Published February 27, 2019
| Version v1
Publication
Open
Association of rodent-borne Leptospira spp. with urban environments in Malaysian Borneo
- 1. Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation
- 2. Kasetsart University
- 3. Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement
- 4. Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier
- 5. Universiti Malaysia Sarawak
- 6. University of Melbourne
Description
Although leptospirosis is traditionally considered a disease of rural, agricultural and flooded environments, Leptospira spp. are found in a range of habitats and infect numerous host species, with rodents among the most significant reservoirs and vectors. To explore the local ecology of Leptospira spp. in a city experiencing rapid urbanization, we assessed Leptospira prevalence in rodents from three locations in Malaysian Borneo with differing levels of anthropogenic influence: 1) high but stable influence (urban); 2) moderate yet increasing (developing); and 3) low (rural). A total of 116 urban, 122 developing and 78 rural rodents were sampled, with the majority of individuals assigned to either the Rattus rattus lineage R3 (n = 165) or Sundamys muelleri (n = 100). Leptospira spp. DNA was detected in 31.6% of all rodents, with more urban rodents positive (44.8%), than developing (32.0%) or rural rodents (28.1%), and these differences were statistically significant. The majority of positive samples were identified by sequence comparison to belong to known human pathogens L. interrogans (n = 57) and L. borgpetersenii (n = 38). Statistical analyses revealed that both Leptospira species occurred more commonly at sites with higher anthropogenic influence, particularly those with a combination of commercial and residential activity, while L. interrogans infection was also associated with low forest cover, and L. borgpetersenii was more likely to be identified at sites without natural bodies of water. This study suggests that some features associated with urbanization may promote the circulation of Leptospira spp., resulting in a potential public health risk in cities that may be substantially underestimated.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
على الرغم من أن داء البريميات يعتبر تقليديًا مرضًا في البيئات الريفية والزراعية والفيضانية، إلا أن Leptospira spp. توجد في مجموعة من الموائل وتصيب العديد من الأنواع المضيفة، مع القوارض من بين أهم الخزانات والناقلات. ولاستكشاف البيئة المحلية للبريموبيرا. في مدينة تشهد تحضرًا سريعًا، قمنا بتقييم انتشار البريموبيرا في القوارض من ثلاثة مواقع في بورنيو الماليزية بمستويات مختلفة من التأثير البشري المنشأ: 1) تأثير مرتفع ولكنه مستقر (حضري )؛ 2) معتدل ولكنه متزايد (متطور )؛ و 3) منخفض (ريفي). تم أخذ عينات من 116 قارضًا حضريًا و 122 قارضًا نامياً و 78 قارضًا ريفيًا، مع تعيين غالبية الأفراد إما إلى سلالة Rattus rattus R3 (العدد = 165) أو Sundamys muelleri (العدد = 100). تم اكتشاف الحمض النووي لليبتوسبيرا في 31.6 ٪ من جميع القوارض، مع وجود قوارض حضرية أكثر إيجابية (44.8 ٪)، من القوارض النامية (32.0 ٪) أو القوارض الريفية (28.1 ٪)، وكانت هذه الاختلافات ذات دلالة إحصائية. تم تحديد غالبية العينات الإيجابية من خلال مقارنة التسلسل للانتماء إلى مسببات الأمراض البشرية المعروفة L. interrogans (n = 57) و L. borgpetersenii (n = 38). كشفت التحليلات الإحصائية أن كلا النوعين من Leptospira يحدثان بشكل أكثر شيوعًا في المواقع ذات التأثير البشري الأعلى، لا سيما تلك التي تحتوي على مزيج من النشاط التجاري والسكني، في حين ارتبطت عدوى L. interrogans أيضًا بالغطاء الحرجي المنخفض، وكان من المرجح تحديد L. borgpetersenii في المواقع التي لا تحتوي على مسطحات مائية طبيعية. تشير هذه الدراسة إلى أن بعض الميزات المرتبطة بالتحضر قد تعزز دوران Leptospira spp.، مما يؤدي إلى مخاطر محتملة على الصحة العامة في المدن قد يتم التقليل من شأنها إلى حد كبير.Translated Description (French)
Bien que la leptospirose soit traditionnellement considérée comme une maladie des milieux ruraux, agricoles et inondés, les Leptospira spp. se trouvent dans une gamme d'habitats et infectent de nombreuses espèces hôtes, les rongeurs étant parmi les réservoirs et les vecteurs les plus importants. Pour explorer l'écologie locale de Leptospira spp. dans une ville connaissant une urbanisation rapide, nous avons évalué la prévalence de Leptospira chez les rongeurs de trois endroits de Bornéo malaisien avec différents niveaux d'influence anthropique : 1) influence élevée mais stable (urbaine) ; 2) modérée mais croissante (en développement) ; et 3) faible (rurale). Au total, 116 rongeurs urbains, 122 rongeurs en développement et 78 rongeurs ruraux ont été échantillonnés, la majorité des individus étant affectés à la lignée Rattus rattus R3 (n = 165) ou Sundamys muelleri (n = 100). L'ADN de Leptospira spp. a été détecté chez 31,6 % de tous les rongeurs, avec plus de rongeurs urbains positifs (44,8 %) que de rongeurs en développement (32,0 %) ou ruraux (28,1 %), et ces différences étaient statistiquement significatives. La majorité des échantillons positifs ont été identifiés par comparaison de séquences comme appartenant à des pathogènes humains connus L. interrogans (n = 57) et L. borgpetersenii (n = 38). Les analyses statistiques ont révélé que les deux espèces de Leptospira se produisaient plus fréquemment dans les sites à forte influence anthropique, en particulier ceux qui combinaient une activité commerciale et résidentielle, tandis que l'infection par L. interrogans était également associée à un faible couvert forestier et que L. borgpetersenii était plus susceptible d'être identifié dans les sites sans plans d'eau naturels. Cette étude suggère que certaines caractéristiques associées à l'urbanisation peuvent favoriser la circulation de Leptospira spp., entraînant un risque potentiel pour la santé publique dans les villes qui peut être considérablement sous-estimé.Translated Description (Spanish)
Aunque la leptospirosis se considera tradicionalmente una enfermedad de entornos rurales, agrícolas e inundados, Leptospira spp. se encuentra en una variedad de hábitats e infecta a numerosas especies huésped, y los roedores se encuentran entre los reservorios y vectores más importantes. Para explorar la ecología local de Leptospira spp. en una ciudad que experimenta una rápida urbanización, evaluamos la prevalencia de Leptospira en roedores de tres ubicaciones en el Borneo malasio con diferentes niveles de influencia antropogénica: 1) influencia alta pero estable (urbana); 2) moderada pero creciente (en desarrollo); y 3) baja (rural). Se muestreó un total de 116 roedores urbanos, 122 en desarrollo y 78 rurales, con la mayoría de los individuos asignados al linaje R3 de Rattus rattus (n = 165) o Sundamys muelleri (n = 100). El ADN de Leptospira spp. se detectó en el 31,6% de todos los roedores, con más roedores urbanos positivos (44,8%) que en desarrollo (32,0%) o rurales (28,1%), y estas diferencias fueron estadísticamente significativas. La mayoría de las muestras positivas se identificaron por comparación de secuencias como pertenecientes a patógenos humanos conocidos L. interrogans (n = 57) y L. borgpetersenii (n = 38). Los análisis estadísticos revelaron que ambas especies de Leptospira ocurrían con mayor frecuencia en sitios con mayor influencia antropogénica, particularmente aquellos con una combinación de actividad comercial y residencial, mientras que la infección por L. interrogans también se asoció con una baja cobertura forestal, y L. borgpetersenii era más probable que se identificara en sitios sin cuerpos de agua naturales. Este estudio sugiere que algunas características asociadas con la urbanización pueden promover la circulación de Leptospira spp., lo que resulta en un riesgo potencial para la salud pública en las ciudades que puede estar sustancialmente subestimado.Files
journal.pntd.0007141&type=printable.pdf
Files
(1.7 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:197eaef38e2d736b06c1369ee02d377a
|
1.7 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- جمعية Leptospira spp. التي تنقلها القوارض مع البيئات الحضرية في بورنيو الماليزية
- Translated title (French)
- Association de Leptospira spp. transmis par des rongeurs avec des environnements urbains à Bornéo en Malaisie
- Translated title (Spanish)
- Asociación de Leptospira spp. transmitida por roedores con entornos urbanos en el Borneo malasio
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2917441710
- DOI
- 10.1371/journal.pntd.0007141
References
- https://openalex.org/W1482515248
- https://openalex.org/W1508716285
- https://openalex.org/W1852893506
- https://openalex.org/W1945158892
- https://openalex.org/W1948094720
- https://openalex.org/W1951724000
- https://openalex.org/W196955888
- https://openalex.org/W1975952672
- https://openalex.org/W1981213426
- https://openalex.org/W1989086292
- https://openalex.org/W2001779636
- https://openalex.org/W2002413459
- https://openalex.org/W2008110681
- https://openalex.org/W2009974606
- https://openalex.org/W2018173130
- https://openalex.org/W2020472054
- https://openalex.org/W2021087087
- https://openalex.org/W2024154347
- https://openalex.org/W2025526060
- https://openalex.org/W2029027620
- https://openalex.org/W2030100267
- https://openalex.org/W2035682677
- https://openalex.org/W2066338054
- https://openalex.org/W2070900691
- https://openalex.org/W2077606133
- https://openalex.org/W2080152122
- https://openalex.org/W2095225833
- https://openalex.org/W2102177657
- https://openalex.org/W2110454331
- https://openalex.org/W2111489612
- https://openalex.org/W2112752075
- https://openalex.org/W2113999261
- https://openalex.org/W2116147526
- https://openalex.org/W2116515872
- https://openalex.org/W2129689919
- https://openalex.org/W2133291563
- https://openalex.org/W2137026960
- https://openalex.org/W2149537945
- https://openalex.org/W2157801459
- https://openalex.org/W2159100745
- https://openalex.org/W2200504835
- https://openalex.org/W2214058817
- https://openalex.org/W2221181085
- https://openalex.org/W2239824615
- https://openalex.org/W2252925073
- https://openalex.org/W2289497651
- https://openalex.org/W2333830755
- https://openalex.org/W2336473829
- https://openalex.org/W2393681457
- https://openalex.org/W2404248445
- https://openalex.org/W2406863113
- https://openalex.org/W2435184410
- https://openalex.org/W2549677519
- https://openalex.org/W2592986323
- https://openalex.org/W2629307679
- https://openalex.org/W2635627315
- https://openalex.org/W2734512401
- https://openalex.org/W2772473758
- https://openalex.org/W2772567288
- https://openalex.org/W2782426614
- https://openalex.org/W2889443613