Published November 17, 2021 | Version v1
Publication Open

IL28B-Gene Polymorphisms (rs12979860) in HCV Liver Parenchymal changes legitimize Screening for SNPs before DAAs Therapy

Creators

  • 1. Al-Azhar University
  • 2. National Institute of Genetic Engineering and Biotechnology
  • 3. Centro de Ingeniería Genética y Biotecnología

Description

Abstract Background and objective : IL28B-gene polymorphisms show inconclusive relationships with CHCV DAAs-treatment outcomes on evaluation by serum-PCR. Solitary intra-PBMCs HCV-RNA antisense-strands are independently found in naïve and experienced cases regardless to viremia or hepatic-parenchymal changes. We correlated frequencies of IL28B-gene SNPs and alleles with HCV induced liver-changes during SVR evaluation by PBMCs-PCR after DAAs-therapy. Methods : Twelve weeks after completing DAAs-therapy, the impacts of IL28B-gene-SNPs were evaluated in three groups of patients: group- I (n=25) with negative serum and PBMCs HCV-PCR, group- II (n=52) had solitary intra-PBMCs HCV-RNA, and group- III (n=25) had positive serum HCV-RNA. All cases were subjected to IL28B-gene-SNP analyses and correlated with their ultrasonographic liver changes. Results : IL28B-genotyping in post-DAAs-treatment HCV-SVR and viral relapse revealed: a) dominant CC-genotype and C allele in normal hepatic parenchyma in group-I compared to group-II (P=0.0047, 0.0007) and group-III (P=0.0564, 0.000003) b) frequent CT-SNP and T-allele in bright hepatic parenchyma in group-II when compared with group-I (P=0.0077, 0.002 ) and group-III (P=0.0363, 0.0005) c) increased TT-SNP and T-allele frequencies in coarse liver in group-III compared to group-I (P=0.02256, 0.000130) and group-II (P=0.08647, 0.004308). Conclusions : Outcomes of HCV treatment with DAAs are dependent on host IL28B-gene polymorphisms and HCV induced liver changes. SVR is achieved when wild type-CC-genotype and C-allele are dominant in normal hepatic parenchyma; solitary intra-PBMCs-relapse occurs in increased frequency of CT-genotype when liver tissues are fibrotic; serologic-relapse is dominant when TT-genotype and T-allele are frequent in cirrhotic liver. IL28B-gene SNP analyses in relation to hepatic parenchymal changes are recommended before treating CHCV-infection with DAAs.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

ملخص الخلفية والهدف : تُظهر الأشكال الجينية المتعددة IL28B علاقات غير حاسمة مع نتائج علاج CHCV DAAs عند التقييم بواسطة مصل PCR. تم العثور على خيوط مضادة للحمض النووي الريبي HCV - RNA الانفرادي داخل PBMCs بشكل مستقل في الحالات الساذجة وذات الخبرة بغض النظر عن فيريمية الدم أو التغيرات الكبدية المتنية. ربطنا ترددات الجينات SNPs والأليلات IL28B مع تغيرات الكبد المستحثة بفيروس التهاب الكبد الوبائي أثناء تقييم SVR بواسطة PBMCs - PCR بعد علاج DAAs. الطرق : بعد اثني عشر أسبوعًا من الانتهاء من علاج DAAs، تم تقييم تأثيرات IL28B - genen - SNPs في ثلاث مجموعات من المرضى: المجموعة الأولى (ن=25) مع مصل سلبي و PBMCs HCV - PCR، المجموعة الثانية (ن=52) لديها مصل انفرادي داخل PBMCs HCV - RNA، والمجموعة الثالثة (ن=25) لديها مصل إيجابي HCV - RNA. خضعت جميع الحالات لتحليل IL28B - genene - SNP وارتبطت بتغيرات الكبد بالموجات فوق الصوتية. النتائج : كشف التنميط الجيني IL28B في علاج ما بعد DAAs HCV - SVR والانتكاس الفيروسي: أ) النمط الجيني CC السائد والأليل C في المتن الكبدي الطبيعي في المجموعة الأولى مقارنة بالمجموعة الثانية (P=0.0047، 0.0007) والمجموعة الثالثة (P=0.0564، 0.000003) ب) تكرار CT - SNP والأليل T في المتن الكبدية الساطعة في المجموعة الثانية عند مقارنتها بالمجموعة الأولى (P=0.0077، 0.002 ) والمجموعة الثالثة (P=0.0363، 0.0005) ج) زيادة ترددات TT - SNP والأليل T في الكبد الخشن في المجموعة الثالثة مقارنة بالمجموعة الأولى (P= 0.02256، 0.000130) والمجموعة الثانية (P=0.08647، 0.004308). الاستنتاجات : تعتمد نتائج علاج فيروس التهاب الكبد الوبائي سي مع DAAs على تعدد الأشكال الجينية IL28B المضيفة وتغيرات الكبد المستحثة بفيروس التهاب الكبد الوبائي سي. يتم تحقيق المقاومة الوعائية المحيطية عندما يكون النمط الجيني من النوع البري CC والأليل C سائدين في المتن الكبدي الطبيعي ؛ يحدث الانتكاس الانفرادي داخل PBMCs في زيادة تواتر النمط الجيني CT عندما تكون أنسجة الكبد تليفية ؛ يكون الانتكاس المصلي سائدًا عندما يكون النمط الجيني TT والأليل T متكررًا في الكبد المتشمع. يوصى بتحليلات SNP الجينية IL28B فيما يتعلق بالتغيرات المتنية الكبدية قبل علاج عدوى CHCV بـ DAAs.

Translated Description (French)

Résumé Contexte et objectif : Les polymorphismes du gène IL28B montrent des relations non concluantes avec les résultats du traitement par AAD du CHCV lors de l'évaluation par PCR sérique. Les brins antisens ARN-VHC intra-PBMC solitaires se trouvent indépendamment dans les cas naïfs et expérimentés, indépendamment de la virémie ou des changements hépatiques-parenchymateux. Nous avons corrélé les fréquences des SNP et des allèles du gène IL28B avec les changements hépatiques induits par le VHC lors de l'évaluation de la RVS par PBMCs-PCR après une thérapie par AAD. Méthodes : Douze semaines après la fin du traitement par AAD, les impacts des PNS du gène IL28B ont été évalués chez trois groupes de patients : le groupe I (n=25) avec sérum négatif et PBMCs HCV-PCR, le groupe II (n=52) avait un ARN-VHC intra-PBMCs solitaire et le groupe III (n=25) avait un ARN-VHC sérique positif. Tous les cas ont été soumis à des analyses IL28B-gène-SNP et corrélés avec leurs modifications hépatiques échographiques. Résultats : Le génotypage de l'IL28B dans le VHC-SVR post-traitement par DAA et la rechute virale a révélé : a) un génotype CC dominant et un allèle C dans le parenchyme hépatique normal dans le groupe I par rapport au groupe II (P=0,0047, 0,0007) et au groupe III (P=0,0564, 0,000003) b) des CT-SNP et un allèle T fréquents dans le parenchyme hépatique brillant dans le groupe II par rapport au groupe I (P=0,0077, 0,002 ) et au groupe III (P=0,0363, 0,0005) c) une augmentation des fréquences TT-SNP et des allèles T dans le foie grossier dans le groupe III par rapport au groupe I (P= 0,02256, 0,000130) et au groupe II (P= 0,08647, 0,004308). Conclusions : Les résultats du traitement du VHC avec des AAD dépendent des polymorphismes du gène IL28B de l'hôte et des modifications hépatiques induites par le VHC. La RVS est obtenue lorsque le génotype CC de type sauvage et l'allèle C sont dominants dans le parenchyme hépatique normal ; une rechute intra-PBMC solitaire se produit dans une fréquence accrue de génotype CT lorsque les tissus hépatiques sont fibrotiques ; une rechute sérologique est dominante lorsque le génotype TT et l'allèle T sont fréquents dans le foie cirrhotique. Des analyses du SNP du gène IL28B en relation avec les modifications du parenchyme hépatique sont recommandées avant de traiter l'infection par le CHCV avec des AAD.

Translated Description (Spanish)

Resumen Antecedentes y objetivo : los polimorfismos del gen IL28B muestran relaciones no concluyentes con los DAA del CHCV: resultados del tratamiento en la evaluación por PCR sérica. Las cadenas antisentido de ARN del VHC intra-PBMC solitarias se encuentran independientemente en casos sin tratamiento previo y experimentados, independientemente de la viremia o los cambios en el parénquima hepático. Correlacionamos las frecuencias de los SNP del gen IL28B y los alelos con los cambios hepáticos inducidos por el VHC durante la evaluación de SVR por PBMC-PCR después de la terapia con DAA. Métodos : Doce semanas después de completar la terapia con AAD, se evaluaron los impactos de los SNP del gen IL28B en tres grupos de pacientes: el grupo I (n=25) con suero negativo y PCR del VHC de PBMC, el grupo II (n=52) tenía ARN del VHC intra-PBMC solitario y el grupo III (n=25) tenía ARN del VHC en suero positivo. Todos los casos se sometieron a análisis de gen IL28B-SNP y se correlacionaron con sus cambios hepáticos ultrasonográficos. Resultados : El genotipado de IL28B en el VHC-SVR posterior al tratamiento con DAA y la recaída viral revelaron: a) genotipo CC dominante y alelo C en el parénquima hepático normal en el grupo I en comparación con el grupo II (P=0,0047, 0,0007) y el grupo III (P=0,0564, 0,000003) b) CT-SNP frecuente y alelo T en el parénquima hepático brillante en el grupo II en comparación con el grupo I (P=0,0077, 0,002 ) y el grupo III (P=0,0363, 0,0005) c) aumento de las frecuencias de TT-SNP y alelo T en el hígado grueso en el grupo III en comparación con el grupo I (P=0,02256, 0,000130) y el grupo II (P= 0,08647, 0,004308). Conclusiones : Los resultados del tratamiento del VHC con AAD dependen de los polimorfismos del gen IL28B del huésped y de los cambios hepáticos inducidos por el VHC. La RVS se logra cuando el genotipo CC de tipo salvaje y el alelo C son dominantes en el parénquima hepático normal; la recaída intra-PBMC solitaria se produce en una mayor frecuencia del genotipo CT cuando los tejidos hepáticos son fibróticos; la recaída serológica es dominante cuando el genotipo TT y el alelo T son frecuentes en el hígado cirrótico. Se recomiendan análisis de SNP del gen IL28B en relación con los cambios del parénquima hepático antes de tratar la infección por CHCV con AAD.

Files

latest.pdf.pdf

Files (1.2 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:54c842c624f72525b1bd19c93dd77add
1.2 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
IL28B - تعدد الأشكال الجينية (rs12979860) في التغيرات المتنية للكبد HCV تضفي الشرعية على فحص SNPs قبل علاج DAAs
Translated title (French)
Les polymorphismes du gène IL28B (rs12979860) dans les modifications du parenchymateux hépatique du VHC légitiment le dépistage des SNP avant le traitement par AAD
Translated title (Spanish)
Los polimorfismos del gen IL28B (rs12979860) en los cambios del parénquima hepático del VHC legitiman la detección de SNP antes de la terapia con DAA

Identifiers

Other
https://openalex.org/W3212919832
DOI
10.21203/rs.3.rs-1023473/v1

Is supplement to
https://openalex.org/W4296620168 (Other)
https://openalex.org/W3017659492 (Other)
https://openalex.org/W2376572953 (Other)
https://openalex.org/W2358154819 (Other)
https://openalex.org/W2356468612 (Other)
https://openalex.org/W2184363627 (Other)
https://openalex.org/W2164332050 (Other)
https://openalex.org/W2107074164 (Other)
https://openalex.org/W2056355462 (Other)
https://openalex.org/W1511048503 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Cuba

References

  • https://openalex.org/W2901709471
  • https://openalex.org/W2947482003
  • https://openalex.org/W3127678231