Published February 26, 2010
| Version v1
Publication
Open
Genome-Wide Association Study Reveals Multiple Loci Associated with Primary Tooth Development during Infancy
Creators
- Demetris Pillas1, 2, 3, 4, 5
-
Clive Hoggart1
-
David M. Evans2, 6
-
Paul F. O'Reilly1
-
Kirsi Sipilä7, 8
-
Raija Lähdesmäki8, 7
-
Iona Y. Millwood1, 9
-
Marika Kaakinen8
-
Gopalakrishnan Netuveli4, 5, 1
- David Blane4, 5, 1
- Pimphen Charoen1, 10, 11
-
Ulla Sovio1
- Anneli Pouta12
- Nelson B. Freimer13
- Anna-Liisa Hartikainen8
-
Jaana Laitinen14
- Sarianna Vaara12
- Beate Glaser2, 6
- P J Crawford15, 6
-
Nicholas J. Timpson2, 6
- Susan M. Ring6
-
Guohong Deng1
-
Weihua Zhang1
-
Mark I. McCarthy16, 9, 17
-
Panos Deloukas18
-
Leena Peltonen19, 18, 20
-
Paul Elliott1, 2
-
Lachlan Coin1
-
George Davey Smith2, 6
-
Marjo‐Riitta Järvelin1, 8, 12
- 1. Imperial College London
- 2. Medical Research Council
- 3. University College London
- 4. Economic and Social Research Council
- 5. Centre for Life
- 6. University of Bristol
- 7. Oulu University Hospital
- 8. University of Oulu
- 9. University of Oxford
- 10. Mahidol Oxford Tropical Medicine Research Unit
- 11. Mahidol University
- 12. Finnish Institute for Health and Welfare
- 13. University of California, Los Angeles
- 14. Finnish Institute of Occupational Health
- 15. University Of Bristol Dental Hospital
- 16. Wellcome Centre for Human Genetics
- 17. Oxford Centre for Diabetes, Endocrinology and Metabolism
- 18. Wellcome Sanger Institute
- 19. Institute for Molecular Medicine Finland
- 20. University of Helsinki
Description
Tooth development is a highly heritable process which relates to other growth and developmental processes, and which interacts with the development of the entire craniofacial complex. Abnormalities of tooth development are common, with tooth agenesis being the most common developmental anomaly in humans. We performed a genome-wide association study of time to first tooth eruption and number of teeth at one year in 4,564 individuals from the 1966 Northern Finland Birth Cohort (NFBC1966) and 1,518 individuals from the Avon Longitudinal Study of Parents and Children (ALSPAC). We identified 5 loci at P<5x10(-8), and 5 with suggestive association (P<5x10(-6)). The loci included several genes with links to tooth and other organ development (KCNJ2, EDA, HOXB2, RAD51L1, IGF2BP1, HMGA2, MSRB3). Genes at four of the identified loci are implicated in the development of cancer. A variant within the HOXB gene cluster associated with occlusion defects requiring orthodontic treatment by age 31 years.
Translated Descriptions
⚠️
This is an automatic machine translation with an accuracy of 90-95%
Translated Description (Arabic)
نمو الأسنان هو عملية وراثية للغاية تتعلق بعمليات النمو والتطور الأخرى، والتي تتفاعل مع تطور المجمع القحفي الوجهي بأكمله. تشوهات نمو الأسنان شائعة، مع كون تكاثر الأسنان هو الشذوذ التنموي الأكثر شيوعًا لدى البشر. أجرينا دراسة ارتباط على مستوى الجينوم للوقت لأول ظهور للأسنان وعدد الأسنان في عام واحد في 4564 فردًا من مجموعة الولادة في شمال فنلندا لعام 1966 (NFBC1966) و 1518 فردًا من دراسة أفون الطولية للوالدين والأطفال (ALSPAC). حددنا 5 مواضع في P<5x10(-8)، و 5 مع ارتباط إيحائي (P< 5x10 (-6)). تضمنت المواضع العديد من الجينات المرتبطة بتطور الأسنان والأعضاء الأخرى (KCNJ2، EDA، HOXB2، RAD51L1، IGF2BP1، HMGA2، MSRB3). الجينات في أربعة من المواضع المحددة متورطة في تطور السرطان. متغير داخل مجموعة الجينات HOXB المرتبطة بعيوب الإطباق التي تتطلب علاجًا لتقويم الأسنان بحلول سن 31 عامًا.Translated Description (French)
Le développement des dents est un processus hautement héréditaire qui se rapporte à d'autres processus de croissance et de développement et qui interagit avec le développement de l'ensemble du complexe craniofacial. Les anomalies du développement dentaire sont fréquentes, l'agénésie dentaire étant l'anomalie du développement la plus fréquente chez l'homme. Nous avons réalisé une étude d'association à l'échelle du génome du temps jusqu'à la première éruption dentaire et du nombre de dents à un an chez 4 564 individus de la cohorte de naissance du nord de la Finlande de 1966 (NFBC1966) et 1 518 individus de l'étude longitudinale Avon des parents et des enfants (ALSPAC). Nous avons identifié 5 locus à P<5x10(-8), et 5 avec une association suggestive (P<5x10(-6)). Les loci comprenaient plusieurs gènes liés au développement des dents et d'autres organes (KCNJ2, EDA, HOXB2, RAD51L1, IGF2BP1, HMGA2, MSRB3). Les gènes de quatre des loci identifiés sont impliqués dans le développement du cancer. Variante du groupe de gènes HOXB associée à des défauts d'occlusion nécessitant un traitement orthodontique à l'âge de 31 ans.Translated Description (Spanish)
El desarrollo dental es un proceso altamente hereditario que se relaciona con otros procesos de crecimiento y desarrollo, y que interactúa con el desarrollo de todo el complejo craneofacial. Las anomalías del desarrollo dental son comunes, siendo la agenesia dental la anomalía de desarrollo más común en los seres humanos. Realizamos un estudio de asociación de todo el genoma del tiempo hasta la erupción del primer diente y el número de dientes al año en 4.564 individuos de la Cohorte de Nacimiento del Norte de Finlandia de 1966 (NFBC1966) y 1.518 individuos del Estudio Longitudinal de Padres e Hijos de Avon (ALSPAC). Identificamos 5 loci en P<5x10(-8), y 5 con asociación sugestiva (P<5x10(-6)). Los loci incluían varios genes relacionados con el desarrollo de los dientes y otros órganos (KCNJ2, EDA, HOXB2, RAD51L1, IGF2BP1, HMGA2, MSRB3). Los genes en cuatro de los loci identificados están implicados en el desarrollo del cáncer. Una variante dentro del grupo de genes HOXB asociada con defectos de oclusión que requieren tratamiento de ortodoncia a los 31 años.Files
journal.pgen.1000856&type=printable.pdf
Files
(256.0 kB)
| Name | Size | Download all |
|---|---|---|
|
md5:dc5d1a3f4c4f6a02363089c8d4636867
|
256.0 kB | Preview Download |
Additional details
Additional titles
- Translated title (Arabic)
- تكشف دراسة الجمعية على مستوى الجينوم عن مواقع متعددة مرتبطة بتطور الأسنان الأولية أثناء الطفولة
- Translated title (French)
- Une étude d'association à l'échelle du génome révèle plusieurs locus associés au développement des dents primaires pendant la petite enfance
- Translated title (Spanish)
- Un estudio de asociación de todo el genoma revela múltiples locus asociados con el desarrollo de los dientes primarios durante la infancia
Identifiers
- Other
- https://openalex.org/W2066305384
- DOI
- 10.1371/journal.pgen.1000856
References
- https://openalex.org/W1970374717
- https://openalex.org/W1974611538
- https://openalex.org/W1980786543
- https://openalex.org/W1980991473
- https://openalex.org/W1995083646
- https://openalex.org/W1998957301
- https://openalex.org/W2000042026
- https://openalex.org/W2008047653
- https://openalex.org/W2008362502
- https://openalex.org/W2020600328
- https://openalex.org/W2031772624
- https://openalex.org/W2040516688
- https://openalex.org/W2046777516
- https://openalex.org/W2053688091
- https://openalex.org/W2063859161
- https://openalex.org/W2071759640
- https://openalex.org/W2078217942
- https://openalex.org/W2078790454
- https://openalex.org/W2089799246
- https://openalex.org/W2097934124
- https://openalex.org/W2103123188
- https://openalex.org/W2104016070
- https://openalex.org/W2110334171
- https://openalex.org/W2124048684
- https://openalex.org/W2148452134
- https://openalex.org/W2154417257
- https://openalex.org/W2166078460
- https://openalex.org/W2169056802