Published April 7, 2016 | Version v1
Publication Open

GC-FID determination of nucleobases guanine, adenine, cytosine, and thymine from DNA by precolumn derivatization with isobutyl chloroformate

Creators

  • 1. University of Sindh

Description

Adenine (A), guanine (G), cytosine (C), thymine (T) and uracil (U) are building blocks and major constituents of deoxyribonucleic acid (DNA) and ribonucleic acid (RNA). The metabolic pathway of DNA and RNA is strongly related to A, G, C, T, and U. Gas chromatography (GC) has been examined for the ease of separation of the nucleobases guanine (G), adenine (A), cytosine (C), thymine (T), and uracil (U) after precolumn derivatization with isobutyl chloroformate. GC was carried out from the column HP-5 (30 m × 0.32 mm id) with layer thickness 0.25 μm. The linear calibration curves were obtained with 0.5–50 μmol L−1 with limits of detection (LOD) 0.08–0.10 μmol L−1. The isolated DNA after acid hydrolysis from human blood and plants was analyzed, and amounts of T, A, C, and G were found in human blood within the ranges 0.521–2.625, 0.559–2.655, 0.490–2.915, and 0.450–2.739 μmol L−1, respectively, with relative standard deviation (RSD) 0.77–5.66 %. The ratios between T:A and G:C were 0.94–1.05 and 0.94–1.06, respectively. The values of (T + A)/(G + C) were within 0.90–1.07. Similarly from plant, T, A, C, and G were found within 0.48–2.915 nmolg−1 with RSD 0.88–5.00 %. The method was applicable for the analysis of DNA nucleobases from biological samples.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

الأدينين (A)، الجوانين (G)، السيتوزين (C)، الثايمين (T) واليوراسيل (U) هي اللبنات الأساسية والمكونات الرئيسية للحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين (DNA) والحمض النووي الريبوزي (RNA). يرتبط المسار الأيضي للحمض النووي الريبي والحمض النووي الريبي ارتباطًا وثيقًا بـ A و G و C و T و U. تم فحص كروماتوغرافيا الغاز (GC) لسهولة فصل قواعد الجوانين النووية (G) والأدينين (A) والسيتوزين (C) والثيمين (T) واليوراسيل (U) بعد اشتقاق ما قبل العمود باستخدام كلوروفورمات الأيزوبوتيل. تم تنفيذ GC من العمود HP -5 (30 م × 0.32 مم) بسماكة طبقة 0.25 ميكرومتر. تم الحصول على منحنيات المعايرة الخطية مع 0.5–50 ميكرومول L-1 مع حدود الكشف (LOD) 0.08–0.10 ميكرومول L-1. تم تحليل الحمض النووي المعزول بعد التحلل الحمضي من دم الإنسان والنباتات، وتم العثور على كميات من T و A و C و G في دم الإنسان ضمن النطاقات 0.521-2.625 و 0.559-2.655 و 0.490–2.915 و 0.450-2.739 ميكرومول لتر-1، على التوالي، مع انحراف معياري نسبي (RSD) 0.77–5.66 ٪. كانت النسب بين T:A و G:C 0.94–1.05 و 0.94–1.06 على التوالي. كانت قيم (T + A)/(G + C) في حدود 0.90–1.07. وبالمثل من النبات، تم العثور على T و A و C و G ضمن 0.48-2.915نانومولغ-1 مع RSD 0.88–5.00 ٪. كانت الطريقة قابلة للتطبيق لتحليل القواعد النووية للحمض النووي من العينات البيولوجية.

Translated Description (French)

L'adénine (A), la guanine (G), la cytosine (C), la thymine (T) et l'uracile (U) sont des éléments constitutifs et des constituants majeurs de l'acide désoxyribonucléique (ADN) et de l'acide ribonucléique (ARN). La voie métabolique de l'ADN et de l'ARN est fortement liée à A, G, C, T et U. La chromatographie en phase gazeuse (CPG) a été examinée pour la facilité de séparation des nucléobases guanine (G), adénine (A), cytosine (C), thymine (T) et uracile (U) après la dérivatisation de la précolonne avec le chloroformiate d'isobutyle. La CPG a été réalisée à partir de la colonne HP-5 (30 m × 0,32 mm id) avec une épaisseur de couche de 0,25 μm. Les courbes d'étalonnage linéaires ont été obtenues avec 0,5-50 μmol L−1 avec des limites de détection (LOD) 0,08-0,10 μmol L−1. L'ADN isolé après hydrolyse acide du sang humain et des plantes a été analysé, et des quantités de T, A, C et G ont été trouvées dans le sang humain dans les plages 0,521-2,625, 0,559-2,655, 0,490-2,915 et 0,450-2,739 μmol L−1, respectivement, avec un écart type relatif (ETR) de 0,77-5,66 %. Les rapports entre T :A et G :C étaient respectivement de 0,94 à 1,05 et de 0,94 à 1,06. Les valeurs de (T + A)/(G + C) étaient comprises entre 0,90 et 1,07. De même pour la plante, T, A, C et G ont été trouvés à 0,48-2,915nmolg −1 avec RSD 0,88-5,00 %. La méthode était applicable pour l'analyse des nucléobases d'ADN à partir d'échantillons biologiques.

Translated Description (Spanish)

La adenina (A), la guanina (G), la citosina (C), la timina (T) y el uracilo (U) son componentes básicos y principales constituyentes del ácido desoxirribonucleico (ADN) y el ácido ribonucleico (ARN). La vía metabólica del ADN y el ARN está fuertemente relacionada con A, G, C, T y U. Se ha examinado la cromatografía de gases (GC) para determinar la facilidad de separación de las nucleobases guanina (G), adenina (A), citosina (C), timina (T) y uracilo (U) después de la derivatización de la precolumna con cloroformiato de isobutilo. La GC se llevó a cabo desde la columna HP-5 (30 m × 0.32 mm id) con un espesor de capa de 0.25 μm. Las curvas de calibración lineal se obtuvieron con 0.5–50 μmol L−1 con límites de detección (LOD) 0.08–0.10 μmol L−1. Se analizó el ADN aislado después de la hidrólisis ácida de sangre humana y plantas, y se encontraron cantidades de T, A, C y G en sangre humana dentro de los intervalos 0.521-2.625, 0.559-2.655, 0.490-2.915 y 0.450-2.739 μmol L-1, respectivamente, con desviación estándar relativa (RSD) 0.77–5.66 %. Las relaciones entre T:A y G:C fueron 0.94–1.05 y 0.94–1.06, respectivamente. Los valores de (T + A)/(G + C) estuvieron dentro de 0.90–1.07. De manera similar, de la planta, T, A, C y G se encontraron dentro de 0.48-2.915nmolg −1 con RSD 0.88–5.00 %. El método fue aplicable para el análisis de nucleobases de ADN de muestras biológicas.

Files

s40543-016-0090-9.pdf

Files (789.4 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:9fa695afcbf4d53540e8db70cd68aaa0
789.4 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
GC - FID تحديد nucleobases guanine و adenine و cytosine و thymine من الحمض النووي عن طريق اشتقاق ما قبل العمود باستخدام كلوروفورمات الأيزوبيوتيل
Translated title (French)
Détermination GC-FID des nucléobases guanine, adénine, cytosine et thymine à partir de l'ADN par dérivatisation précolonne avec du chloroformiate d'isobutyle
Translated title (Spanish)
Determinación GC-FID de nucleobases guanina, adenina, citosina y timina a partir de ADN mediante derivatización precolumna con cloroformiato de isobutilo

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2329079694
DOI
10.1186/s40543-016-0090-9

Is supplement to
https://openalex.org/W2329079694 (Other)
https://openalex.org/W2168580805 (Other)
https://openalex.org/W2149706561 (Other)
https://openalex.org/W2085887851 (Other)
https://openalex.org/W2052082585 (Other)
https://openalex.org/W2047972624 (Other)
https://openalex.org/W2020471931 (Other)
https://openalex.org/W1990025216 (Other)
https://openalex.org/W1967295691 (Other)
https://openalex.org/W1937098880 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Pakistan

References

  • https://openalex.org/W1589364044
  • https://openalex.org/W1800752973
  • https://openalex.org/W1964895210
  • https://openalex.org/W1973484155
  • https://openalex.org/W1974486085
  • https://openalex.org/W1979472284
  • https://openalex.org/W1979608557
  • https://openalex.org/W1996777571
  • https://openalex.org/W1997375603
  • https://openalex.org/W1999230853
  • https://openalex.org/W2003489394
  • https://openalex.org/W2003996195
  • https://openalex.org/W2011037803
  • https://openalex.org/W2029280746
  • https://openalex.org/W2034356694
  • https://openalex.org/W2034731698
  • https://openalex.org/W2044270486
  • https://openalex.org/W2054512134
  • https://openalex.org/W2058666404
  • https://openalex.org/W2060004912
  • https://openalex.org/W2064919777
  • https://openalex.org/W2068389072
  • https://openalex.org/W2071058407
  • https://openalex.org/W2074435684
  • https://openalex.org/W2080249599
  • https://openalex.org/W2093734025
  • https://openalex.org/W2095348027
  • https://openalex.org/W2108315705
  • https://openalex.org/W2143030831
  • https://openalex.org/W2143666478
  • https://openalex.org/W2158201608
  • https://openalex.org/W2159246331
  • https://openalex.org/W2159266644