Published May 28, 2013 | Version v1
Publication Open

Diversity of Mycoplasma hominis clinical isolates from Bordeaux, France, as assessed by multiple-locus variable-number tandem repeat analysis

Creators

  • 1. Institut National de la Recherche Agronomique du Niger
  • 2. University of Bordeaux
  • 3. Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux

Description

Mycoplasma hominis is an opportunistic human mycoplasma species that can cause various urogenital infections and, less frequently, extragenital infections. The objective of this work was to study the genetic diversity of this species using a molecular typing method based on multiple-locus variable-number tandem repeat (VNTR) analysis (MLVA).The genome content of M. hominis PG21 was analysed for tandem repeats (TRs), and five of the 130 TRs identified were selected for use in an MLVA assay. The method was based on GeneScan analysis of VNTR loci using multiplex PCR with fluorescent dyes and resolution by capillary electrophoresis. This approach was used on a collection of 210 urogenital and extragenital French clinical isolates collected between 1987 and 2009. Forty MLVA types were found. The discriminatory index of our MLVA scheme was 0.924. Using this new typing tool, persistent infection was suggested for six patients and new infection for one patient. Furthermore, mother-to-child transmission was confirmed in the two cases studied. Application of MLVA to a wide range of M. hominis isolates revealed high genotypic diversity and no obvious link between the MLVA type and the isolate year of collection, the patient's age or sex, the anatomical origin of the isolates or resistance to antibiotics was found.Our MLVA scheme highlights the high genetic heterogeneity of the M. hominis species. It seems too discriminatory to be used for large epidemiological studies but has proven its usefulness for molecular studies at the individual level.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

الميكوبلازما البشرية هي نوع من الميكوبلازما البشرية الانتهازية التي يمكن أن تسبب التهابات الجهاز البولي التناسلي المختلفة، وفي كثير من الأحيان، التهابات خارج الأعضاء التناسلية. كان الهدف من هذا العمل هو دراسة التنوع الجيني لهذا النوع باستخدام طريقة الكتابة الجزيئية بناءً على تحليل التكرار الترادفي للعدد المتغير متعدد المواضع (MLVA). تم تحليل محتوى جينوم M. hominis PG21 للتكرار الترادفي (TRs)، وتم اختيار خمسة من 130 TRs المحددة لاستخدامها في اختبار MLVA. استندت الطريقة إلى تحليل GeneScan لمواقع VNTR باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل المتعدد مع أصباغ الفلورسنت والدقة عن طريق الرحلان الكهربائي الشعري. تم استخدام هذا النهج على مجموعة من 210 عزلات سريرية فرنسية بولية تناسلية وخارجية تناسلية تم جمعها بين عامي 1987 و 2009. تم العثور على أربعين نوعًا من أنواع MLVA. كان المؤشر التمييزي لمخططنا لمكافحة غسل الأموال 0.924. باستخدام أداة الكتابة الجديدة هذه، تم اقتراح عدوى مستمرة لستة مرضى وعدوى جديدة لمريض واحد. علاوة على ذلك، تم تأكيد انتقال العدوى من الأم إلى الطفل في الحالتين اللتين تمت دراستهما. كشف تطبيق MLVA على مجموعة واسعة من عزلات M. hominis عن تنوع جيني مرتفع ولا يوجد رابط واضح بين نوع MLVA وسنة الجمع المعزولة، وعمر المريض أو جنسه، والأصل التشريحي للعزلات أو مقاومة المضادات الحيوية. يسلط مخطط MLVA الضوء على عدم التجانس الجيني العالي لأنواع M. hominis. يبدو أنه تمييزي للغاية بحيث لا يمكن استخدامه في الدراسات الوبائية الكبيرة ولكنه أثبت فائدته في الدراسات الجزيئية على المستوى الفردي.

Translated Description (French)

Mycoplasma hominis est une espèce de mycoplasme humain opportuniste qui peut causer diverses infections urogénitales et, moins fréquemment, des infections extragénitales. L'objectif de ce travail était d'étudier la diversité génétique de cette espèce à l'aide d'une méthode de typage moléculaire basée sur l'analyse de répétitions en tandem à nombre variable (VNTR) à locus multiples (MLVA). Le contenu génomique de M. hominis PG21 a été analysé pour les répétitions en tandem (TR), et cinq des 130 TR identifiés ont été sélectionnés pour une utilisation dans un test MLVA. La méthode était basée sur l'analyse GeneScan des loci VNTR en utilisant la PCR multiplexe avec des colorants fluorescents et la résolution par électrophorèse capillaire. Cette approche a été utilisée sur une collection de 210 isolats cliniques français urogénitaux et extragénitaux collectés entre 1987 et 2009. Quarante types de MLVA ont été trouvés. L'indice discriminatoire de notre régime MLVA était de 0,924. À l'aide de ce nouvel outil de typage, une infection persistante a été suggérée pour six patients et une nouvelle infection pour un patient. De plus, la transmission de la mère à l'enfant a été confirmée dans les deux cas étudiés. L'application de la MLVA à un large éventail d'isolats de M. hominis a révélé une grande diversité génotypique et aucun lien évident entre le type de MLVA et l'année de collecte de l'isolat, l'âge ou le sexe du patient, l'origine anatomique des isolats ou la résistance aux antibiotiques n'a été trouvé. Notre schéma MLVA met en évidence la forte hétérogénéité génétique de l'espèce M. hominis. Il semble trop discriminatoire pour être utilisé pour les grandes études épidémiologiques mais a prouvé son utilité pour les études moléculaires au niveau individuel.

Translated Description (Spanish)

Mycoplasma hominis es una especie de micoplasma humano oportunista que puede causar diversas infecciones urogenitales y, con menos frecuencia, infecciones extragenitales. El objetivo de este trabajo fue estudiar la diversidad genética de esta especie utilizando un método de tipificación molecular basado en el análisis de repetición en tándem de número variable de locus múltiple (VNTR) (MLVA). El contenido del genoma de M. hominis PG21 se analizó para repeticiones en tándem (TR), y cinco de las 130 TR identificadas se seleccionaron para su uso en un ensayo MLVA. El método se basó en el análisis GeneScan de los loci de VNTR utilizando PCR multiplex con colorantes fluorescentes y resolución por electroforesis capilar. Este enfoque se utilizó en una colección de 210 aislados clínicos franceses urogenitales y extragenitales recolectados entre 1987 y 2009. Se encontraron cuarenta tipos de MLVA. El índice discriminatorio de nuestro esquema MLVA fue de 0.924. Usando esta nueva herramienta de tipificación, se sugirió una infección persistente para seis pacientes y una nueva infección para un paciente. Además, se confirmó la transmisión de madre a hijo en los dos casos estudiados. La aplicación de MLVA a una amplia gama de aislados de M. hominis reveló una alta diversidad genotípica y no se encontró un vínculo obvio entre el tipo de MLVA y el año de recolección del aislado, la edad o el sexo del paciente, el origen anatómico de los aislados o la resistencia a los antibióticos. Nuestro esquema MLVA destaca la alta heterogeneidad genética de la especie M. hominis. Parece demasiado discriminatorio para ser utilizado para grandes estudios epidemiológicos, pero ha demostrado su utilidad para estudios moleculares a nivel individual.

Files

1471-2180-13-120.pdf

Files (411.8 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:dadd618e1155ec5458ab946f5631b66e
411.8 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
تنوع العزلات السريرية للميكوبلازما البشرية من بوردو، فرنسا، كما تم تقييمها من خلال تحليل التكرار الترادفي للعدد المتغير متعدد المواضع
Translated title (French)
Diversité des isolats cliniques de Mycoplasma hominis de Bordeaux, en France, telle qu'évaluée par une analyse répétée en tandem à nombre variable à localisations multiples
Translated title (Spanish)
Diversidad de aislados clínicos de Mycoplasma hominis de Burdeos, Francia, evaluados mediante análisis de repetición en tándem de número variable de locus múltiples

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2090908540
DOI
10.1186/1471-2180-13-120

Is supplement to
https://openalex.org/W4206783368 (Other)
https://openalex.org/W3031760290 (Other)
https://openalex.org/W2124265107 (Other)
https://openalex.org/W2107386411 (Other)
https://openalex.org/W2102118092 (Other)
https://openalex.org/W2099326022 (Other)
https://openalex.org/W2033927291 (Other)
https://openalex.org/W1994307861 (Other)
https://openalex.org/W19871479 (Other)
https://openalex.org/W1975926590 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Niger

References

  • https://openalex.org/W1577220347
  • https://openalex.org/W1972659157
  • https://openalex.org/W1975384147
  • https://openalex.org/W1984377951
  • https://openalex.org/W2004833507
  • https://openalex.org/W2015374490
  • https://openalex.org/W2016706786
  • https://openalex.org/W2019065909
  • https://openalex.org/W2042267221
  • https://openalex.org/W2080830643
  • https://openalex.org/W2098618245
  • https://openalex.org/W2101507007
  • https://openalex.org/W2102885994
  • https://openalex.org/W2103333803
  • https://openalex.org/W2106163941
  • https://openalex.org/W2112814753
  • https://openalex.org/W2127640535
  • https://openalex.org/W2131255171
  • https://openalex.org/W2140108123
  • https://openalex.org/W2149881267
  • https://openalex.org/W2151216113
  • https://openalex.org/W2151757671
  • https://openalex.org/W2168945142
  • https://openalex.org/W84924799