Published June 24, 2024 | Version v1
Publication Open

Preliminary profile of the gut microbiota from amerindians in the Brazilian amazon experiencing a process of transition to urbanization

Creators

  • 1. Universidade do Estado do Amazonas
  • 2. Universidad de Antioquia
  • 3. Universidade Federal do Amazonas

Description

Abstract The Yanomami are one of the oldest indigenous tribes in the Amazon and are direct descendants of the first people to colonize South America 12,000 years ago. They are located on the border between Venezuela and Brazil, with the Venezuelan side remaining uncontacted. While they maintain a hunter-gatherer society, they are currently experiencing contact with urbanized populations in Brazil. The human gut microbiota of traditional communities has become the subject of recent studies due to the Westernization of their diet and the introduction of antibiotics and other chemicals, which have affected microbial diversity in indigenous populations, thereby threatening their existence. In this study, we preliminarily characterized the diversity of the gut microbiota of the Yanomami, a hunter-gatherer society from the Amazon, experiencing contact with urbanized populations. Similarly, we compared their diversity with the population in Manaus, Amazonas. A metabarcoding approach of the 16 S rRNA gene was carried out on fecal samples. Differences were found between the two populations, particularly regarding the abundance of genera (e.g., Prevotella and Bacteroides ) and the higher values of the phyla Bacteroidetes over Firmicutes, which were significant only in the Yanomami. Some bacteria were found exclusively in the Yanomami ( Treponema and Succinivibrio ). However, diversity was statistically equal between them. In conclusion, the composition of the Yanomami gut microbiota still maintains the profile characteristic of a community with a traditional lifestyle. However, our results suggest an underlying Westernization process of the Yanomami microbiota when compared with that of Manaus, which must be carefully monitored by authorities, as the loss of diversity can be a sign of growing danger to the health of the Yanomami.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

يانومامي هي واحدة من أقدم القبائل الأصلية في الأمازون وهي أحفاد مباشرة من أول الناس الذين استعمروا أمريكا الجنوبية قبل 12000 سنة. وهي تقع على الحدود بين فنزويلا والبرازيل، مع بقاء الجانب الفنزويلي دون اتصال. في حين أنهم يحافظون على مجتمع الصيد وجمع الثمار، فإنهم يواجهون حاليًا اتصالًا بالسكان المتحضرين في البرازيل. أصبحت ميكروبات الأمعاء البشرية في المجتمعات التقليدية موضوع دراسات حديثة بسبب تغريب نظامهم الغذائي وإدخال المضادات الحيوية والمواد الكيميائية الأخرى، والتي أثرت على التنوع الميكروبي في السكان الأصليين، مما يهدد وجودهم. في هذه الدراسة، وصفنا مبدئيًا تنوع ميكروبات الأمعاء في يانومامي، وهو مجتمع صياد وجامع من الأمازون، يعاني من الاتصال بالسكان المتحضرين. وبالمثل، قارنا تنوعهم مع السكان في ماناوس وأمازوناس. تم تنفيذ نهج الترميز التلوي لجين 16 S rRNA على عينات البراز. تم العثور على اختلافات بين المجموعتين، لا سيما فيما يتعلق بوفرة الأجناس (على سبيل المثال، Prevotella و Bacteroides ) والقيم الأعلى لشعب Bacteroidetes على Firmicutes، والتي كانت مهمة فقط في Yanomami. تم العثور على بعض البكتيريا حصريًا في Yanomami ( Treponema و Succinivibrio ). ومع ذلك، كان التنوع متساويًا إحصائيًا بينهما. في الختام، لا يزال تكوين ميكروبات الأمعاء يانومامي يحافظ على السمة المميزة للمجتمع مع نمط الحياة التقليدي. ومع ذلك، تشير نتائجنا إلى وجود عملية تغريب أساسية للميكروبات اليانومامية عند مقارنتها بعملية ماناوس، والتي يجب مراقبتها بعناية من قبل السلطات، حيث يمكن أن يكون فقدان التنوع علامة على الخطر المتزايد على صحة اليانومامي.

Translated Description (French)

Résumé Les Yanomami sont l'une des plus anciennes tribus indigènes de l'Amazonie et sont les descendants directs des premiers peuples à coloniser l'Amérique du Sud il y a 12 000 ans. Ils sont situés à la frontière entre le Venezuela et le Brésil, le côté vénézuélien n'étant pas contacté. Bien qu'ils maintiennent une société de chasseurs-cueilleurs, ils sont actuellement en contact avec des populations urbanisées au Brésil. Le microbiote intestinal humain des communautés traditionnelles est devenu l'objet d'études récentes en raison de l'occidentalisation de leur alimentation et de l'introduction d'antibiotiques et d'autres produits chimiques, qui ont affecté la diversité microbienne des populations autochtones, menaçant ainsi leur existence. Dans cette étude, nous avons préalablement caractérisé la diversité du microbiote intestinal des Yanomami, une société de chasseurs-cueilleurs d'Amazonie, en contact avec des populations urbanisées. De même, nous avons comparé leur diversité avec la population de Manaus, Amazonas. Une approche de métabarcodage du gène de l'ARNr 16 S a été réalisée sur des échantillons fécaux. Des différences ont été trouvées entre les deux populations, en particulier en ce qui concerne l'abondance des genres (par exemple, Prevotella et Bacteroides ) et les valeurs plus élevées des phyla Bacteroidetes par rapport aux Firmicutes, qui n'étaient significatives que chez les Yanomami. Certaines bactéries ont été trouvées exclusivement chez les Yanomami ( Treponema et Succinivibrio ). Cependant, la diversité était statistiquement égale entre eux. En conclusion, la composition du microbiote intestinal yanomami conserve toujours le profil caractéristique d'une communauté au mode de vie traditionnel. Cependant, nos résultats suggèrent un processus d'occidentalisation sous-jacent du microbiote Yanomami par rapport à celui de Manaus, qui doit être soigneusement surveillé par les autorités, car la perte de diversité peut être un signe de danger croissant pour la santé des Yanomami.

Translated Description (Spanish)

Resumen Los yanomami son una de las tribus indígenas más antiguas de la Amazonía y son descendientes directos de los primeros pueblos que colonizaron América del Sur hace 12.000 años. Se encuentran en la frontera entre Venezuela y Brasil, y el lado venezolano permanece sin contacto. Si bien mantienen una sociedad de cazadores-recolectores, actualmente están experimentando contacto con poblaciones urbanizadas en Brasil. La microbiota intestinal humana de las comunidades tradicionales se ha convertido en objeto de estudios recientes debido a la occidentalización de su dieta y la introducción de antibióticos y otros productos químicos, que han afectado a la diversidad microbiana en las poblaciones indígenas, amenazando así su existencia. En este estudio, caracterizamos preliminarmente la diversidad de la microbiota intestinal de los yanomami, una sociedad cazadora-recolectora de la Amazonía, que experimenta contacto con poblaciones urbanizadas. Del mismo modo, comparamos su diversidad con la población de Manaos, Amazonas. Se llevó a cabo un enfoque de metabarcodificación del gen ARNr 16S en muestras fecales. Se encontraron diferencias entre las dos poblaciones, particularmente con respecto a la abundancia de géneros (por ejemplo, Prevotella y Bacteroides ) y los valores más altos de los filos Bacteroidetes sobre Firmicutes, que fueron significativos solo en los Yanomami. Algunas bacterias se encontraron exclusivamente en los yanomamis ( Treponema y Succinivibrio ). Sin embargo, la diversidad fue estadísticamente igual entre ellos. En conclusión, la composición de la microbiota intestinal yanomami aún mantiene el perfil característico de una comunidad con un estilo de vida tradicional. Sin embargo, nuestros resultados sugieren un proceso de occidentalización subyacente de la microbiota yanomami en comparación con la de Manaos, que debe ser monitoreado cuidadosamente por las autoridades, ya que la pérdida de diversidad puede ser un signo de peligro creciente para la salud de los yanomami.

Files

s42770-024-01413-y.pdf.pdf

Files (2.1 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:d04816a57df77ce6a458ca931c0544b2
2.1 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
لمحة أولية عن ميكروبات الأمعاء من الأمريكيين الهنود في الأمازون البرازيلية التي تشهد عملية انتقال إلى التحضر
Translated title (French)
Profil préliminaire du microbiote intestinal des amérindiens de l'Amazonie brésilienne connaissant un processus de transition vers l'urbanisation
Translated title (Spanish)
Perfil preliminar de la microbiota intestinal de amerindios en la Amazonía brasileña que experimentan un proceso de transición a la urbanización

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4399984323
DOI
10.1007/s42770-024-01413-y

Is supplement to
https://openalex.org/W4390656209 (Other)
https://openalex.org/W4386433098 (Other)
https://openalex.org/W4303513085 (Other)
https://openalex.org/W4297229565 (Other)
https://openalex.org/W4285403534 (Other)
https://openalex.org/W4283214186 (Other)
https://openalex.org/W4228997719 (Other)
https://openalex.org/W4225412360 (Other)
https://openalex.org/W2810219534 (Other)
https://openalex.org/W2586581525 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Colombia

References

  • https://openalex.org/W1492645879
  • https://openalex.org/W1568043102
  • https://openalex.org/W1975274499
  • https://openalex.org/W1981504305
  • https://openalex.org/W1986189475
  • https://openalex.org/W1989496014
  • https://openalex.org/W2034285706
  • https://openalex.org/W2054385769
  • https://openalex.org/W2056386675
  • https://openalex.org/W2063890406
  • https://openalex.org/W2087278385
  • https://openalex.org/W2087292184
  • https://openalex.org/W2090942483
  • https://openalex.org/W2108718991
  • https://openalex.org/W2112874908
  • https://openalex.org/W2121180999
  • https://openalex.org/W2131415145
  • https://openalex.org/W2162088497
  • https://openalex.org/W2166562121
  • https://openalex.org/W2182173958
  • https://openalex.org/W2194503930
  • https://openalex.org/W2216205109
  • https://openalex.org/W2228952520
  • https://openalex.org/W2279707184
  • https://openalex.org/W2568858948
  • https://openalex.org/W2602405366
  • https://openalex.org/W2672405828
  • https://openalex.org/W2750417371
  • https://openalex.org/W2756224199
  • https://openalex.org/W2804951666
  • https://openalex.org/W2806641979
  • https://openalex.org/W2808457437
  • https://openalex.org/W2889134937
  • https://openalex.org/W2899495835
  • https://openalex.org/W2961496917
  • https://openalex.org/W2974706910
  • https://openalex.org/W3027118763
  • https://openalex.org/W3213236775
  • https://openalex.org/W4322741414