Published June 18, 2021
| Version v1
Publication
Open
An overview of Agaricus section Hondenses and Agaricus section Xanthodermatei with description of eight new species from Pakistan
Creators
- 1. University of the Punjab
- 2. Mycologie et Sécurité des Aliments
- 3. Universidad Veracruzana
- 4. Hazara University
- 5. University of Swat
- 6. Chinese Academy of Sciences
Description
In a recent revision of the genus Agaricus, A. section Xanthodermatei was split into two sections A. sect. Hondenses and A. sect. Xanthodermatei. Our objectives were to investigate the species diversity of both sections in Pakistan and to give an overview of the major clades. Phylogenetic analyses based on the combined nucLSU, ITS and TEF1 dataset from 35 specimens of both sections revealed three major clades. Analyses based on ITS dataset and 106 specimens, including 33 from Pakistan, reveal eight new species and one new record species. These nine species are described in detail. It is noteworthy that intraspecific variability as well as interspecific variability between closely related species were very low in ITS sequences in many cases. In the case of the two new species A. xanthochromaticus and A. griseovariegatus, TEF1 sequence data were much more efficient than ITS to distinguish these species from each other. The other new species are A. atroumbonatus, A. fumidicolor, A. macropeplus, A. parviniveus, A. swaticus and A. bambusetorum. The latter is the only new species of A. sect. Hondenses in which it is morphologically atypical and also the unique (sub)tropical species. Agaricus gregariomyces is recorded for the first time in Pakistan. In addition, brief descriptions are provided not only for A. bisporiticus, A. endoxanthus and A. punjabensis, which are reported again in Pakistan, but also for A. californicus, which is reported for the first time in Spain and outside North America. In total 12 species of both sections were reported in Pakistan and half of them were from subtropical climatic areas, underlining the contribution of the climatic diversity to the high species richness in this country.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
في مراجعة حديثة لجنس Agaricus، تم تقسيم A. القسم Xanthodermatei إلى قسمين A. القسم. Hondenses and A. sect. Xanthodermatei. كانت أهدافنا هي التحقيق في تنوع الأنواع في كلا القسمين في باكستان وإعطاء لمحة عامة عن الفروع الرئيسية. كشفت التحليلات الوراثية القائمة على مجموعة بيانات nucLSU و ITS و TEF1 مجتمعة من 35 عينة من كلا القسمين عن ثلاث طبقات رئيسية. تكشف التحليلات المستندة إلى مجموعة البيانات الخاصة بها و 106 عينات، بما في ذلك 33 عينة من باكستان، عن ثمانية أنواع جديدة وأنواع قياسية جديدة. تم وصف هذه الأنواع التسعة بالتفصيل. من الجدير بالذكر أن التباين داخل النوع وكذلك التباين بين الأنواع ذات الصلة الوثيقة كانت منخفضة للغاية في تسلسلاتها في كثير من الحالات. في حالة النوعين الجديدين A. xanthochromaticus و A. griseovariegatus، كانت بيانات تسلسل TEF1 أكثر كفاءة بكثير من تمييز هذه الأنواع عن بعضها البعض. الأنواع الجديدة الأخرى هي A. atroumbonatus و A. fumidicolor و A. macropeplus و A. parviniveus و A. swaticus و A. bambusetorum. هذا الأخير هو النوع الجديد الوحيد من A. sect. هندنسيات تكون فيها غير نمطية من الناحية الشكلية وأيضًا الأنواع الفريدة (شبه)الاستوائية. يتم تسجيل أجاريكوس غريغاريوميسيس لأول مرة في باكستان. بالإضافة إلى ذلك، يتم تقديم أوصاف موجزة ليس فقط لـ A. bisporiticus و A. endoxanthus و A. punjabensis، والتي يتم الإبلاغ عنها مرة أخرى في باكستان، ولكن أيضًا لـ A. californicus، والتي يتم الإبلاغ عنها لأول مرة في إسبانيا وخارج أمريكا الشمالية. في المجموع، تم الإبلاغ عن 12 نوعًا من كلا القسمين في باكستان ونصفهم من المناطق المناخية شبه المدارية، مما يؤكد مساهمة التنوع المناخي في ثراء الأنواع العالية في هذا البلد.Translated Description (French)
Dans une révision récente du genre Agaricus, A. section Xanthodermatei a été divisé en deux sections A. sect. Hondenses et A. sect. Xanthodermatei. Nos objectifs étaient d'étudier la diversité des espèces des deux sections au Pakistan et de donner un aperçu des principaux clades. Les analyses phylogénétiques basées sur l'ensemble de données combiné NUCLSU, ITS et TEF1 de 35 spécimens des deux sections ont révélé trois clades majeurs. Les analyses basées sur SON ensemble de données et 106 spécimens, dont 33 provenant du Pakistan, révèlent huit nouvelles espèces et une nouvelle espèce record. Ces neuf espèces sont décrites en détail. Il est à noter que la variabilité intraspécifique ainsi que la variabilité interspécifique entre espèces étroitement apparentées étaient très faibles dans SES séquences dans de nombreux cas. Dans le cas des deux nouvelles espèces A. xanthochromaticus et A. griseovariegatus, les données de séquence TEF1 ont été beaucoup plus efficaces que les STI pour distinguer ces espèces les unes des autres. Les autres nouvelles espèces sont A. atroumbonatus, A. fumidicolor, A. macropeplus, A. parviniveus, A. swaticus et A. bambusetorum. Ce dernier est la seule nouvelle espèce de A. sect. Hondenses dans laquelle il est morphologiquement atypique et aussi l'unique espèce (sub)tropicale. Agaricus gregariomyces est enregistré pour la première fois au Pakistan. En outre, de brèves descriptions sont fournies non seulement pour A. bisporiticus, A. endoxanthus et A. punjabensis, qui sont signalés à nouveau au Pakistan, mais aussi pour A. californicus, qui est signalé pour la première fois en Espagne et en dehors de l'Amérique du Nord. Au total, 12 espèces des deux sections ont été signalées au Pakistan et la moitié d'entre elles provenaient de zones climatiques subtropicales, soulignant la contribution de la diversité climatique à la grande richesse en espèces de ce pays.Translated Description (Spanish)
En una revisión reciente del género Agaricus, A. section Xanthodermatei se dividió en dos secciones A. sect. Hondenses y A. secc. Xanthodermatei. Nuestros objetivos eran investigar la diversidad de especies de ambas secciones en Pakistán y dar una visión general de los principales clados. Los análisis filogenéticos basados en el conjunto de datos combinado de nucLSU, ITS y TEF1 de 35 especímenes de ambas secciones revelaron tres clados principales. Los análisis basados en SU conjunto de datos y 106 especímenes, incluidos 33 de Pakistán, revelan ocho nuevas especies y una nueva especie récord. Estas nueve especies se describen en detalle. Cabe destacar que la variabilidad intraespecífica, así como la variabilidad interespecífica entre especies estrechamente relacionadas, fueron muy bajas en SUS secuencias en muchos casos. En el caso de las dos nuevas especies A. xanthochromaticus y A. griseovariegatus, los datos de secuencia de TEF1 fueron mucho más eficientes que ITS para distinguir estas especies entre sí. Las otras nuevas especies son A. atroumbonatus, A. fumidicolor, A. macropeplus, A. parviniveus, A. swaticus y A. bambusetorum. Esta última es la única especie nueva de A. sect. Hondenses en los que es morfológicamente atípico y también la única especie (sub)tropical. Agaricus gregariomyces se registra por primera vez en Pakistán. Además, se proporcionan descripciones breves no solo para A. bisporiticus, A. endoxanthus y A. punjabensis, que se informan nuevamente en Pakistán, sino también para A. californicus, que se informa por primera vez en España y fuera de América del Norte. En total se reportaron 12 especies de ambas secciones en Pakistán y la mitad de ellas provenían de áreas climáticas subtropicales, lo que subraya la contribución de la diversidad climática a la alta riqueza de especies en este país.Files
s41598-021-92261-5.pdf.pdf
Files
(12.6 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:b6f0b712280a1e559245643c73e29a4a
|
12.6 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- نظرة عامة على قسم أجاريكوس هندسيس وقسم أجاريكوس زانثوديرماتي مع وصف لثمانية أنواع جديدة من باكستان
- Translated title (French)
- Aperçu de la section Agaricus Hondenses et de la section Agaricus Xanthodermatei avec description de huit nouvelles espèces du Pakistan
- Translated title (Spanish)
- Una descripción general de la sección de Agaricus Hondenses y la sección de Agaricus Xanthodermatei con descripción de ocho nuevas especies de Pakistán
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W3171972726
- DOI
- 10.1038/s41598-021-92261-5
References
- https://openalex.org/W2023222352
- https://openalex.org/W2031377190
- https://openalex.org/W2082640495
- https://openalex.org/W2112299945
- https://openalex.org/W2120644786
- https://openalex.org/W2130889389
- https://openalex.org/W2141052558
- https://openalex.org/W2143636898
- https://openalex.org/W2144362290
- https://openalex.org/W2146058063
- https://openalex.org/W2147716891
- https://openalex.org/W2163335266
- https://openalex.org/W2190700649
- https://openalex.org/W2241280872
- https://openalex.org/W2297180882
- https://openalex.org/W2304950966
- https://openalex.org/W2327750827
- https://openalex.org/W2329517162
- https://openalex.org/W2337534864
- https://openalex.org/W2525421079
- https://openalex.org/W2536924589
- https://openalex.org/W2608299658
- https://openalex.org/W2765682475
- https://openalex.org/W2794796404
- https://openalex.org/W2795422079
- https://openalex.org/W2810272187
- https://openalex.org/W2890410961
- https://openalex.org/W2943233012
- https://openalex.org/W2946206664
- https://openalex.org/W2958377735
- https://openalex.org/W4230678374
- https://openalex.org/W4243044897
- https://openalex.org/W4244736535