Published September 12, 2018
| Version v1
Publication
Open
Absence of spatial genetic structure in common dentex (Dentex dentex Linnaeus, 1758) in the Mediterranean Sea as evidenced by nuclear and mitochondrial molecular markers
Creators
- 1. University of Montpellier
- 2. École Pratique des Hautes Études
- 3. Institut de Recherche pour le Développement
- 4. French National Centre for Scientific Research
- 5. Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier
- 6. Hellenic Centre for Marine Research
- 7. University of Cagliari
- 8. University of Palermo
- 9. Institut National Agronomique de Tunisie
- 10. University of Corsica Pascal Paoli
- 11. Mediterranean Institute for Advanced Studies
- 12. Ifremer
Description
The common dentex, Dentex dentex, is a fish species which inhabits marine environments in the Mediterranean and Northeast Atlantic regions. This is an important species from an ecological, economic and conservation perspective, however critical information on its population genetic structure is lacking. Most samples were obtained from the Mediterranean Sea (17 sites) with an emphasis around Corsica (5 sites), plus one Atlantic Ocean site. This provided an opportunity to examine genetic structuring at local and broader scales to provide science based data for the management of fishing stocks in the region. Two mitochondrial regions were examined (D-loop and COI) along with eight microsatellite loci. The COI data was combined with publicly available sequences and demonstrated past misidentification of common dentex. All markers indicated the absence of population genetic structure from the Bay of Biscay to the eastern Mediterranean Sea. Bayesian approaches, as well as the statistical tests performed on the allelic frequencies from microsatellite loci, indicated low differentiation between samples; there was only a slight (p = 0.05) indication of isolation by distance. Common dentex is a marine fish species with a unique panmictic population in the Mediterranean and likely in the Atlantic Ocean as well.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
دينتكس، دينتكس دينتكس، هو نوع من الأسماك يسكن البيئات البحرية في مناطق البحر الأبيض المتوسط وشمال شرق المحيط الأطلسي. هذا نوع مهم من منظور إيكولوجي واقتصادي والحفاظ عليه، ومع ذلك لا توجد معلومات مهمة عن بنيته الوراثية السكانية. تم الحصول على معظم العينات من البحر الأبيض المتوسط (17 موقعًا) مع التركيز على كورسيكا (5 مواقع)، بالإضافة إلى موقع واحد في المحيط الأطلسي. وقد أتاح ذلك فرصة لدراسة الهيكلة الوراثية على المستويين المحلي والأوسع لتوفير بيانات قائمة على العلم لإدارة أرصدة الصيد في المنطقة. تم فحص منطقتين من الميتوكوندريا (D - loop و COI) إلى جانب ثمانية مواقع ساتلية دقيقة. تم دمج بيانات تضارب المصالح مع التسلسلات المتاحة للجمهور وأظهرت خطأ سابق في تحديد الأسنان الشائعة. أشارت جميع العلامات إلى عدم وجود بنية وراثية للسكان من خليج بسكاي إلى شرق البحر الأبيض المتوسط. أشارت المقاربات البايزية، بالإضافة إلى الاختبارات الإحصائية التي أجريت على الترددات الأليلية من مواقع الأقمار الصناعية الصغيرة، إلى تمايز منخفض بين العينات ؛ لم يكن هناك سوى مؤشر طفيف (p = 0.05) على العزلة عن طريق المسافة. فهرس الأسنان المشترك هو نوع من الأسماك البحرية ذات مجموعة فريدة من نوعها في البحر الأبيض المتوسط وعلى الأرجح في المحيط الأطلسي أيضًا.Translated Description (French)
Le dentex commun, Dentex dentex, est une espèce de poisson qui habite les milieux marins des régions de la Méditerranée et de l'Atlantique Nord-Est. Il s'agit d'une espèce importante du point de vue écologique, économique et de la conservation, mais il manque des informations essentielles sur la structure génétique de sa population. La plupart des échantillons ont été obtenus de la mer Méditerranée (17 sites) en mettant l'accent sur la Corse (5 sites), plus un site de l'océan Atlantique. Cela a été l'occasion d'examiner la structuration génétique à l'échelle locale et plus large afin de fournir des données scientifiques pour la gestion des stocks de pêche dans la région. Deux régions mitochondriales ont été examinées (boucle D et COI) ainsi que huit loci microsatellites. Les données COI ont été combinées avec des séquences accessibles au public et ont démontré une identification erronée antérieure du dentex commun. Tous les marqueurs ont indiqué l'absence de structure génétique de la population du golfe de Gascogne à la mer Méditerranée orientale. Les approches bayésiennes, ainsi que les tests statistiques effectués sur les fréquences alléliques à partir de loci microsatellites, ont indiqué une faible différenciation entre les échantillons ; il n'y avait qu'une faible indication (p = 0,05) de l'isolement par la distance. Le dentex commun est une espèce de poisson marin avec une population panmictique unique en Méditerranée et probablement aussi dans l'océan Atlantique.Translated Description (Spanish)
El dentex común, Dentex dentex, es una especie de pez que habita en ambientes marinos de las regiones mediterránea y atlántica nororiental. Esta es una especie importante desde una perspectiva ecológica, económica y conservadora, sin embargo, se carece de información crítica sobre la estructura genética de su población. La mayoría de las muestras se obtuvieron del Mar Mediterráneo (17 sitios) con énfasis alrededor de Córcega (5 sitios), más un sitio del Océano Atlántico. Esto brindó la oportunidad de examinar la estructuración genética a escala local y más amplia para proporcionar datos basados en la ciencia para la gestión de las poblaciones de peces en la región. Se examinaron dos regiones mitocondriales (D-loop y COI) junto con ocho loci de microsatélites. Los datos del COI se combinaron con secuencias disponibles públicamente y demostraron una identificación errónea anterior del dentículo común. Todos los marcadores indicaron la ausencia de estructura genética poblacional desde el Golfo de Vizcaya hasta el Mediterráneo oriental. Los enfoques bayesianos, así como las pruebas estadísticas realizadas en las frecuencias alélicas de los loci de microsatélites, indicaron una baja diferenciación entre las muestras; solo hubo una ligera indicación (p = 0.05) de aislamiento por distancia. El dentex común es una especie de pez marino con una población panmíctica única en el Mediterráneo y probablemente también en el Océano Atlántico.Files
journal.pone.0203866&type=printable.pdf
Files
(11.2 MB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:df82e20a4c86f1aa0914831640770a77
|
11.2 MB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- عدم وجود بنية وراثية مكانية في الأسنان الشائعة (Dentex dentex Linnaeus، 1758) في البحر الأبيض المتوسط كما يتضح من العلامات الجزيئية النووية والميتوكوندريا
- Translated title (French)
- Absence de structure génétique spatiale chez le dentex commun (Dentex dentex Linnaeus, 1758) en Méditerranée comme en témoignent les marqueurs moléculaires nucléaires et mitochondriaux
- Translated title (Spanish)
- Ausencia de estructura genética espacial en dentones comunes (Dentex dentex Linnaeus, 1758) en el Mar Mediterráneo como lo demuestran los marcadores moleculares nucleares y mitocondriales
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2890113080
- DOI
- 10.1371/journal.pone.0203866
References
- https://openalex.org/W1633528265
- https://openalex.org/W1874386691
- https://openalex.org/W1919772617
- https://openalex.org/W1929079656
- https://openalex.org/W1931211365
- https://openalex.org/W1933665609
- https://openalex.org/W1965598715
- https://openalex.org/W1974426414
- https://openalex.org/W1979269423
- https://openalex.org/W1980454123
- https://openalex.org/W1984506210
- https://openalex.org/W1992126052
- https://openalex.org/W1997476591
- https://openalex.org/W2002554516
- https://openalex.org/W2020573172
- https://openalex.org/W2027253930
- https://openalex.org/W2035839217
- https://openalex.org/W2039383603
- https://openalex.org/W2042521784
- https://openalex.org/W2045628966
- https://openalex.org/W2048559806
- https://openalex.org/W2051211717
- https://openalex.org/W2051237825
- https://openalex.org/W2070702210
- https://openalex.org/W2077452487
- https://openalex.org/W2078352132
- https://openalex.org/W2078992396
- https://openalex.org/W2083723290
- https://openalex.org/W2087104407
- https://openalex.org/W2090217021
- https://openalex.org/W2092613863
- https://openalex.org/W2096420865
- https://openalex.org/W2096711345
- https://openalex.org/W2098126593
- https://openalex.org/W2098687968
- https://openalex.org/W2098787755
- https://openalex.org/W2099103277
- https://openalex.org/W2104671711
- https://openalex.org/W2106385098
- https://openalex.org/W2106746497
- https://openalex.org/W2111211467
- https://openalex.org/W2111456242
- https://openalex.org/W2112348586
- https://openalex.org/W2113458103
- https://openalex.org/W2115736509
- https://openalex.org/W2122721851
- https://openalex.org/W2131613328
- https://openalex.org/W2139146574
- https://openalex.org/W2140618008
- https://openalex.org/W2142644281
- https://openalex.org/W2150011978
- https://openalex.org/W2150233727
- https://openalex.org/W2152207030
- https://openalex.org/W2154845780
- https://openalex.org/W2158489424
- https://openalex.org/W2160295456
- https://openalex.org/W2161339576
- https://openalex.org/W2170665985
- https://openalex.org/W2171405751
- https://openalex.org/W2180898445
- https://openalex.org/W2197668293
- https://openalex.org/W2300496125
- https://openalex.org/W2301105431
- https://openalex.org/W2511510476
- https://openalex.org/W2522523001
- https://openalex.org/W2593040887
- https://openalex.org/W2610994034
- https://openalex.org/W2734554857
- https://openalex.org/W3226408
- https://openalex.org/W4239528210