Published November 23, 2022 | Version v1
Publication Open

Detection of Mycobacterium tuberculosis using Gene Xpert-MTB/RIF assay among tuberculosis suspected patients at Mizan-Tepi university teaching hospital, southwest Ethiopia: An institution based cross-sectional study

Creators

  • 1. Mizan Tepi University

Description

Background Consistently deciding its current extent and chance elements of tuberculosis (TB) in all levels of clinical settings contributes to the anticipation and control exertion of the disease. In Ethiopia, updated information is still needed at every healthcare level and in different risk groups to monitor the national program's performance, which aims to attain the 2035 goal. Hence, this study aimed to generate additional evidence data on the magnitude of Mycobacterium tuberculosis using the Gene Xpert assay among TB-suspected patients at Mizan-Tepi university teaching hospital, southwest Ethiopia. Methods A cross-sectional descriptive study was conducted from June to September 30, 2021. The required socio-demographic and other risk factor data were collected from a total of 422 suspected TB patients using a structured questionnaire. Approximately 392 pulmonary and 30 extra-pulmonary samples were collected and examined using the Gene Xpert-MTB/RIF assay. The statistical package for social sciences (SPSS) version 25 software was used to analyze the data. Results In this study, Mycobacterium tuberculosis was detected in 12.5% (49/392) of pulmonary samples and 13.3% (4/30) of extra-pulmonary samples, giving an overall TB positivity of 12.6% (53/422). Rifampicin-resistant M . tuberculosis was detected in 3/53 (5.7%). Male sex (AOR: 2.54; 95% CI: 1.210, 5.354), previous contact (AOR: 4.25; 95% CI: 1.790, 10.092), smoking cigarette (AOR: 4.708; 95% CI: 1.004, 22.081), being HIV-positive (AOR: 4.27; 95% CI: 1.606, 11.344), and malnutrition (AOR: 3.55; 95% CI: 1.175, 10.747) were all significantly associated with M . tuberculosis detection using the GeneXpert MTB/RIF assay. Conclusion The overall frequency of M . tuberculosis in this study was still significant in different risk groups, despite the proposed strategies, which aimed to reduce TB prevalence to as low as 10 per 100,000 populations by 2035. Early case detection with better diagnostic tools and public health measures are important prevention and control strategies to meet the proposed target and reduce the burden of TB in the country.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

خلفية يساهم التحديد المستمر لمدى انتشاره الحالي وعناصر فرصة الإصابة بالسل في جميع مستويات البيئات السريرية في توقع والسيطرة على المرض. في إثيوبيا، لا تزال هناك حاجة إلى معلومات محدثة على كل مستوى من مستويات الرعاية الصحية وفي مجموعات المخاطر المختلفة لمراقبة أداء البرنامج الوطني، الذي يهدف إلى تحقيق هدف عام 2035. وبالتالي، هدفت هذه الدراسة إلى توليد بيانات أدلة إضافية حول حجم المتفطرة السلية باستخدام مقايسة جين إكسبرت بين المرضى المشتبه في إصابتهم بالسل في مستشفى ميزان تيبي التعليمي الجامعي، جنوب غرب إثيوبيا. الطرق تم إجراء دراسة وصفية مستعرضة من يونيو إلى 30 سبتمبر 2021. تم جمع البيانات الاجتماعية والديموغرافية وغيرها من بيانات عوامل الخطر المطلوبة من ما مجموعه 422 مريضًا مشتبهًا في إصابتهم بالسل باستخدام استبيان منظم. تم جمع ما يقرب من 392 عينة رئوية و 30 عينة خارج الرئة وفحصها باستخدام اختبار الجينات Xpert - MTB/RIF. تم استخدام برنامج الحزمة الإحصائية للعلوم الاجتماعية (SPSS) الإصدار 25 لتحليل البيانات. النتائج في هذه الدراسة، تم اكتشاف المتفطرة السلية في 12.5 ٪ (49/392) من العينات الرئوية و 13.3 ٪ (4/30) من العينات خارج الرئة، مما يعطي إيجابية عامة للسل بنسبة 12.6 ٪ (53/422). تم اكتشاف السل المقاوم للريفامبيسين في 3/53 (5.7 ٪). الجنس الذكري (AOR: 2.54 ؛ 95 ٪ CI: 1.210، 5.354)، الاتصال السابق (AOR: 4.25 ؛ 95 ٪ CI: 1.790، 10.092)، تدخين السجائر (AOR: 4.708 ؛ 95 ٪ CI: 1.004، 22.081)، كونها إيجابية لفيروس نقص المناعة البشرية (AOR: 4.27 ؛ 95 ٪ CI: 1.606، 11.344)، وسوء التغذية (AOR: 3.55 ؛ 95 ٪ CI: 1.175، 10.747) كلها مرتبطة بشكل كبير باكتشاف السل باستخدام اختبار GeneXpert MTB/RIF. لا يزال التواتر الإجمالي لمرض السل في هذه الدراسة كبيرًا في مجموعات المخاطر المختلفة، على الرغم من الاستراتيجيات المقترحة، والتي تهدف إلى الحد من انتشار السل إلى مستوى منخفض يصل إلى 10 لكل 100000 من السكان بحلول عام 2035. يعد الكشف المبكر عن الحالات باستخدام أدوات تشخيص أفضل وتدابير الصحة العامة استراتيجيات مهمة للوقاية والمكافحة لتحقيق الهدف المقترح وتقليل عبء السل في البلاد.

Translated Description (French)

Contexte Décider systématiquement de son étendue actuelle et des éléments probables de la tuberculose (TB) à tous les niveaux des contextes cliniques contribue à l'anticipation et au contrôle de la maladie. En Éthiopie, des informations à jour sont toujours nécessaires à tous les niveaux de soins de santé et dans différents groupes à risque pour surveiller les performances du programme national, qui vise à atteindre l'objectif de 2035. Par conséquent, cette étude visait à générer des données probantes supplémentaires sur l'ampleur de Mycobacterium tuberculosis en utilisant le test Gene Xpert chez les patients soupçonnés de tuberculose à l'hôpital universitaire de Mizan-Tepi, dans le sud-ouest de l'Éthiopie. Méthodes Une étude descriptive transversale a été menée de juin au 30 septembre 2021. Les données sociodémographiques et autres facteurs de risque requis ont été collectées auprès d'un total de 422 patients suspectés de tuberculose à l'aide d'un questionnaire structuré. Environ 392 échantillons pulmonaires et 30 échantillons extra-pulmonaires ont été prélevés et examinés à l'aide du test Gene Xpert-MTB/RIF. Le logiciel de paquet statistique pour les sciences sociales (SPSS) version 25 a été utilisé pour analyser les données. Résultats Dans cette étude, Mycobacterium tuberculosis a été détecté dans 12,5 % (49/392) des échantillons pulmonaires et 13,3 % (4/30) des échantillons extra-pulmonaires, donnant une positivité globale à la tuberculose de 12,6 % (53/422). Une tuberculose M. tuberculosis résistante à la rifampicine a été détectée chez 3/53 (5,7 %). Le sexe masculin (AOR : 2,54 ; IC à 95 % : 1,210, 5,354), le contact antérieur (AOR : 4,25 ; IC à 95 % : 1,790, 10,092), le tabagisme (AOR : 4,708 ; IC à 95 % : 1,004, 22,081), le fait d'être séropositif (AOR : 4,27 ; IC à 95 % : 1,606, 11,344) et la malnutrition (AOR : 3,55 ; IC à 95 % : 1,175, 10,747) étaient tous significativement associés à la détection de la M. tuberculosis à l'aide du test GeneXpert MTB/RIF. Conclusion La fréquence globale de la tuberculose maternelle dans cette étude était toujours significative dans différents groupes à risque, malgré les stratégies proposées, qui visaient à réduire la prévalence de la tuberculose à 10 pour 100 000 personnes d'ici 2035. La détection précoce des cas avec de meilleurs outils de diagnostic et des mesures de santé publique sont des stratégies importantes de prévention et de contrôle pour atteindre l'objectif proposé et réduire le fardeau de la tuberculose dans le pays.

Translated Description (Spanish)

Antecedentes Decidir constantemente su extensión actual y los elementos de probabilidad de tuberculosis (TB) en todos los niveles de entornos clínicos contribuye a la anticipación y el control de la enfermedad. En Etiopía, todavía se necesita información actualizada en todos los niveles de atención médica y en diferentes grupos de riesgo para monitorear el desempeño del programa nacional, que tiene como objetivo alcanzar el objetivo de 2035. Por lo tanto, este estudio tuvo como objetivo generar datos de evidencia adicionales sobre la magnitud de Mycobacterium tuberculosis utilizando el ensayo Gene Xpert entre pacientes sospechosos de tuberculosis en el hospital universitario universitario de Mizan-Tepi, en el suroeste de Etiopía. Métodos Se realizó un estudio descriptivo transversal desde junio hasta el 30 de septiembre de 2021. Los datos sociodemográficos y de otros factores de riesgo requeridos se recopilaron de un total de 422 pacientes con sospecha de tuberculosis utilizando un cuestionario estructurado. Se recolectaron aproximadamente 392 muestras pulmonares y 30 extrapulmonares y se examinaron utilizando el ensayo Gene Xpert-MTB/RIF. Se utilizó el software del paquete estadístico para ciencias sociales (SPSS) versión 25 para analizar los datos. Resultados En este estudio, se detectó Mycobacterium tuberculosis en el 12,5% (49/392) de las muestras pulmonares y en el 13,3% (4/30) de las muestras extrapulmonares, dando una positividad global para TB del 12,6% (53/422). Se detectó M. tuberculosis resistente a la rifampicina en 3/53 (5,7%). El sexo masculino (AOR: 2.54; IC 95%: 1.210, 5.354), el contacto previo (AOR: 4.25; IC 95%: 1.790, 10.092), fumar cigarrillos (AOR: 4.708; IC 95%: 1.004, 22.081), ser VIH positivo (AOR: 4.27; IC 95%: 1.606, 11.344) y la desnutrición (AOR: 3.55; IC 95%: 1.175, 10.747) se asociaron significativamente con la detección de M. tuberculosis utilizando el ensayo GeneXpert MTB/RIF. Conclusión La frecuencia general de M. tuberculosis en este estudio aún era significativa en diferentes grupos de riesgo, a pesar de las estrategias propuestas, que apuntaban a reducir la prevalencia de TB a tan solo 10 por cada 100.000 poblaciones para 2035. La detección temprana de casos con mejores herramientas de diagnóstico y medidas de salud pública son estrategias importantes de prevención y control para cumplir con la meta propuesta y reducir la carga de TB en el país.

Files

journal.pone.0277536&type=printable.pdf

Files (504.0 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:61810f17e0881fefd7fecdfeffd2f338
504.0 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
الكشف عن المتفطرة السلية باستخدام مقايسة جين Xpert - MTB/RIF بين المرضى المشتبه في إصابتهم بالسل في مستشفى ميزان تيبي التعليمي الجامعي، جنوب غرب إثيوبيا: دراسة مستعرضة قائمة على المؤسسة
Translated title (French)
Détection de Mycobacterium tuberculosis à l'aide du test Gene Xpert-MTB/RIF chez des patients suspectés de tuberculose à l'hôpital universitaire de Mizan-Tepi, dans le sud-ouest de l'Éthiopie : une étude transversale en établissement
Translated title (Spanish)
Detección de Mycobacterium tuberculosis utilizando el ensayo Gene Xpert-MTB/RIF entre pacientes sospechosos de tuberculosis en el hospital universitario universitario de Mizan-Tepi, suroeste de Etiopía: un estudio transversal basado en instituciones

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4309865623
DOI
10.1371/journal.pone.0277536

Is supplement to
https://openalex.org/W4308058527 (Other)
https://openalex.org/W4210506554 (Other)
https://openalex.org/W3195196921 (Other)
https://openalex.org/W3174246457 (Other)
https://openalex.org/W2984213045 (Other)
https://openalex.org/W2972094210 (Other)
https://openalex.org/W2399168760 (Other)
https://openalex.org/W2110949356 (Other)
https://openalex.org/W2042252940 (Other)
https://openalex.org/W1951790984 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Ethiopia

References

  • https://openalex.org/W1551451874
  • https://openalex.org/W2040957894
  • https://openalex.org/W2071037255
  • https://openalex.org/W2101107021
  • https://openalex.org/W2104101804
  • https://openalex.org/W2106682613
  • https://openalex.org/W2115377212
  • https://openalex.org/W2186846609
  • https://openalex.org/W2262434061
  • https://openalex.org/W2569995993
  • https://openalex.org/W2595247007
  • https://openalex.org/W2601777691
  • https://openalex.org/W2623705438
  • https://openalex.org/W2755410471
  • https://openalex.org/W2791694032
  • https://openalex.org/W2796076716
  • https://openalex.org/W2797955530
  • https://openalex.org/W2805628514
  • https://openalex.org/W2807834910
  • https://openalex.org/W2905598031
  • https://openalex.org/W2995478809
  • https://openalex.org/W2997614587
  • https://openalex.org/W3011475793
  • https://openalex.org/W3027613417
  • https://openalex.org/W3048650890
  • https://openalex.org/W3082922718
  • https://openalex.org/W3090193591
  • https://openalex.org/W3143171746
  • https://openalex.org/W3200475168
  • https://openalex.org/W3203118177
  • https://openalex.org/W4205969265
  • https://openalex.org/W4210702381
  • https://openalex.org/W4220956156
  • https://openalex.org/W4243806136