Published January 1, 2021 | Version v1
Publication Metadata-only

Re-emergence of H5N8 highly pathogenic avian influenza virus in wild birds, China

Creators

  • 1. Sichuan University
  • 2. Zhejiang University
  • 3. Guangdong Academy of Agricultural Sciences
  • 4. Ningbo University
  • 5. Capital University
  • 6. Capital Medical University
  • 7. Hunan Agricultural University
  • 8. Nanchang University
  • 9. Southwest University
  • 10. Army Medical University
  • 11. University of Chinese Academy of Sciences
  • 12. Chengdu University of Traditional Chinese Medicine
  • 13. Peking University First Hospital
  • 14. Peking University
  • 15. Peking University Cancer Hospital
  • 16. First Affiliated Hospital of Zhengzhou University
  • 17. Affiliated Hospital of Zunyi Medical College
  • 18. First Affiliated Hospital of Bengbu Medical College
  • 19. SIB Swiss Institute of Bioinformatics
  • 20. Hainan Medical University
  • 21. First Affiliated Hospital of Xi'an Jiaotong University
  • 22. Liaoning Medical University
  • 23. Chengdu Institute of Biology
  • 24. Beijing Institute of Genomics
  • 25. Anhui Academy of Agricultural Sciences
  • 26. University of Electronic Science and Technology of China
  • 27. University of Bern
  • 28. University of Science and Technology of China
  • 29. Sun Yat-sen University
  • 30. Xi'an University of Science and Technology
  • 31. Mongolian University of Science and Technology
  • 32. Shanghai Veterinary Research Institute
  • 33. Northern Jiangsu People's Hospital
  • 34. Dalian Medical University
  • 35. Tang Du Hospital
  • 36. Central South University
  • 37. Second Xiangya Hospital of Central South University
  • 38. Southwest General Health Center
  • 39. Southwest Hospital
  • 40. Nanjing Medical University
  • 41. California University of Pennsylvania
  • 42. University of Tennessee Health Science Center
  • 43. Nanjing University of Chinese Medicine
  • 44. Sichuan Agricultural University
  • 45. China Three Gorges University
  • 46. Xi'an Jiaotong University
  • 47. Shandong Agricultural University
  • 48. Affiliated Hospital of Southwest Medical University
  • 49. Yichang Central People's Hospital

Description

In mid-November 2020, deaths of whooper swan were reported in the Yellow River Reservoir Area, China. In the present study, we describe the genetic characterizations and phylogenetic relationships of four clade 2.3.4.4b H5N8 highly avian influenza viruses (HPAIVs) identified from a sick whooper swan and environmental samples collected in the Yellow River Reservoir Area in late November 2020. They were closely related to recent H5Nx HPAIVs causing outbreaks in Eurasia in the 2020-2021 influenza season, suggesting these isolates might be imported into China via migratory birds. The newly identified H5N8 HPAIVs possessed Q226 and G228 (H3 numbering), indicating that they prefer to avian-like receptors. However, they had three mutations falling within known antigenic regions, including T144A in antigenic region A, T192I in antigenic region B, and N240D in antigenic region D. Our study highlights the risk of the rapid global spread of H5N8 HPAIVs and the necessity for continuous monitoring of avian influenza viruses in wild birds.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

في منتصف نوفمبر 2020، تم الإبلاغ عن وفاة بجعة منظمة الصحة العالمية في منطقة خزان النهر الأصفر، الصين. في هذه الدراسة، نصف الخصائص الجينية والعلاقات الوراثية لأربعة فيروسات إنفلونزا الطيور عالية الخطورة H5N8 (HPAIVs) التي تم تحديدها من بجعة مريضة وعينات بيئية تم جمعها في منطقة خزان النهر الأصفر في أواخر نوفمبر 2020. كانت مرتبطة ارتباطًا وثيقًا بفيروسات نقص المناعة البشرية H5Nx الأخيرة التي تسببت في تفشي المرض في أوراسيا في موسم الأنفلونزا 2020-2021، مما يشير إلى أن هذه العزلات قد يتم استيرادها إلى الصين عبر الطيور المهاجرة. تمتلك H5N8 HPAIVs التي تم تحديدها حديثًا Q226 و G228 (ترقيم H3)، مما يشير إلى أنها تفضل المستقبلات الشبيهة بالطيور. ومع ذلك، كان لديهم ثلاث طفرات تقع ضمن المناطق المستضدية المعروفة، بما في ذلك T144A في المنطقة المستضدية A، و T192I في المنطقة المستضدية B، و N240D في المنطقة المستضدية D. تسلط دراستنا الضوء على خطر الانتشار العالمي السريع لفيروس H5N8 HPAIVs وضرورة المراقبة المستمرة لفيروسات أنفلونزا الطيور في الطيور البرية.

Translated Description (French)

À la mi-novembre 2020, des décès de cygnes pèlerins ont été signalés dans la région du réservoir du fleuve Jaune, en Chine. Dans la présente étude, nous décrivons les caractérisations génétiques et les relations phylogénétiques de quatre clades 2.3.4.4b H5N8 hautement virus de la grippe aviaire (HPAIV) identifiés à partir d'un cygne opére malade et d'échantillons environnementaux prélevés dans la région du réservoir du fleuve Jaune à la fin de novembre 2020. Ils étaient étroitement liés aux HPAIV H5Nx récents causant des épidémies en Eurasie au cours de la saison grippale 2020-2021, ce qui suggère que ces isolats pourraient être importés en Chine via des oiseaux migrateurs. Les HPAIV H5N8 nouvellement identifiés possédaient Q226 et G228 (numérotation H3), ce qui indique qu'ils préfèrent les récepteurs de type aviaire. Cependant, ils présentaient trois mutations relevant de régions antigéniques connues, dont T144A dans la région antigénique A, T192I dans la région antigénique B et N240D dans la région antigénique D. Notre étude met en évidence le risque de propagation mondiale rapide des HPAIV H5N8 et la nécessité d'une surveillance continue des virus de la grippe aviaire chez les oiseaux sauvages.

Translated Description (Spanish)

A mediados de noviembre de 2020, se reportaron muertes de cisnes cantores en el área del embalse del río Amarillo, China. En el presente estudio, describimos las caracterizaciones genéticas y las relaciones filogenéticas de cuatro virus de influenza altamente aviar (HPAIV) H5N8 de clado 2.3.4.4b identificados a partir de un cisne silbador enfermo y muestras ambientales recolectadas en el área del embalse del río Amarillo a fines de noviembre de 2020. Estaban estrechamente relacionados con los recientes H5Nx HPAIV que causaron brotes en Eurasia en la temporada de influenza 2020-2021, lo que sugiere que estos aislados podrían importarse a China a través de aves migratorias. Los HPAIV H5N8 recién identificados poseían Q226 y G228 (numeración H3), lo que indica que prefieren los receptores de tipo aviar. Sin embargo, tenían tres mutaciones que caían dentro de regiones antigénicas conocidas, incluyendo T144A en la región antigénica A, T192I en la región antigénica B y N240D en la región antigénica D. Nuestro estudio destaca el riesgo de la rápida propagación global de los HPAIV H5N8 y la necesidad de un monitoreo continuo de los virus de la influenza aviar en aves silvestres.

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
عودة ظهور فيروس إنفلونزا الطيور عالي الإمراض H5N8 في الطيور البرية، الصين
Translated title (French)
Ré-émergence du virus de la grippe aviaire hautement pathogène H5N8 chez les oiseaux sauvages, Chine
Translated title (Spanish)
Resurgimiento del virus de la gripe aviar altamente patógeno H5N8 en aves silvestres, China

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4394511139
DOI
10.6084/m9.figshare.15172414

Is supplement to
https://openalex.org/W4394166819 (Other)
https://openalex.org/W4384037835 (Other)
https://openalex.org/W4299667146 (Other)
https://openalex.org/W2606607766 (Other)
https://openalex.org/W2586895441 (Other)
https://openalex.org/W2423634313 (Other)
https://openalex.org/W2411554373 (Other)
https://openalex.org/W2302576476 (Other)
https://openalex.org/W1974150316 (Other)
https://openalex.org/W1553543121 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China