Published September 9, 2009 | Version v1
Publication Open

The Survey of H5N1 Flu Virus in Wild Birds in 14 Provinces of China from 2004 to 2007

Creators

  • 1. Wuhan Institute of Virology
  • 2. Chinese Academy of Sciences
  • 3. Institute of Zoology
  • 4. State Key Laboratory of Remote Sensing Science
  • 5. Anhui Medical University
  • 6. Shaanxi Institute of Zoology
  • 7. Wuhan Center for Disease Control and Prevention
  • 8. Nanjing Agricultural University
  • 9. Computer Network Information Center
  • 10. Fanjingshan National Nature Reserve
  • 11. Institute of Animal Sciences
  • 12. Shaanxi Normal University

Description

The highly pathogenic H5N1 avian influenza emerged in the year 1996 in Asia, and has spread to Europe and Africa recently. At present, effective monitoring and data analysis of H5N1 are not sufficient in Chinese mainland.During the period from April of 2004 to August of 2007, we collected 14,472 wild bird samples covering 56 species of 10 orders in 14 provinces of China and monitored the prevalence of flu virus based on RT-PCR specific for H5N1 subtype. The 149 positive samples involved six orders. Anseriformes had the highest prevalence while Passeriformes had the lowest prevalence (2.70% versus 0.36%). Among the 24 positive species, mallard (Anas platyrhynchos) had the highest prevalence (4.37%). A difference of prevalence was found among 14 provinces. Qinghai had a higher prevalence than the other 13 provinces combined (3.88% versus 0.43%). The prevalence in three species in Qinghai province (Pintail (Anas acuta), Mallard (Anas platyrhynchos) and Tufted Duck (Aythya fuligula)) were obviously higher than those in other 13 provinces. The results of sequence analysis indicated that the 17 strains isolated from wild birds were distributed in five clades (2.3.1, 2.2, 2.5, 6, and 7), which suggested that genetic diversity existed among H5N1 viruses isolated from wild birds. The five isolates from Qinghai came from one clade (2.2) and had a short evolutionary distance with the isolates obtained from Qinghai in the year 2005.We have measured the prevalence of H5N1 virus in 56 species of wild birds in 14 provinces of China. Continuous monitoring in the field should be carried out to know whether H5N1 virus can be maintained by wild birds.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

ظهرت إنفلونزا الطيور H5N1 شديدة الإمراض في عام 1996 في آسيا، وانتشرت إلى أوروبا وأفريقيا مؤخرًا. في الوقت الحاضر، لا تكفي المراقبة الفعالة وتحليل بيانات فيروس H5N1 في البر الرئيسي الصيني. خلال الفترة من أبريل 2004 إلى أغسطس 2007، جمعنا 14472 عينة من الطيور البرية تغطي 56 نوعًا من 10 أنواع في 14 مقاطعة صينية ورصدنا انتشار فيروس الأنفلونزا بناءً على RT - PCR المحدد للنوع الفرعي H5N1. تضمنت العينات الإيجابية البالغ عددها 149 عينة ستة أوامر. كان للأنسيريفورمس أعلى معدل انتشار بينما كان للباسيريفورمس أدنى معدل انتشار (2.70 ٪ مقابل 0.36 ٪). من بين 24 نوعًا إيجابيًا، كان البطيخ (Anas platyrhynchos) هو الأعلى انتشارًا (4.37 ٪). تم العثور على اختلاف في الانتشار بين 14 مقاطعة. كان معدل انتشار تشينغهاي أعلى من المقاطعات الـ 13 الأخرى مجتمعة (3.88 ٪ مقابل 0.43 ٪). من الواضح أن الانتشار في ثلاثة أنواع في مقاطعة تشينغهاي (بينتايل (أنس أكوتا)، مالارد (أنس بلاتيرينشوس) وبطة تافتيد (أيثيا فوليجولا)) كان أعلى من تلك الموجودة في 13 مقاطعة أخرى. أشارت نتائج تحليل التسلسل إلى أن السلالات الـ 17 المعزولة عن الطيور البرية كانت موزعة في خمسة فروع (2.3.1 و 2.2 و 2.5 و 6 و 7)، مما يشير إلى وجود تنوع وراثي بين فيروسات H5N1 المعزولة عن الطيور البرية. جاءت العزلات الخمس من تشينغهاي من فرع واحد (2.2) وكان لها مسافة تطورية قصيرة مع العزلات التي تم الحصول عليها من تشينغهاي في عام 2005. لقد قمنا بقياس انتشار فيروس H5N1 في 56 نوعًا من الطيور البرية في 14 مقاطعة في الصين. يجب إجراء مراقبة مستمرة في الميدان لمعرفة ما إذا كان يمكن الحفاظ على فيروس H5N1 من قبل الطيور البرية.

Translated Description (French)

La grippe aviaire hautement pathogène H5N1 est apparue en 1996 en Asie et s'est récemment propagée en Europe et en Afrique. À l'heure actuelle, la surveillance efficace et l'analyse des données du H5N1 ne sont pas suffisantes en Chine continentale. Au cours de la période allant d'avril 2004 à août 2007, nous avons recueilli 14 472 échantillons d'oiseaux sauvages couvrant 56 espèces de 10 ordres dans 14 provinces de Chine et surveillé la prévalence du virus de la grippe sur la base de la RT-PCR spécifique au sous-type H5N1. Les 149 échantillons positifs concernaient six commandes. Les Anseriformes avaient la prévalence la plus élevée tandis que les Passeriformes avaient la prévalence la plus faible (2,70 % contre 0,36 %). Parmi les 24 espèces positives, le colvert (Anas platyrhynchos) avait la prévalence la plus élevée (4,37 %). Une différence de prévalence a été constatée entre 14 provinces. Le Qinghai avait une prévalence plus élevée que les 13 autres provinces combinées (3,88 % contre 0,43 %). La prévalence chez trois espèces de la province du Qinghai (Canard pilet (Anas acuta), Canard colvert (Anas platyrhynchos) et Canard touffu (Aythya fuligula)) était évidemment plus élevée que dans les 13 autres provinces. Les résultats de l'analyse de séquence ont indiqué que les 17 souches isolées d'oiseaux sauvages étaient réparties en cinq clades (2.3.1, 2.2, 2.5, 6 et 7), ce qui suggère qu'il existe une diversité génétique parmi les virus H5N1 isolés d'oiseaux sauvages. Les cinq isolats du Qinghai provenaient d'un clade (2.2) et avaient une courte distance évolutive avec les isolats obtenus du Qinghai en 2005. Nous avons mesuré la prévalence du virus H5N1 chez 56 espèces d'oiseaux sauvages dans 14 provinces de Chine. Une surveillance continue sur le terrain doit être effectuée pour savoir si le virus H5N1 peut être maintenu par les oiseaux sauvages.

Translated Description (Spanish)

La gripe aviar altamente patógena H5N1 surgió en el año 1996 en Asia, y se ha extendido a Europa y África recientemente. En la actualidad, el monitoreo efectivo y el análisis de datos de H5N1 no son suficientes en China continental. Durante el período de abril de 2004 a agosto de 2007, recolectamos 14,472 muestras de aves silvestres que cubren 56 especies de 10 órdenes en 14 provincias de China y monitoreamos la prevalencia del virus de la gripe basado en RT-PCR específico para el subtipo H5N1. Las 149 muestras positivas involucraron seis pedidos. Los anseriformes tuvieron la prevalencia más alta, mientras que los paseriformes tuvieron la prevalencia más baja (2,70% frente a 0,36%). Entre las 24 especies positivas, el ánade real (Anas platyrhynchos) tuvo la mayor prevalencia (4.37%). Se encontró una diferencia de prevalencia entre 14 provincias. Qinghai tuvo una prevalencia más alta que las otras 13 provincias combinadas (3,88% frente a 0,43%). La prevalencia en tres especies en la provincia de Qinghai (Pintail (Anas acuta), Mallard (Anas platyrhynchos) y Tufted Duck (Aythya fuligula)) fue obviamente mayor que en otras 13 provincias. Los resultados del análisis de secuencia indicaron que las 17 cepas aisladas de aves silvestres se distribuyeron en cinco clados (2.3.1, 2.2, 2.5, 6 y 7), lo que sugirió que existía diversidad genética entre los virus H5N1 aislados de aves silvestres. Los cinco aislados de Qinghai provenían de un clado (2.2) y tenían una distancia evolutiva corta con los aislados obtenidos de Qinghai en el año 2005. Hemos medido la prevalencia del virus H5N1 en 56 especies de aves silvestres en 14 provincias de China. Se debe realizar un monitoreo continuo en el campo para saber si el virus H5N1 puede ser mantenido por las aves silvestres.

Files

journal.pone.0006926&type=printable.pdf

Files (347.7 kB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:5f03b7c9a9295a952625d450e89f365d
347.7 kB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
مسح فيروس إنفلونزا H5N1 في الطيور البرية في 14 مقاطعة صينية من 2004 إلى 2007
Translated title (French)
Enquête sur le virus de la grippe H5N1 chez les oiseaux sauvages dans 14 provinces de Chine de 2004 à 2007
Translated title (Spanish)
El estudio del virus de la gripe H5N1 en aves silvestres en 14 provincias de China de 2004 a 2007

Identifiers

Other
https://openalex.org/W2004364477
DOI
10.1371/journal.pone.0006926

Is supplement to
https://openalex.org/W3022574943 (Other)
https://openalex.org/W2381363304 (Other)
https://openalex.org/W2352678222 (Other)
https://openalex.org/W2350899495 (Other)
https://openalex.org/W2347644781 (Other)
https://openalex.org/W2285562173 (Other)
https://openalex.org/W2055149792 (Other)
https://openalex.org/W1995527227 (Other)
https://openalex.org/W1553543121 (Other)
https://openalex.org/W1504424866 (Other)

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
China

References

  • https://openalex.org/W1544560769
  • https://openalex.org/W1966857503
  • https://openalex.org/W1971178088
  • https://openalex.org/W1977354505
  • https://openalex.org/W1982376897
  • https://openalex.org/W1984669065
  • https://openalex.org/W1994557837
  • https://openalex.org/W1999984759
  • https://openalex.org/W2020316997
  • https://openalex.org/W2030895743
  • https://openalex.org/W2031798676
  • https://openalex.org/W2047083111
  • https://openalex.org/W2056584399
  • https://openalex.org/W2101759168
  • https://openalex.org/W2121378139
  • https://openalex.org/W2123944715
  • https://openalex.org/W2126309815
  • https://openalex.org/W2131155472
  • https://openalex.org/W2136494098
  • https://openalex.org/W2146175559
  • https://openalex.org/W2150244392
  • https://openalex.org/W2152226780
  • https://openalex.org/W2162235679
  • https://openalex.org/W2163960578
  • https://openalex.org/W2166904601
  • https://openalex.org/W2168020376
  • https://openalex.org/W4237236497