Published April 27, 2012
| Version v1
Publication
Open
Molecular Systematic of Three Species of Oithona (Copepoda, Cyclopoida) from the Atlantic Ocean: Comparative Analysis Using 28S rDNA
Creators
- 1. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
- 2. Fundación Ciencias Exactas y Naturales
- 3. Institute of Marine and Coastal Research
- 4. Instituto de Biotecnología y Biología Molecular
- 5. Instituto Nacional de Investigacion y Desarrollo Pesquero
- 6. National University of Mar del Plata
- 7. University of Connecticut
Description
Species of Oithona (Copepoda, Cyclopoida) are highly abundant, ecologically important, and widely distributed throughout the world oceans. Although there are valid and detailed descriptions of the species, routine species identifications remain challenging due to their small size, subtle morphological diagnostic traits, and the description of geographic forms or varieties. This study examined three species of Oithona (O. similis, O. atlantica and O. nana) occurring in the Argentine sector of the South Atlantic Ocean based on DNA sequence variation of a 575 base-pair region of 28S rDNA, with comparative analysis of these species from other North and South Atlantic regions. DNA sequence variation clearly resolved and discriminated the species, and revealed low levels of intraspecific variation among North and South Atlantic populations of each species. The 28S rDNA region was thus shown to provide an accurate and reliable means of identifying the species throughout the sampled domain. Analysis of 28S rDNA variation for additional species collected throughout the global ocean will be useful to accurately characterize biogeographical distributions of the species and to examine phylogenetic relationships among them.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
أنواع Oithona (Copepoda، Cyclopoida) وفيرة للغاية ومهمة بيئيًا وموزعة على نطاق واسع في جميع أنحاء محيطات العالم. على الرغم من وجود أوصاف صالحة ومفصلة للأنواع، إلا أن تحديدات الأنواع الروتينية لا تزال صعبة بسبب صغر حجمها وسماتها التشخيصية المورفولوجية الدقيقة ووصف الأشكال أو الأصناف الجغرافية. درست هذه الدراسة ثلاثة أنواع من Oithona (O. similis و O. atlantica و O. nana) التي تحدث في القطاع الأرجنتيني من جنوب المحيط الأطلسي بناءً على تباين تسلسل الحمض النووي لمنطقة زوج قاعدة 575 من الحمض النووي الريبي النووي 28S، مع تحليل مقارن لهذه الأنواع من مناطق شمال وجنوب المحيط الأطلسي الأخرى. من الواضح أن تباين تسلسل الحمض النووي قد حل وتمييز الأنواع، وكشف عن مستويات منخفضة من التباين داخل الأنواع بين مجموعات شمال وجنوب المحيط الأطلسي من كل نوع. وهكذا تبين أن منطقة الحمض النووي الريبوزي 28S توفر وسيلة دقيقة وموثوقة لتحديد الأنواع في جميع أنحاء المجال الذي تم أخذ العينات منه. سيكون تحليل تباين الحمض النووي الريبي 28S للأنواع الإضافية التي تم جمعها في جميع أنحاء المحيط العالمي مفيدًا في توصيف التوزيعات الجغرافية الحيوية للأنواع بدقة وفحص العلاقات الوراثية فيما بينها.Translated Description (French)
Les espèces d'Oithona (Copepoda, Cyclopoida) sont très abondantes, écologiquement importantes et largement réparties dans les océans du monde. Bien qu'il existe des descriptions valides et détaillées de l'espèce, les identifications routinières des espèces restent difficiles en raison de leur petite taille, de leurs traits diagnostiques morphologiques subtils et de la description de formes ou de variétés géographiques. Cette étude a examiné trois espèces d'Oithona (O. similis, O. atlantica et O. nana) présentes dans le secteur argentin de l'océan Atlantique Sud sur la base de la variation de la séquence d'ADN d'une région de 575 paires de bases d'ADNr 28S, avec une analyse comparative de ces espèces provenant d'autres régions de l'Atlantique Nord et Sud. La variation de la séquence d'ADN a clairement résolu et discriminé l'espèce, et a révélé de faibles niveaux de variation intraspécifique parmi les populations de l'Atlantique Nord et Sud de chaque espèce. Il a donc été démontré que la région de l'ADNr 28S fournit un moyen précis et fiable d'identifier l'espèce dans tout le domaine échantillonné. L'analyse de la variation de l'ADNr 28S pour d'autres espèces collectées dans l'océan mondial sera utile pour caractériser avec précision les distributions biogéographiques des espèces et pour examiner les relations phylogénétiques entre elles.Translated Description (Spanish)
Las especies de Oithona (Copepoda, Cyclopoida) son muy abundantes, ecológicamente importantes y están ampliamente distribuidas en los océanos del mundo. Aunque existen descripciones válidas y detalladas de las especies, las identificaciones rutinarias de especies siguen siendo un desafío debido a su pequeño tamaño, sus sutiles rasgos de diagnóstico morfológico y la descripción de formas o variedades geográficas. Este estudio examinó tres especies de Oithona (O. similis, O. atlantica y O. nana) que se encuentran en el sector argentino del Océano Atlántico Sur en función de la variación de la secuencia de ADN de una región de 575 pares de bases de ADNr 28S, con análisis comparativo de estas especies de otras regiones del Atlántico Norte y Sur. La variación de la secuencia de ADN resolvió y discriminó claramente la especie, y reveló bajos niveles de variación intraespecífica entre las poblaciones del Atlántico Norte y Sur de cada especie. Por lo tanto, se demostró que la región de ADNr 28S proporciona un medio preciso y confiable para identificar las especies en todo el dominio muestreado. El análisis de la variación del ADNr 28S para especies adicionales recolectadas en todo el océano global será útil para caracterizar con precisión las distribuciones biogeográficas de las especies y para examinar las relaciones filogenéticas entre ellas.Files
journal.pone.0035861&type=printable.pdf
Files
(303.5 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:4effdf1fb8de7c8cb1e93f8752b2626c
|
303.5 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- النظام الجزيئي لثلاثة أنواع من Oithona (Copepoda، Cyclopoida) من المحيط الأطلسي: تحليل مقارن باستخدام 28S rDNA
- Translated title (French)
- Systématique moléculaire de trois espèces d'Oithona (Copepoda, Cyclopoida) de l'océan Atlantique : analyse comparative utilisant l'ADNr 28S
- Translated title (Spanish)
- Molecular Systematic of Three Species of Oithona (Copepoda, Cyclopoida) from the Atlantic Ocean: Comparative Analysis Using 28S rDNA
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2152956222
- DOI
- 10.1371/journal.pone.0035861
References
- https://openalex.org/W1260585190
- https://openalex.org/W142894105
- https://openalex.org/W1497123016
- https://openalex.org/W1525734744
- https://openalex.org/W1919772617
- https://openalex.org/W1937555083
- https://openalex.org/W1974265976
- https://openalex.org/W1982594568
- https://openalex.org/W1990074132
- https://openalex.org/W1990896823
- https://openalex.org/W1992287609
- https://openalex.org/W1993510834
- https://openalex.org/W1993641916
- https://openalex.org/W2001418903
- https://openalex.org/W2003868071
- https://openalex.org/W2009283828
- https://openalex.org/W2014453382
- https://openalex.org/W2016000751
- https://openalex.org/W2022087466
- https://openalex.org/W2023586769
- https://openalex.org/W2030966943
- https://openalex.org/W2038039493
- https://openalex.org/W2043590999
- https://openalex.org/W2044975368
- https://openalex.org/W2078347218
- https://openalex.org/W2079673271
- https://openalex.org/W2086481077
- https://openalex.org/W2092138994
- https://openalex.org/W2097706568
- https://openalex.org/W2106882534
- https://openalex.org/W2115499263
- https://openalex.org/W2116333505
- https://openalex.org/W2120611093
- https://openalex.org/W2120644786
- https://openalex.org/W2123251947
- https://openalex.org/W2129130481
- https://openalex.org/W2132632499
- https://openalex.org/W2136582620
- https://openalex.org/W2154845780
- https://openalex.org/W2156675812
- https://openalex.org/W2162550821
- https://openalex.org/W2168610700
- https://openalex.org/W2172820226
- https://openalex.org/W2284045074
- https://openalex.org/W4240345219
- https://openalex.org/W4254275792
- https://openalex.org/W4390792046