتي قد تكون بمثابة أداة جزيئية لتوصيف خلايا CD133+ المرتبطة بمراحل مختلفة من تكوين الكارينات الكبدية. قد تساعد هذه اللوحة في تطوير علاج مستهدف جديد محدد لتلك الخلاياCD133 +.

Translated Description (French)

AIM Caractérisation moléculaire des cellules souches CD133+ associées à l'hépatocarinogénèse en identifiant les modèles d'expression de microARN spécifiques (miARN). Méthodes Nous avons étudié le modèle d'expression de 13 miARN dans des cellules CD133+ purifiées séparées du sang périphérique de volontaires sains, de patients atteints d'hépatite C chronique (CHC), de cirrhose du foie (LC) et de carcinome hépatocellulaire (CHC) un long avec des échantillons de moelle osseuse provenant de volontaires sains et de patients LC en utilisant un réseau personnalisé de miARN PCR miScript. Résultats L'expression différentielle des 13 miARN étudiés dans les cellules CD133+ séparées du sang périphérique des patients atteints de CHC par rapport aux témoins a révélé que les valeurs de miR-602, miR-181b, miR-101, miR-122, miR-192, miR-125a-5p et miR-221 étaient significativement régulées à la hausse (changement de pli = 1,8, 1,7, 2, 5,4, 1,6, 2,9 et 1,5 P = 0,039, 0,0019, 0,0013, 0,0370, 00024, 0,000044 et0,000007 respectivement). En ce qui concerne le groupe HCC par rapport au groupe CHC ; miR-602, miR-122, miR-181b, miR-125a-5p et miR-192 étaient significativement régulés à la hausse (changement de pli = 13, 3,1, 2,8, 1,6 et 1,56, valeur P = 0,01, 0,001, 0,000004, 0,002 et 0,007 respectivement). En comparant le groupe HCC au groupe LC ; miR-199a-3p, miR-192, miR-122, miR-181b, miR-224, miR-125a-5p et miR-885-5p étaient significativement régulés à la hausse (changement de pli = 5, 6.7, 2.3, 3, 2.5, 4.2 et 39.5 Valeur P = 0.001025, 0.000024, 0.000472, 0.000278, 0.000004, 0.000075 et 0.0000001 respectivement) tandis que miR-22 était significativement régulé à la baisse (changement de pli = 0.57 Valeur P = 0.00002). Seulement, miR-192, miR-122, miR-181b et miR-125a-5p étaient des miARN communs significatifs dans les cellules CD133+ du groupe HCC par rapport aux autres groupes non malins. Conclusion Nous avons identifié un panel de miARN composé de quatre miARN (miR-192, miR-122, miR-181b et miR-125a-5p) qui peut servir d'outil moléculaire pour la caractérisation des cellules CD133+ associées aux différents stades de l'hépatocarinogénèse. Ce panel peut aider à développer un nouveau traitement cible spécifique pour ces cellules CD133+.

Translated Description (Spanish)

Objetivo Caracterización molecular de las células madre CD133+ asociadas a hepatocarinogénesis mediante la identificación de los patrones de expresión de microARN específicos (miARN). Métodos Investigamos el patrón de expresión de 13 miARN en células CD133+ purificadas separadas de la sangre periférica de voluntarios sanos, pacientes con hepatitis C crónica (CHC), cirrosis hepática (LC) y carcinoma hepatocelular (HCC) con muestras de médula ósea de voluntarios sanos y pacientes con LC utilizando una matriz de PCR de miARN miScript personalizada. Resultados La expresión diferencial de los 13 miARN estudiados en células CD133+ separadas de la sangre periférica de los pacientes con CHC en comparación con los controles reveló que miR-602, miR-181b, miR-101, miR-122, miR-192, miR-125a-5p y miR-221 estaban significativamente regulados al alza (cambio en veces = 1,8, 1,7, 2, 5,4, 1,6, 2,9 y 1,5 P = 0,039, 0,0019, 0,0013, 0,0370, 00024, 0,000044 y0,000007, respectivamente). En cuanto al grupo de CHC en comparación con el grupo de CHC; miR-602, miR-122, miR-181b, miR-125a-5p y miR-192 estaban significativamente regulados al alza (cambio en veces = 13, 3.1, 2.8, 1.6 y 1.56, valor de P = 0.01, 0.001, 0.000004, 0.002 y 0.007 respectivamente). Al comparar el grupo de HCC con el grupo de LC; miR-199a-3p, miR-192, miR-122, miR-181b, miR-224, miR-125a-5p y miR-885-5p estaban significativamente regulados al alza (cambio en veces = 5, 6.7, 2.3, 3, 2.5, 4.2 y 39.5 valor de P = 0.001025, 0.000024, 0.000472, 0.000278, 0.000004, 0.000075 y 0.0000001 respectivamente) mientras que miR-22 estaba significativamente regulado a la baja (cambio en veces = 0.57 valor de P = 0.00002). Solo miR-192, miR-122, miR-181b y miR-125a-5p fueron miARN comunes significativos en células CD133+ del grupo de CHC en comparación con los otros grupos no malignos. Conclusión Identificamos un panel de miARN compuesto por cuatro miARN (miR-192, miR-122, miR-181b y miR-125a-5p) que puede servir como una herramienta molecular para la caracterización de las células CD133+ asociadas con diferentes etapas de hepatocarinogénesis. Este panel puede ayudar a desarrollar una nueva terapia objetivo específica para esas células CD133+.

Files

journal.pone.0193709&type=printable.pdf

Files (5.4 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:833518930a23abe36452ef0b5181e106
5.4 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
بصمات الحمض النووي الريبي المجهري لتدوير الخلايا الموجبة CD133 في سرطان الخلايا الكبدية مع عدوى فيروس التهاب الكبد الوبائي
Translated title (French)
Signatures de microARN pour les cellules CD133-positives circulantes dans le carcinome hépatocellulaire avec infection par le VHC
Translated title (Spanish)
Firmas de microARN para células CD133 positivas circulantes en carcinoma hepatocelular con infección por VHC

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2794252340
DOI
10.1371/journal.pone.0193709

Is supplement to
https://openalex.org/W4319336998 (Other)
https://openalex.org/W3094531751 (Other)
https://openalex.org/W2888090881 (Other)
https://openalex.org/W2794252340 (Other)
https://openalex.org/W2431458804 (Other)
https://openalex.org/W2412414326 (Other)
https://openalex.org/W2357755457 (Other)
https://openalex.org/W2083464962 (Other)
https://openalex.org/W1968992727 (Other)
https://openalex.org/W1154407209 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Egypt

References

  • https://openalex.org/W1515008413
  • https://openalex.org/W1571473046
  • https://openalex.org/W1585322660
  • https://openalex.org/W1593660812
  • https://openalex.org/W1800093716
  • https://openalex.org/W1895281631
  • https://openalex.org/W1967434444
  • https://openalex.org/W1971488476
  • https://openalex.org/W1974997620
  • https://openalex.org/W1975483481
  • https://openalex.org/W1980840305
  • https://openalex.org/W1982535740
  • https://openalex.org/W1987851658
  • https://openalex.org/W1994548310
  • https://openalex.org/W1997924613
  • https://openalex.org/W2000778748
  • https://openalex.org/W2003333649
  • https://openalex.org/W2004163835
  • https://openalex.org/W2006531594
  • https://openalex.org/W2007580478
  • https://openalex.org/W2009143053
  • https://openalex.org/W2011780539
  • https://openalex.org/W2015018301
  • https://openalex.org/W2015255449
  • https://openalex.org/W2026531690
  • https://openalex.org/W2027884555
  • https://openalex.org/W2029807548
  • https://openalex.org/W2033462059
  • https://openalex.org/W2034615970
  • https://openalex.org/W2037205041
  • https://openalex.org/W2037902063
  • https://openalex.org/W2038225686
  • https://openalex.org/W2041473234
  • https://openalex.org/W2044073319
  • https://openalex.org/W2048251248
  • https://openalex.org/W2050387487
  • https://openalex.org/W2057650091
  • https://openalex.org/W2060459012
  • https://openalex.org/W2067197628
  • https://openalex.org/W2072049513
  • https://openalex.org/W2073391234
  • https://openalex.org/W2082873628
  • https://openalex.org/W2084284022
  • https://openalex.org/W2084779650
  • https://openalex.org/W2092981234
  • https://openalex.org/W2096473000
  • https://openalex.org/W2099235183
  • https://openalex.org/W2107433464
  • https://openalex.org/W2107515690
  • https://openalex.org/W2136754349
  • https://openalex.org/W2145720555
  • https://openalex.org/W2148251762
  • https://openalex.org/W2151939392
  • https://openalex.org/W2157485928
  • https://openalex.org/W2161027618
  • https://openalex.org/W2166906519
  • https://openalex.org/W2168584828
  • https://openalex.org/W2168912846
  • https://openalex.org/W2213448039
  • https://openalex.org/W2234766635
  • https://openalex.org/W2268705481
  • https://openalex.org/W2313801945
  • https://openalex.org/W2419361198
  • https://openalex.org/W73010523
  • https://openalex.org/W832163603