Published July 29, 2022 | Version v1
Publication Open

ActinoBase: tools and protocols for researchers working on Streptomyces and other filamentous actinobacteria

Creators

  • 1. University of Strathclyde
  • 2. John Innes Centre
  • 3. Swansea University
  • 4. Haverford College
  • 5. Leibniz Institute DSMZ – German Collection of Microorganisms and Cell Cultures
  • 6. Siriraj Hospital
  • 7. Mahidol University
  • 8. Lawrence Berkeley National Laboratory
  • 9. Joint Genome Institute
  • 10. Max Planck Institute for Chemical Ecology
  • 11. Edge Hill University
  • 12. Queen Mary University of London
  • 13. Norwich Research Park
  • 14. University of Leeds
  • 15. Universidad Nacional Autónoma de México
  • 16. Federico Santa María Technical University
  • 17. Wageningen University & Research
  • 18. Leiden University
  • 19. University of East Anglia

Description

Actinobacteria is an ancient phylum of Gram-positive bacteria with a characteristic high GC content to their DNA. The ActinoBase Wiki is focused on the filamentous actinobacteria, such as Streptomyces species, and the techniques and growth conditions used to study them. These organisms are studied because of their complex developmental life cycles and diverse specialised metabolism which produces many of the antibiotics currently used in the clinic. ActinoBase is a community effort that provides valuable and freely accessible resources, including protocols and practical information about filamentous actinobacteria. It is aimed at enabling knowledge exchange between members of the international research community working with these fascinating bacteria. ActinoBase is an anchor platform that underpins worldwide efforts to understand the ecology, biology and metabolic potential of these organisms. There are two key differences that set ActinoBase apart from other Wiki-based platforms: [] ActinoBase is specifically aimed at researchers working on filamentous actinobacteria and is tailored to help users overcome challenges working with these bacteria and [] it provides a freely accessible resource with global networking opportunities for researchers with a broad range of experience in this field.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

الشعاعية هي شعبة قديمة من البكتيريا إيجابية الجرام ذات محتوى GC عالٍ مميز لحمضها النووي. يركز ActinoBase Wiki على البكتيريا الشعاعية الخيطية، مثل أنواع السلسليات، والتقنيات وظروف النمو المستخدمة لدراستها. تتم دراسة هذه الكائنات الحية بسبب دورات حياتها التنموية المعقدة والتمثيل الغذائي المتخصص المتنوع الذي ينتج العديد من المضادات الحيوية المستخدمة حاليًا في العيادة. ActinoBase هو جهد مجتمعي يوفر موارد قيمة ويمكن الوصول إليها مجانًا، بما في ذلك البروتوكولات والمعلومات العملية حول البكتيريا الشعاعية الخيطية. ويهدف إلى تمكين تبادل المعرفة بين أعضاء مجتمع البحث الدولي الذين يعملون مع هذه البكتيريا الرائعة. ActinoBase هي منصة ارتكاز تدعم الجهود العالمية لفهم البيئة والبيولوجيا والإمكانات الأيضية لهذه الكائنات الحية. هناك اختلافان رئيسيان يميزان ActinoBase عن المنصات الأخرى القائمة على ويكي: [] يستهدف ActinoBase على وجه التحديد الباحثين الذين يعملون على البكتيريا الشعاعية الخيطية وهو مصمم لمساعدة المستخدمين على التغلب على التحديات التي تواجه العمل مع هذه البكتيريا و [] يوفر موردًا يمكن الوصول إليه مجانًا مع فرص التواصل العالمية للباحثين الذين لديهم مجموعة واسعة من الخبرة في هذا المجال.

Translated Description (French)

Les Actinobactéries sont un ancien phylum de bactéries à Gram positif avec une teneur en GC élevée caractéristique de leur ADN. Le Wiki ActinoBase se concentre sur les actinobactéries filamenteuses, telles que les espèces de Streptomyces, ainsi que sur les techniques et les conditions de croissance utilisées pour les étudier. Ces organismes sont étudiés en raison de leurs cycles de développement complexes et de leur métabolisme spécialisé diversifié qui produit bon nombre des antibiotiques actuellement utilisés en clinique. ActinoBase est un effort communautaire qui fournit des ressources précieuses et librement accessibles, y compris des protocoles et des informations pratiques sur les actinobactéries filamenteuses. Il vise à permettre l'échange de connaissances entre les membres de la communauté internationale de recherche travaillant avec ces bactéries fascinantes. ActinoBase est une plate-forme d'ancrage qui sous-tend les efforts mondiaux visant à comprendre l'écologie, la biologie et le potentiel métabolique de ces organismes. Il y a deux différences clés qui distinguent ActinoBase des autres plateformes basées sur Wiki : [] ActinoBase est spécifiquement destiné aux chercheurs travaillant sur les actinobactéries filamenteuses et est conçu pour aider les utilisateurs à surmonter les défis liés à ces bactéries et [] il fournit une ressource librement accessible avec des possibilités de réseautage mondial pour les chercheurs ayant une vaste expérience dans ce domaine.

Translated Description (Spanish)

Las actinobacterias son un antiguo filo de bacterias Gram-positivas con un alto contenido característico de GC en su ADN. La Wiki de ActinoBase se centra en las actinobacterias filamentosas, como las especies de Streptomyces, y las técnicas y condiciones de crecimiento utilizadas para estudiarlas. Estos organismos se estudian debido a sus complejos ciclos de vida de desarrollo y a su metabolismo especializado diverso que produce muchos de los antibióticos que se utilizan actualmente en la clínica. ActinoBase es un esfuerzo comunitario que proporciona recursos valiosos y de libre acceso, incluidos protocolos e información práctica sobre las actinobacterias filamentosas. Su objetivo es permitir el intercambio de conocimientos entre los miembros de la comunidad de investigación internacional que trabajan con estas fascinantes bacterias. ActinoBase es una plataforma ancla que sustenta los esfuerzos mundiales para comprender la ecología, la biología y el potencial metabólico de estos organismos. Hay dos diferencias clave que diferencian a ActinoBase de otras plataformas basadas en Wiki: [] ActinoBase está dirigido específicamente a investigadores que trabajan con actinobacterias filamentosas y está diseñado para ayudar a los usuarios a superar los desafíos que enfrentan al trabajar con estas bacterias y [] proporciona un recurso de libre acceso con oportunidades de redes globales para investigadores con una amplia gama de experiencia en este campo.

Files

qt1435v4tb.pdf.pdf

Files (3.0 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:2745f6bebb6c71c984ec4ca2c70e6bee
3.0 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
ActinoBase: أدوات وبروتوكولات للباحثين الذين يعملون على البكتيريا المتسلسلة وغيرها من البكتيريا الشعاعية الخيطية
Translated title (French)
ActinoBase : outils et protocoles pour les chercheurs travaillant sur les Streptomyces et autres actinobactéries filamenteuses
Translated title (Spanish)
ActinoBase: herramientas y protocolos para investigadores que trabajan con Streptomyces y otras actinobacterias filamentosas

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4283755603
DOI
10.1099/mgen.0.000824

Is supplement to
https://openalex.org/W3205959768 (Other)
https://openalex.org/W3101385749 (Other)
https://openalex.org/W2893987205 (Other)
https://openalex.org/W2389971160 (Other)
https://openalex.org/W2343470804 (Other)
https://openalex.org/W2329998112 (Other)
https://openalex.org/W2274972366 (Other)
https://openalex.org/W2082608458 (Other)
https://openalex.org/W2038344900 (Other)
https://openalex.org/W1999517934 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Mexico

References

  • https://openalex.org/W103918513
  • https://openalex.org/W1827213771
  • https://openalex.org/W1878234215
  • https://openalex.org/W1963617229
  • https://openalex.org/W1967408138
  • https://openalex.org/W1973831267
  • https://openalex.org/W1979320224
  • https://openalex.org/W1988321419
  • https://openalex.org/W1991104086
  • https://openalex.org/W2009257824
  • https://openalex.org/W2012960603
  • https://openalex.org/W2039684818
  • https://openalex.org/W2040620804
  • https://openalex.org/W2046364391
  • https://openalex.org/W2061131070
  • https://openalex.org/W2069305293
  • https://openalex.org/W2081418090
  • https://openalex.org/W2097613285
  • https://openalex.org/W2098875065
  • https://openalex.org/W2117960631
  • https://openalex.org/W2124445891
  • https://openalex.org/W2129203537
  • https://openalex.org/W2135639274
  • https://openalex.org/W2145151319
  • https://openalex.org/W2153584471
  • https://openalex.org/W2153616142
  • https://openalex.org/W2169360236
  • https://openalex.org/W2171019396
  • https://openalex.org/W2176344978
  • https://openalex.org/W2178324140
  • https://openalex.org/W2286338990
  • https://openalex.org/W2314425775
  • https://openalex.org/W2397457481
  • https://openalex.org/W2504691963
  • https://openalex.org/W2558649940
  • https://openalex.org/W2588027486
  • https://openalex.org/W2609519162
  • https://openalex.org/W2614151742
  • https://openalex.org/W2745396386
  • https://openalex.org/W2747311934
  • https://openalex.org/W2751226973
  • https://openalex.org/W2769936619
  • https://openalex.org/W2782147921
  • https://openalex.org/W2783462922
  • https://openalex.org/W2793787203
  • https://openalex.org/W2807085637
  • https://openalex.org/W2894690081
  • https://openalex.org/W2938111698
  • https://openalex.org/W2966493740
  • https://openalex.org/W2980832688
  • https://openalex.org/W2989135569
  • https://openalex.org/W2990471452
  • https://openalex.org/W3005484068
  • https://openalex.org/W3006073147
  • https://openalex.org/W3029444563
  • https://openalex.org/W3029538041
  • https://openalex.org/W3036223538
  • https://openalex.org/W3036947514
  • https://openalex.org/W3042012321
  • https://openalex.org/W3045543797
  • https://openalex.org/W3091334475
  • https://openalex.org/W3094587155
  • https://openalex.org/W3096851604
  • https://openalex.org/W3121081543
  • https://openalex.org/W3126868404
  • https://openalex.org/W3131765257
  • https://openalex.org/W3133711327
  • https://openalex.org/W3158208374
  • https://openalex.org/W3161596995
  • https://openalex.org/W3165039205
  • https://openalex.org/W3177278914
  • https://openalex.org/W3185588022
  • https://openalex.org/W3186085547
  • https://openalex.org/W3196903026
  • https://openalex.org/W3198640888
  • https://openalex.org/W3201392948
  • https://openalex.org/W3208177399
  • https://openalex.org/W3214494638
  • https://openalex.org/W4238526656
  • https://openalex.org/W4388228893
  • https://openalex.org/W598145491