Published January 3, 2024 | Version v1
Publication Open

Global fine-resolution data on springtail abundance and community structure

Creators

  • 1. Leipzig University
  • 2. German Centre for Integrative Biodiversity Research
  • 3. Moscow State Pedagogical University
  • 4. Qatar University
  • 5. Universidade do Estado de Santa Catarina
  • 6. Forest Research
  • 7. Severtsov Institute of Ecology and Evolution
  • 8. Visva-Bharati University
  • 9. University of Queensland
  • 10. Universidade Federal do Rio Grande do Norte
  • 11. Universidade Federal do Rio Grande do Sul
  • 12. Constantine 1 University
  • 13. Vrije Universiteit Amsterdam
  • 14. University of Groningen
  • 15. National Space Activities Commission
  • 16. University College Dublin
  • 17. Université Laval
  • 18. Universidade Estadual da Paraíba
  • 19. IPB University
  • 20. Universidad Nacional Autónoma de México
  • 21. Université de Rouen Normandie
  • 22. Nanyang Technological University
  • 23. Monash University
  • 24. University of Michigan–Ann Arbor
  • 25. Centre d'Écologie Fonctionnelle et Évolutive
  • 26. Biology Centre of the Czech Academy of Sciences
  • 27. Institute of Entomology
  • 28. Autonomous University of Madrid
  • 29. Universidade Federal do Rio de Janeiro
  • 30. Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité
  • 31. Centre for Research on Ecology and Forestry Applications
  • 32. Romanian Academy
  • 33. University of Bremen
  • 34. Royal Netherlands Institute for Sea Research
  • 35. Forestry and Forest Products Research Institute
  • 36. Université du Québec à Montréal
  • 37. Centre de Géomatique du Québec
  • 38. Ningbo University
  • 39. Université du Québec en Outaouais
  • 40. Laboratoire Écologie Fonctionnelle et Environnement
  • 41. University of Pretoria
  • 42. Doshisha University
  • 43. University of Applied Sciences and Arts Western Switzerland
  • 44. Kyushu University
  • 45. Aarhus University
  • 46. Instituto de Recursos Naturales y Agrobiología de Sevilla
  • 47. Estonian University of Life Sciences
  • 48. Tallinn University of Technology
  • 49. Aberystwyth University
  • 50. University of Cape Town
  • 51. Iziko Museums of South Africa
  • 52. University of Würzburg
  • 53. Écologie Fonctionnelle et Écotoxicologie des Agroécosystèmes
  • 54. University of Latvia
  • 55. Agricultural University of Iceland
  • 56. University of Pavol Jozef Šafárik
  • 57. Swedish University of Agricultural Sciences
  • 58. Chongqing University
  • 59. Western University
  • 60. Stellenbosch University
  • 61. University of Göttingen
  • 62. Johannes Gutenberg University Mainz
  • 63. Rice University
  • 64. Massey University
  • 65. University of Waikato
  • 66. Basque Centre for Climate Change
  • 67. Yokohama National University
  • 68. Università Cattolica del Sacro Cuore
  • 69. Western Sydney University
  • 70. Universidad de Cádiz
  • 71. Mécanismes Adaptatifs et Evolution
  • 72. Natural History Museum Vienna
  • 73. King Abdulaziz University

Description

Abstract Springtails (Collembola) inhabit soils from the Arctic to the Antarctic and comprise an estimated ~32% of all terrestrial arthropods on Earth. Here, we present a global, spatially-explicit database on springtail communities that includes 249,912 occurrences from 44,999 samples and 2,990 sites. These data are mainly raw sample-level records at the species level collected predominantly from private archives of the authors that were quality-controlled and taxonomically-standardised. Despite covering all continents, most of the sample-level data come from the European continent (82.5% of all samples) and represent four habitats: woodlands (57.4%), grasslands (14.0%), agrosystems (13.7%) and scrublands (9.0%). We included sampling by soil layers, and across seasons and years, representing temporal and spatial within-site variation in springtail communities. We also provided data use and sharing guidelines and R code to facilitate the use of the database by other researchers. This data paper describes a static version of the database at the publication date, but the database will be further expanded to include underrepresented regions and linked with trait data.

⚠️ This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%

Translated Description (Arabic)

تسكن ذيل الربيع التجريدي (Collembola) التربة من القطب الشمالي إلى القطب الجنوبي وتشكل ما يقدر بنحو 32 ٪ من جميع المفصليات الأرضية على الأرض. هنا، نقدم قاعدة بيانات عالمية واضحة مكانيًا عن مجتمعات ذيل الربيع تتضمن 249,912 حدثًا من 44,999 عينة و 2,990 موقعًا. هذه البيانات هي في الأساس سجلات على مستوى العينة الخام على مستوى الأنواع تم جمعها في الغالب من المحفوظات الخاصة للمؤلفين التي تم التحكم في جودتها ومعاييرها التصنيفية. على الرغم من تغطية جميع القارات، فإن معظم البيانات على مستوى العينة تأتي من القارة الأوروبية (82.5 ٪ من جميع العينات) وتمثل أربعة موائل: الأراضي الحرجية (57.4 ٪) والأراضي العشبية (14.0 ٪) والأنظمة الزراعية (13.7 ٪) والأراضي العشبية (9.0 ٪). قمنا بتضمين أخذ العينات حسب طبقات التربة، وعبر المواسم والسنوات، مما يمثل التباين الزمني والمكاني داخل الموقع في مجتمعات ذيل الربيع. كما قدمنا إرشادات استخدام البيانات ومشاركتها ورمز R لتسهيل استخدام قاعدة البيانات من قبل باحثين آخرين. تصف ورقة البيانات هذه نسخة ثابتة من قاعدة البيانات في تاريخ النشر، ولكن سيتم توسيع قاعدة البيانات لتشمل المناطق الممثلة تمثيلاً ناقصًا وربطها ببيانات السمات.

Translated Description (French)

Les collemboles (collemboles) habitent les sols de l'Arctique à l'Antarctique et représentent environ32 % de tous les arthropodes terrestres sur Terre. Ici, nous présentons une base de données mondiale spatialement explicite sur les communautés de collemboles qui comprend 249 912 occurrences provenant de 44 999 échantillons et de 2 990 sites. Ces données sont principalement des enregistrements bruts au niveau de l'échantillon au niveau de l'espèce collectés principalement à partir d'archives privées des auteurs dont la qualité était contrôlée et normalisée taxonomiquement. Bien qu'elles couvrent tous les continents, la plupart des données au niveau des échantillons proviennent du continent européen (82,5 % de tous les échantillons) et représentent quatre habitats : les forêts (57,4 %), les prairies (14,0 %), les agrosystèmes (13,7 %) et les broussailles (9,0 %). Nous avons inclus l'échantillonnage par couches de sol, et à travers les saisons et les années, représentant la variation temporelle et spatiale à l'intérieur du site dans les communautés de collemboles. Nous avons également fourni des directives d'utilisation et de partage des données et un code R pour faciliter l'utilisation de la base de données par d'autres chercheurs. Ce document de données décrit une version statique de la base de données à la date de publication, mais la base de données sera encore élargie pour inclure les régions sous-représentées et liée aux données sur les traits.

Translated Description (Spanish)

Los colémbolos (Collembola) habitan en suelos desde el Ártico hasta la Antártida y comprenden aproximadamente el ~32% de todos los artrópodos terrestres en la Tierra. Aquí, presentamos una base de datos global, espacialmente explícita sobre las comunidades de colémbolos que incluye 249,912 ocurrencias de 44,999 muestras y 2,990 sitios. Estos datos son principalmente registros brutos a nivel de muestra a nivel de especie recopilados predominantemente de archivos privados de los autores que fueron controlados por calidad y estandarizados taxonómicamente. A pesar de cubrir todos los continentes, la mayoría de los datos a nivel de muestra provienen del continente europeo (82,5% de todas las muestras) y representan cuatro hábitats: bosques (57,4%), pastizales (14,0%), agrosistemas (13,7%) y matorrales (9,0%). Incluimos el muestreo por capas de suelo, y entre estaciones y años, que representa la variación temporal y espacial dentro del sitio en las comunidades de colémbolos. También proporcionamos pautas de uso e intercambio de datos y código R para facilitar el uso de la base de datos por parte de otros investigadores. Este documento de datos describe una versión estática de la base de datos en la fecha de publicación, pero la base de datos se ampliará aún más para incluir regiones subrepresentadas y vinculadas con datos de rasgos.

Files

s41597-023-02784-x.pdf.pdf

Files (1.3 MB)

⚠️ Please wait a few minutes before your translated files are ready ⚠️ Note: Some files might be protected thus translations might not work.
Name Size Download all
md5:cc56c7476b9a3cb646720238d99ffea6
1.3 MB
Preview Download

Additional details

Additional titles

Translated title (Arabic)
بيانات عالمية دقيقة الدقة عن وفرة ذيل الربيع وهيكل المجتمع
Translated title (French)
Données mondiales à résolution fine sur l'abondance du collembole et la structure de la communauté
Translated title (Spanish)
Datos globales de resolución fina sobre la abundancia de colémbolos y la estructura de la comunidad

Identifiers

Other
https://openalex.org/W4390545674
DOI
10.1038/s41597-023-02784-x

GreSIS Basics Section

Is Global South Knowledge
Yes
Country
Algeria

References

  • https://openalex.org/W1968390391
  • https://openalex.org/W1971812470
  • https://openalex.org/W1972932038
  • https://openalex.org/W1973041223
  • https://openalex.org/W1977698992
  • https://openalex.org/W1981116304
  • https://openalex.org/W1986336088
  • https://openalex.org/W1986895404
  • https://openalex.org/W1994239500
  • https://openalex.org/W1995476551
  • https://openalex.org/W1998943692
  • https://openalex.org/W2005868113
  • https://openalex.org/W2006172609
  • https://openalex.org/W2006638093
  • https://openalex.org/W2008105763
  • https://openalex.org/W2009460399
  • https://openalex.org/W2010640818
  • https://openalex.org/W2024963545
  • https://openalex.org/W2030620786
  • https://openalex.org/W2031343092
  • https://openalex.org/W2034799269
  • https://openalex.org/W2037641936
  • https://openalex.org/W2039339296
  • https://openalex.org/W2041910044
  • https://openalex.org/W2043780615
  • https://openalex.org/W2045773662
  • https://openalex.org/W2046478573
  • https://openalex.org/W2051564648
  • https://openalex.org/W2054926270
  • https://openalex.org/W2055633933
  • https://openalex.org/W2060956671
  • https://openalex.org/W2061862812
  • https://openalex.org/W2062297184
  • https://openalex.org/W2064617186
  • https://openalex.org/W2066047329
  • https://openalex.org/W2073035973
  • https://openalex.org/W2074361318
  • https://openalex.org/W2075114306
  • https://openalex.org/W2081989932
  • https://openalex.org/W2082617105
  • https://openalex.org/W2087379868
  • https://openalex.org/W2088992030
  • https://openalex.org/W2091262512
  • https://openalex.org/W2092624047
  • https://openalex.org/W2100588341
  • https://openalex.org/W2102848920
  • https://openalex.org/W2117400326
  • https://openalex.org/W2126507632
  • https://openalex.org/W2137800272
  • https://openalex.org/W2144863064
  • https://openalex.org/W2150260453
  • https://openalex.org/W2151533838
  • https://openalex.org/W2159711143
  • https://openalex.org/W2171405021
  • https://openalex.org/W2171573909
  • https://openalex.org/W2256085854
  • https://openalex.org/W2298279763
  • https://openalex.org/W2321261524
  • https://openalex.org/W2344420247
  • https://openalex.org/W2346739015
  • https://openalex.org/W2513156779
  • https://openalex.org/W2556028216
  • https://openalex.org/W2562770117
  • https://openalex.org/W2600251727
  • https://openalex.org/W2612211584
  • https://openalex.org/W2634026470
  • https://openalex.org/W2742046620
  • https://openalex.org/W2757406463
  • https://openalex.org/W2757721969
  • https://openalex.org/W2770062747
  • https://openalex.org/W2771376159
  • https://openalex.org/W2773951667
  • https://openalex.org/W2790377469
  • https://openalex.org/W2791862936
  • https://openalex.org/W2792402966
  • https://openalex.org/W2795148414
  • https://openalex.org/W2806074342
  • https://openalex.org/W2811202310
  • https://openalex.org/W2870273942
  • https://openalex.org/W2877160786
  • https://openalex.org/W2883527454
  • https://openalex.org/W2887761196
  • https://openalex.org/W2888211613
  • https://openalex.org/W2889230305
  • https://openalex.org/W2891460788
  • https://openalex.org/W2901053544
  • https://openalex.org/W2907020201
  • https://openalex.org/W2919062327
  • https://openalex.org/W2921671982
  • https://openalex.org/W2924627987
  • https://openalex.org/W2948102007
  • https://openalex.org/W2953521441
  • https://openalex.org/W2963407560
  • https://openalex.org/W2969269543
  • https://openalex.org/W2969767969
  • https://openalex.org/W2972351156
  • https://openalex.org/W2975021034
  • https://openalex.org/W2975892148
  • https://openalex.org/W2981612066
  • https://openalex.org/W2982527879
  • https://openalex.org/W3002951141
  • https://openalex.org/W3013447594
  • https://openalex.org/W3023822120
  • https://openalex.org/W3030607735
  • https://openalex.org/W3044562767
  • https://openalex.org/W3088582014
  • https://openalex.org/W3096098413
  • https://openalex.org/W3096784413
  • https://openalex.org/W3108205076
  • https://openalex.org/W3112122085
  • https://openalex.org/W3117375554
  • https://openalex.org/W3120640524
  • https://openalex.org/W3127242548
  • https://openalex.org/W3127515314
  • https://openalex.org/W3162096660
  • https://openalex.org/W3164601997
  • https://openalex.org/W3188012304
  • https://openalex.org/W3188402717
  • https://openalex.org/W3194317089
  • https://openalex.org/W3210159453
  • https://openalex.org/W3215067858
  • https://openalex.org/W3216011546
  • https://openalex.org/W3216396634
  • https://openalex.org/W333501679
  • https://openalex.org/W4200585588
  • https://openalex.org/W4206309517
  • https://openalex.org/W4212953232
  • https://openalex.org/W4220684895
  • https://openalex.org/W4223911207
  • https://openalex.org/W4296459225
  • https://openalex.org/W4309038740
  • https://openalex.org/W4311440932
  • https://openalex.org/W4312110404
  • https://openalex.org/W4312354252
  • https://openalex.org/W4313363998
  • https://openalex.org/W4315433106
  • https://openalex.org/W4319069513
  • https://openalex.org/W4319345875
  • https://openalex.org/W4376626798
  • https://openalex.org/W4395290492
  • https://openalex.org/W4395589026
  • https://openalex.org/W659095671