Published March 3, 2017 | Version v1
Publication Open

Options in human papillomavirus (HPV) detection for cervical cancer screening: comparison between full genotyping and a rapid qualitative HPV-DNA assay in Ghana

Creators

  • 1. University of Cape Coast
  • 2. Kwame Nkrumah University of Science and Technology
  • 3. Université Joseph Ki-Zerbo
  • 4. London School of Hygiene & Tropical Medicine

Description

Modern cervical cancer screening increasingly relies on the use of molecular techniques detecting high-risk oncogenic human papillomavirus (hr-HPV). A major challenge for developing countries like Ghana has been the unavailability and costs of HPV DNA-based testing. This study compares the performance of careHPV, a semi-rapid and affordable qualitative detection assay for 14 hr-HPV genotypes, with HPV genotyping, for the detection of cytological cervical squamous intraepithelial lesions (SIL). A study comparing between frequency matched HIV-1 seropositive and HIV-seronegative women was conducted in the Cape Coast Teaching Hospital, Ghana. A systematic sampling method was used to select women attending clinics in the hospital. Cervical samples were tested for HPV by careHPV and Anyplex-II HPV28 genotyping assay, and by conventional cytology. A total of 175 paired results (94 from HIV-1 seropositive and 81 from HIV-seronegative women) were analyzed based on the ability of both tests to detect the 14 hr-HPV types included in the careHPV assay. The inter-assay concordance was 94.3% (95%CI: 89.7–97.2%, kappa = 0.88), similar by HIV serostatus. The careHPV assay was equally sensitive among HIV-1 seropositive and seronegative women (97.3% vs. 95.7%, p = 0.50) and slightly more specific among HIV-seronegative women (85.0% vs. 93.1%, p = 0.10). careHPV had good sensitivity (87.5%) but low specificity (52.1%) for the detection of low SIL or greater lesions, but its performance was superior to genotyping (87.5 and 38.8%, respectively). Reproducibility of careHPV, tested on 97 samples by the same individual was 82.5% (95%CI: 73.4–89.4%). The performance characteristics of careHPV compared to genotyping suggest that this simpler and cheaper HPV detection assay could offer a suitable alternative for HPV screening in Ghana.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

يعتمد فحص سرطان عنق الرحم الحديث بشكل متزايد على استخدام التقنيات الجزيئية للكشف عن فيروس الورم الحليمي البشري عالي الخطورة (hr - HPV). يتمثل أحد التحديات الرئيسية التي تواجه البلدان النامية مثل غانا في عدم توفر وتكاليف الاختبارات القائمة على الحمض النووي لفيروس الورم الحليمي البشري. تقارن هذه الدراسة أداء CareHPV، وهو اختبار كشف نوعي شبه سريع وبأسعار معقولة للأنماط الجينية لفيروس الورم الحليمي البشري لمدة 14 ساعة، مع التنميط الجيني لفيروس الورم الحليمي البشري، للكشف عن الآفات داخل الظهارة الحرشفية العنقية الخلوية (SIL). أجريت دراسة تقارن بين النساء المصابات بفيروس نقص المناعة البشرية -1 المصابات بفيروس نقص المناعة البشرية في مستشفى كيب كوست التعليمي في غانا. تم استخدام طريقة منهجية لأخذ العينات لاختيار النساء اللواتي يذهبن إلى العيادات في المستشفى. تم اختبار عينات عنق الرحم لفيروس الورم الحليمي البشري من خلال اختبار التنميط الجيني لفيروس الورم الحليمي البشري من CareHPV و Anyplex - II HPV28، ومن خلال علم الخلايا التقليدي. تم تحليل ما مجموعه 175 نتيجة مقترنة (94 من فيروس نقص المناعة البشرية -1 إيجابي المصل و 81 من النساء المصابات بفيروس نقص المناعة البشرية) بناءً على قدرة كلا الاختبارين على اكتشاف أنواع فيروس الورم الحليمي البشري لمدة 14 ساعة المدرجة في اختبار فيروس الورم الحليمي البشري للرعاية. كان التوافق بين المقايسات 94.3 ٪ (95 ٪CI: 89.7-97.2 ٪، kappa = 0.88)، على غرار الحالة المصلية لفيروس نقص المناعة البشرية. كان فحص فيروس الورم الحليمي البشري للرعاية حساسًا بنفس القدر بين النساء المصابات بفيروس نقص المناعة البشرية -1 المصابات بفيروس نقص المناعة البشرية (97.3 ٪ مقابل 95.7 ٪، p = 0.50) وأكثر تحديدًا بقليل بين النساء المصابات بفيروس نقص المناعة البشرية (85.0 ٪ مقابل 93.1 ٪، p = 0.10). كان لفيروس الورم الحليمي البشري للرعاية حساسية جيدة (87.5 ٪) ولكن خصوصية منخفضة (52.1 ٪) للكشف عن انخفاض سيل أو آفات أكبر، ولكن أدائه كان متفوقًا على التنميط الجيني (87.5 و 38.8 ٪ على التوالي). كانت قابلية استنساخ فيروس الورم الحليمي البشري للرعاية، الذي تم اختباره على 97 عينة من قبل نفس الشخص، 82.5 ٪ (95 ٪CI: 73.4-89.4 ٪). تشير خصائص أداء الرعاية الصحية لفيروس الورم الحليمي البشري مقارنة بالتنميط الجيني إلى أن اختبار الكشف عن فيروس الورم الحليمي البشري الأبسط والأرخص هذا يمكن أن يوفر بديلاً مناسبًا لفحص فيروس الورم الحليمي البشري في غانا.

Translated Description (French)

Le dépistage moderne du cancer du col de l'utérus repose de plus en plus sur l'utilisation de techniques moléculaires de détection du papillomavirus humain oncogène à haut risque (VPH-hr). Un défi majeur pour les pays en développement comme le Ghana a été l'indisponibilité et les coûts des tests basés sur l'ADN du VPH. Cette étude compare la performance de careHPV, un test de détection qualitative semi-rapide et abordable pour les génotypes de 14 h du VPH, avec le génotypage du VPH, pour la détection des lésions intraépithéliales squameuses cervicales cytologiques (sil). Une étude comparant les femmes séropositives au VIH-1 et séronégatives au VIH appariées en fréquence a été menée à l'hôpital universitaire de Cape Coast, au Ghana. Une méthode d'échantillonnage systématique a été utilisée pour sélectionner les femmes fréquentant les cliniques de l'hôpital. Les échantillons cervicaux ont été testés pour le VPH par le test de génotypage careHPV et Anyplex-II HPV28, et par la cytologie conventionnelle. Au total, 175 résultats appariés (94 chez des femmes séropositives pour le VIH-1 et 81 chez des femmes séronégatives pour le VIH) ont été analysés en fonction de la capacité des deux tests à détecter les 14 types de VPH-hr inclus dans le test CareHPV. La concordance inter-essais était de 94,3 % (IC à 95 % : 89,7-97,2 %, kappa = 0,88), similaire selon l'état sérologique du VIH. Le test CareHPV était tout aussi sensible chez les femmes séropositives et séronégatives pour le VIH-1 (97,3 % contre 95,7 %, p = 0,50) et légèrement plus spécifique chez les femmes séronégatives pour le VIH (85,0 % contre 93,1 %, p = 0,10). CareHPV avait une bonne sensibilité (87,5 %) mais une faible spécificité (52,1 %) pour la détection de lésions de sil faibles ou supérieures, mais ses performances étaient supérieures au génotypage (87,5 et 38,8 %, respectivement). La reproductibilité de CareHPV, testée sur 97 échantillons par le même individu était de 82,5 % (IC à 95 % : 73,4-89,4 %). Les caractéristiques de performance de careHPV par rapport au génotypage suggèrent que ce test de détection du VPH plus simple et moins cher pourrait offrir une alternative appropriée pour le dépistage du VPH au Ghana.

Translated Description (Spanish)

La detección moderna del cáncer de cuello uterino se basa cada vez más en el uso de técnicas moleculares que detectan el virus del papiloma humano oncogénico de alto riesgo (hr-HPV). Un desafío importante para los países en desarrollo como Ghana ha sido la falta de disponibilidad y los costos de las pruebas basadas en el ADN del VPH. Este estudio compara el rendimiento de careHPV, un ensayo de detección cualitativo semirrápido y asequible para genotipos de VPH de 14 horas, con el genotipado de VPH, para la detección de lesiones intraepiteliales escamosas (SIL) cervicales citológicas. Se realizó un estudio que comparaba entre mujeres seropositivas al VIH-1 y seronegativas al VIH de frecuencia coincidente en el Cape Coast Teaching Hospital, Ghana. Se utilizó un método de muestreo sistemático para seleccionar a las mujeres que asistían a las clínicas del hospital. Las muestras cervicales se analizaron para detectar el VPH mediante el ensayo de genotipificación CareHPV y Anyplex-II HPV28, y mediante citología convencional. Se analizaron un total de 175 resultados pareados (94 de mujeres seropositivas al VIH-1 y 81 de mujeres seronegativas al VIH) en función de la capacidad de ambas pruebas para detectar los tipos de VPH de 14 horas incluidos en el ensayo careHPV. La concordancia entre ensayos fue del 94,3% (IC 95%: 89,7-97,2%, kappa = 0,88), similar por estado serológico del VIH. El ensayo careHPV fue igualmente sensible entre las mujeres VIH-1 seropositivas y seronegativas (97.3% vs. 95.7%, p = 0.50) y ligeramente más específico entre las mujeres VIH-seronegativas (85.0% vs. 93.1%, p = 0.10). careHPV tuvo buena sensibilidad (87.5%) pero baja especificidad (52.1%) para la detección de lesiones SIL bajas o mayores, pero su rendimiento fue superior al genotipado (87.5 y 38.8%, respectivamente). La reproducibilidad de careHPV, analizada en 97 muestras por el mismo individuo fue del 82,5% (IC 95%: 73,4-89,4%). Las características de rendimiento de careHPV en comparación con la genotipificación sugieren que este ensayo de detección de VPH más simple y barato podría ofrecer una alternativa adecuada para la detección del VPH en Ghana.

Files

s40661-017-0041-1.pdf

Files (452.1 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:bf96bea203c0993690cf30ee29ca733d
452.1 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
خيارات الكشف عن فيروس الورم الحليمي البشري (HPV) لفحص سرطان عنق الرحم: مقارنة بين التنميط الجيني الكامل وفحص الحمض النووي لفيروس الورم الحليمي البشري النوعي السريع في غانا
Translated title (French)
Options de détection du virus du papillome humain (VPH) pour le dépistage du cancer du col de l'utérus : comparaison entre le génotypage complet et un test qualitatif rapide de l'ADN du VPH au Ghana
Translated title (Spanish)
Opciones en la detección del virus del papiloma humano (VPH) para la detección del cáncer de cuello uterino: comparación entre la genotipificación completa y un ensayo rápido de ADN del VPH cualitativo en Ghana

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2593289618
DOI
10.1186/s40661-017-0041-1

Is supplement to
https://openalex.org/W2952803958 (Other)
https://openalex.org/W2898194683 (Other)
https://openalex.org/W2385309846 (Other)
https://openalex.org/W2349329648 (Other)
https://openalex.org/W2150805565 (Other)
https://openalex.org/W2140488604 (Other)
https://openalex.org/W2137738766 (Other)
https://openalex.org/W2071708517 (Other)
https://openalex.org/W1979586326 (Other)
https://openalex.org/W1503497296 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Ghana

References

  • https://openalex.org/W1577087980
  • https://openalex.org/W1582726260
  • https://openalex.org/W1827976466
  • https://openalex.org/W1973716430
  • https://openalex.org/W1974996317
  • https://openalex.org/W1978616412
  • https://openalex.org/W1983858378
  • https://openalex.org/W1987105544
  • https://openalex.org/W1988123584
  • https://openalex.org/W1990879009
  • https://openalex.org/W1991881877
  • https://openalex.org/W2014506993
  • https://openalex.org/W2036650706
  • https://openalex.org/W2039745983
  • https://openalex.org/W2042031410
  • https://openalex.org/W2052434519
  • https://openalex.org/W2066860562
  • https://openalex.org/W2074235033
  • https://openalex.org/W2093583952
  • https://openalex.org/W2119857416
  • https://openalex.org/W2123085223
  • https://openalex.org/W2133765716
  • https://openalex.org/W2167716547
  • https://openalex.org/W2400551155
  • https://openalex.org/W2483926853
  • https://openalex.org/W316269977